More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2520 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2520  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
452 aa  902    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3630  iron-containing alcohol dehydrogenase  70.17 
 
 
422 aa  577  1.0000000000000001e-163  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2381  iron-containing alcohol dehydrogenase  62.2 
 
 
428 aa  546  1e-154  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1420  iron-containing alcohol dehydrogenase  65.31 
 
 
428 aa  546  1e-154  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.332757  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0729  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.17 
 
 
428 aa  421  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08580  alcohol dehydrogenase, class IV  50.95 
 
 
425 aa  418  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.237673  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2163  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.91 
 
 
427 aa  394  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.854397  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0724  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.67 
 
 
418 aa  377  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1823  iron-containing alcohol dehydrogenase  49.76 
 
 
429 aa  373  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472307  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5811  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.32 
 
 
433 aa  373  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1025  iron-containing alcohol dehydrogenase  49.28 
 
 
435 aa  360  2e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01868  Fe-containing alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04520)  43.57 
 
 
494 aa  355  5.999999999999999e-97  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2344  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.55 
 
 
435 aa  347  2e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0239649 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19659  iron-containing dehydrogenase  43.14 
 
 
465 aa  317  2e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0467483  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01850  alcohol dehydrogenase, putative  39.95 
 
 
519 aa  278  2e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0520343  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2720  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.96 
 
 
437 aa  224  2e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0537  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.96 
 
 
410 aa  224  2e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1628  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 
398 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.197511  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2334  alcohol dehydrogenase, iron-containing  28.57 
 
 
400 aa  179  7e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0717342  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2681  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.38 
 
 
405 aa  179  8e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2066  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29.35 
 
 
400 aa  179  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.904837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2006  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.35 
 
 
400 aa  179  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.857021  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2250  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29.35 
 
 
400 aa  179  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32939e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2222  alcohol dehydrogenase  29.35 
 
 
392 aa  179  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0242  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.71 
 
 
418 aa  179  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.31132  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2005  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.06 
 
 
400 aa  177  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000571381  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1584  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.31 
 
 
383 aa  177  4e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140068  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1833  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.05 
 
 
382 aa  176  7e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.453404  normal  0.863481 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2252  alcohol dehydrogenase, iron-containing  28.81 
 
 
400 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.366861  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1786  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.89 
 
 
388 aa  175  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2082  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.5 
 
 
388 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4452  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.59 
 
 
379 aa  169  9e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0105  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
408 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.535582  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1495  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.7 
 
 
393 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102085  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0826  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
392 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2047  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.26 
 
 
400 aa  167  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0159898  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5260  alcohol dehydrogenase  33.99 
 
 
399 aa  167  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.926776 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0779  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.89 
 
 
392 aa  166  8e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.84 
 
 
387 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2802  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.52 
 
 
395 aa  164  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1986  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.68 
 
 
382 aa  164  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3326  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.65 
 
 
418 aa  163  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.335105  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2506  alcohol dehydrogenase, class IV  32.35 
 
 
387 aa  161  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.75007e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3121  alcohol dehydrogenase, iron-containing  28.99 
 
 
400 aa  160  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000481233 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2054  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.41 
 
 
391 aa  160  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000013313  hitchhiker  0.0000000115511 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00437  Iron-containing alcohol dehydrogenase  32.51 
 
 
382 aa  160  4e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000107236  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.85 
 
 
395 aa  160  5e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2204  alcohol dehydrogenase, iron-containing  28.99 
 
 
400 aa  160  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1643  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.62 
 
 
382 aa  160  6e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.768849  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0813  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.43 
 
 
387 aa  159  7e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.112525  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2234  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.64 
 
 
382 aa  158  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10038 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0836  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.19 
 
 
387 aa  158  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.21 
 
 
384 aa  157  3e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7023  hypothetical protein  32.37 
 
 
392 aa  157  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175699  normal  0.696509 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.86 
 
 
389 aa  157  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  31.13 
 
 
388 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1409  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.41 
 
 
393 aa  156  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802441  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0767  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.41 
 
 
406 aa  156  6e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4998  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.05 
 
 
409 aa  156  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339294  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0514  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.99 
 
 
387 aa  156  8e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0174269  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  32.26 
 
 
383 aa  156  8e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1053  Iron-containing alcohol dehydrogenase  30.02 
 
 
382 aa  155  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000489581 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2276  iron-containing alcohol dehydrogenase  28 
 
 
388 aa  155  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.751184  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.37 
 
 
390 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3787  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.77 
 
 
387 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.797659  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4348  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.39 
 
 
385 aa  154  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.159902  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0174  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.87 
 
 
387 aa  154  4e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249342  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0242  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.31 
 
 
387 aa  153  5.9999999999999996e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1196  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.68 
 
 
387 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2398  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.18 
 
 
391 aa  152  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  31.75 
 
 
382 aa  151  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  26.78 
 
 
382 aa  152  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  26.78 
 
 
382 aa  152  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3750  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.71 
 
 
388 aa  151  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2470  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.96 
 
 
392 aa  150  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.5015 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0441  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.11 
 
 
399 aa  150  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2389  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.73 
 
 
382 aa  150  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00204044  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3532  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.03 
 
 
388 aa  150  6e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2525  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.24 
 
 
390 aa  149  9e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13900  Iron-containing alcohol dehydrogenase  32.51 
 
 
386 aa  149  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00279166  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.29 
 
 
383 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1990  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.71 
 
 
390 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352675  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  28.19 
 
 
382 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0143  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.74 
 
 
387 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00576851  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0394  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.6 
 
 
389 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.394023  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1164  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29.58 
 
 
388 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1336  1,3-propanediol dehydrogenase  27.56 
 
 
390 aa  148  2.0000000000000003e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6773  Iron-containing alcohol dehydrogenase  33.16 
 
 
388 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2726  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.26 
 
 
385 aa  147  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.76 
 
 
384 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1006  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.95 
 
 
377 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02267  alcohol dehydrogenase, iron-containing  30.15 
 
 
386 aa  147  5e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2848  alcohol dehydrogenase, class IV  28.71 
 
 
389 aa  147  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1159  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.56 
 
 
377 aa  147  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.314153  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0415  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.32 
 
 
385 aa  147  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00838464  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  28.43 
 
 
382 aa  146  6e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2961  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.94 
 
 
388 aa  146  6e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.813406  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.12 
 
 
397 aa  147  6e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0115621 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1311  Iron-containing alcohol dehydrogenase  30.84 
 
 
382 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3877  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.22 
 
 
386 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>