More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0729 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2163  iron-containing alcohol dehydrogenase  75.94 
 
 
427 aa  651    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.854397  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0729  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
428 aa  872    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1823  iron-containing alcohol dehydrogenase  72 
 
 
429 aa  624  1e-177  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472307  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0724  iron-containing alcohol dehydrogenase  69.83 
 
 
418 aa  594  1e-168  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08580  alcohol dehydrogenase, class IV  65.24 
 
 
425 aa  561  1.0000000000000001e-159  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.237673  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2381  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.08 
 
 
428 aa  443  1e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3630  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.54 
 
 
422 aa  434  1e-120  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1420  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.69 
 
 
428 aa  410  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.332757  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2520  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.17 
 
 
452 aa  406  1.0000000000000001e-112  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5811  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.27 
 
 
433 aa  356  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01868  Fe-containing alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04520)  45.15 
 
 
494 aa  350  4e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2344  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.87 
 
 
435 aa  327  3e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0239649 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1025  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.24 
 
 
435 aa  322  7e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01850  alcohol dehydrogenase, putative  40.76 
 
 
519 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0520343  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19659  iron-containing dehydrogenase  39.95 
 
 
465 aa  297  3e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0467483  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2720  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.03 
 
 
437 aa  247  3e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0537  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.27 
 
 
410 aa  235  1.0000000000000001e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2681  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.68 
 
 
405 aa  200  5e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1584  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.34 
 
 
383 aa  196  7e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140068  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1409  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.15 
 
 
393 aa  194  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802441  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2961  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.69 
 
 
388 aa  194  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.813406  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1196  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.89 
 
 
387 aa  193  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2802  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.07 
 
 
395 aa  193  6e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 
387 aa  190  4e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0242  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.75 
 
 
387 aa  188  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1495  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.09 
 
 
393 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102085  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0779  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.13 
 
 
392 aa  187  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.17 
 
 
383 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0990  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.53 
 
 
386 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.71484 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2398  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.73 
 
 
391 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2001  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.12 
 
 
387 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2277  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.91 
 
 
388 aa  184  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2005  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.38 
 
 
400 aa  184  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000571381  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0514  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.14 
 
 
387 aa  184  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0174269  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  30.64 
 
 
388 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.05 
 
 
393 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2234  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.53 
 
 
382 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10038 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1833  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.64 
 
 
382 aa  183  6e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.453404  normal  0.863481 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1643  iron-containing alcohol dehydrogenase  33 
 
 
382 aa  182  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.768849  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1986  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.29 
 
 
382 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00437  Iron-containing alcohol dehydrogenase  31.51 
 
 
382 aa  181  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000107236  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1046  Iron-containing alcohol dehydrogenase  30.17 
 
 
387 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0545646  hitchhiker  0.000000369007 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  29.98 
 
 
381 aa  181  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  31.87 
 
 
382 aa  180  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0257  alcohol dehydrogenase, class IV  29.43 
 
 
383 aa  180  4e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2848  alcohol dehydrogenase, class IV  30.17 
 
 
389 aa  180  4.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1053  Iron-containing alcohol dehydrogenase  29.36 
 
 
382 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000489581 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1990  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.6 
 
 
390 aa  180  4.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352675  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2420  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.48 
 
 
387 aa  180  5.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  28.26 
 
 
382 aa  179  8e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
395 aa  179  9e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.6 
 
 
390 aa  179  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.41 
 
 
387 aa  178  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2047  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.91 
 
 
400 aa  178  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0159898  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0826  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.45 
 
 
392 aa  178  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2066  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29.84 
 
 
400 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.904837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2006  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.84 
 
 
400 aa  177  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.857021  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2222  alcohol dehydrogenase  29.84 
 
 
392 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2250  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29.84 
 
 
400 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32939e-26 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.13 
 
 
382 aa  177  3e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2334  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29.84 
 
 
400 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0717342  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.17 
 
 
387 aa  177  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1180  1,3-propanediol dehydrogenase  30.05 
 
 
385 aa  177  4e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.440796  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.99 
 
 
382 aa  177  4e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.24 
 
 
382 aa  176  5e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2578  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.73 
 
 
382 aa  176  9e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0321  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.28 
 
 
393 aa  176  9e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.529761 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.83 
 
 
384 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  28.26 
 
 
382 aa  176  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1311  Iron-containing alcohol dehydrogenase  30.1 
 
 
382 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0251  alcohol dehydrogenase, class IV  29.08 
 
 
390 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2097  EutG protein  30.88 
 
 
415 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2042  EutG protein  30.88 
 
 
415 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.17622  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1011  1,3-propanediol dehydrogenase  29.81 
 
 
385 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000128902  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1258  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.98 
 
 
382 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0767  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.83 
 
 
406 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.56 
 
 
387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3532  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.74 
 
 
388 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2237  EutG protein  30.88 
 
 
490 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.113437  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  29.73 
 
 
382 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2252  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29.03 
 
 
400 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.366861  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.26 
 
 
384 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2865  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.01 
 
 
402 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.452469  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  28.06 
 
 
382 aa  174  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1628  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.36 
 
 
398 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.197511  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2335  alcohol dehydrogenase, iron-containing  30.96 
 
 
637 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.359123  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3121  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29.3 
 
 
400 aa  172  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000481233 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  27.82 
 
 
382 aa  172  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1359  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.51 
 
 
382 aa  172  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.759734  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0466  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.9 
 
 
384 aa  172  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2276  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.07 
 
 
388 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.751184  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.99 
 
 
382 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.99 
 
 
382 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5260  alcohol dehydrogenase  32.6 
 
 
399 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.926776 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2204  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29.3 
 
 
400 aa  171  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.88 
 
 
382 aa  171  3e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2506  alcohol dehydrogenase, class IV  34.06 
 
 
387 aa  170  4e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.75007e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0394  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.31 
 
 
389 aa  170  5e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.394023  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3987  Iron-containing alcohol dehydrogenase  28.71 
 
 
382 aa  170  5e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2082  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.3 
 
 
388 aa  170  5e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.769914 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>