More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0394 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0394  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 389 aa  805    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.394023  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0836  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.56 
 
 		 387 aa  252  7e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0813  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.3 
 
 		 387 aa  251  1e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.112525  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2802  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.63 
 
 		 395 aa  238  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1628  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.94 
 
 		 398 aa  224  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.197511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2005  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.88 
 
 		 400 aa  216  4e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000571381  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2334  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.88 
 
 		 400 aa  216  5e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0717342  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1315  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.43 
 
 		 393 aa  216  5e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00399171 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4732  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 399 aa  215  9.999999999999999e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.942125  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.75 
 
 		 395 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2066  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.87 
 
 		 400 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.904837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2006  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.87 
 
 		 400 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.857021  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2250  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.87 
 
 		 400 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32939e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2222  alcohol dehydrogenase  35.57 
 
 		 392 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2510  1,3-propanediol dehydrogenase  34.74 
 
 		 383 aa  212  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.4448e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3240  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.46 
 
 		 384 aa  211  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.39 
 
 		 382 aa  211  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  35 
 
 		 387 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2252  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.63 
 
 		 400 aa  210  3e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.366861  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0435  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.99 
 
 		 384 aa  210  4e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.76 
 
 		 390 aa  207  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.9 
 
 		 387 aa  207  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1833  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.45 
 
 		 382 aa  206  4e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.453404  normal  0.863481 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.64 
 
 		 387 aa  206  7e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2204  alcohol dehydrogenase, iron-containing  36.48 
 
 		 400 aa  206  7e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1552  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.66 
 
 		 391 aa  206  7e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  36.13 
 
 		 382 aa  205  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1632  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.96 
 
 		 383 aa  204  1e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3121  alcohol dehydrogenase, iron-containing  36.22 
 
 		 400 aa  204  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000481233 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4160  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.71 
 
 		 383 aa  204  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1990  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.99 
 
 		 390 aa  203  4e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352675  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0514  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.25 
 
 		 387 aa  202  5e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0174269  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.07 
 
 		 384 aa  202  6e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4231  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.16 
 
 		 383 aa  202  7e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.995734  hitchhiker  0.000246581 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2277  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.42 
 
 		 388 aa  202  7e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  34.21 
 
 		 388 aa  202  8e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.68 
 
 		 383 aa  202  8e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4258  lactaldehyde reductase  36.1 
 
 		 382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  33.51 
 
 		 381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4439  lactaldehyde reductase  35.68 
 
 		 382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4074  lactaldehyde reductase  35.49 
 
 		 382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4373  lactaldehyde reductase  35.68 
 
 		 382 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2211  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.99 
 
 		 385 aa  201  3e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0883961  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4287  lactaldehyde reductase  35.68 
 
 		 382 aa  200  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3062  alcohol dehydrogenase, iron-containing  32.24 
 
 		 392 aa  199  5e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1851  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.07 
 
 		 383 aa  199  5e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2047  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.68 
 
 		 400 aa  199  6e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0159898  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2244  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.23 
 
 		 395 aa  199  7e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3881  putative alcohol dehydrogenase  32.37 
 
 		 383 aa  199  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.656284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.22 
 
 		 389 aa  199  9e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  32.98 
 
 		 382 aa  199  9e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4327  lactaldehyde reductase  35.84 
 
 		 382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.238519 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2420  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.03 
 
 		 387 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  32.98 
 
 		 382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1196  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.65 
 
 		 387 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  34.22 
 
 		 382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2578  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.73 
 
 		 382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3921  iron-containing alcohol dehydrogenase  34 
 
 		 389 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.32 
 
 		 382 aa  197  3e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  33.16 
 
 		 382 aa  197  3e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0164  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.36 
 
 		 383 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2001  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.12 
 
 		 387 aa  196  6e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0441  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.94 
 
 		 399 aa  196  7e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0480  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.6 
 
 		 397 aa  195  9e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121131 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3439  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.1 
 
 		 383 aa  195  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.928685  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1911  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.59 
 
 		 386 aa  194  2e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0885736 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2506  alcohol dehydrogenase, class IV  33.85 
 
 		 387 aa  194  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.75007e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1046  Iron-containing alcohol dehydrogenase  33.42 
 
 		 387 aa  194  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0545646  hitchhiker  0.000000369007 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1477  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.37 
 
 		 402 aa  194  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.743318  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.55 
 
 		 393 aa  194  2e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0588  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.06 
 
 		 368 aa  193  5e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.35 
 
 		 382 aa  192  6e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3917  putative alcohol dehydrogenase  32.8 
 
 		 383 aa  192  8e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.77 
 
 		 387 aa  192  8e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  31.5 
 
 		 382 aa  192  9e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.68 
 
 		 382 aa  192  9e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0119  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.28 
 
 		 383 aa  191  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.82 
 
 		 382 aa  191  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.020336  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2234  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.19 
 
 		 382 aa  191  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10038 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4004  putative alcohol dehydrogenase  32.28 
 
 		 383 aa  191  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1152  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.77 
 
 		 382 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.305094  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03444  predicted Fe-containing alcohol dehydrogenase  32.02 
 
 		 383 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0053  alcohol dehydrogenase, iron-containing  31.97 
 
 		 380 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_53  alcohol dehydrogenase, iron-containing  32.24 
 
 		 380 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000348824  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4960  putative alcohol dehydrogenase  32.02 
 
 		 383 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2470  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.84 
 
 		 392 aa  191  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.5015 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4087  putative alcohol dehydrogenase  32.02 
 
 		 383 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0242  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.59 
 
 		 387 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1011  1,3-propanediol dehydrogenase  32.9 
 
 		 385 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000128902  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0124  putative alcohol dehydrogenase  32.02 
 
 		 383 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03395  hypothetical protein  32.02 
 
 		 383 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3794  putative alcohol dehydrogenase  32.02 
 
 		 383 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0080  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.33 
 
 		 384 aa  190  5e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1180  1,3-propanediol dehydrogenase  32.64 
 
 		 385 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.440796  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0101  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.69 
 
 		 389 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0640895  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02110  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  30.83 
 
 		 887 aa  189  7e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0627  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  32.37 
 
 		 872 aa  188  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4285  alcohol dehydrogenase II  32.63 
 
 		 382 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3523  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.69 
 
 		 393 aa  187  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1481  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.15 
 
 		 382 aa  187  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>