More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_08580 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_08580  alcohol dehydrogenase, class IV  100 
 
 		 425 aa  862    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.237673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0729  iron-containing alcohol dehydrogenase  65.24 
 
 		 428 aa  561  1.0000000000000001e-159  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2163  iron-containing alcohol dehydrogenase  64.76 
 
 		 427 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.854397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1823  iron-containing alcohol dehydrogenase  62.86 
 
 		 429 aa  523  1e-147  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472307  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0724  iron-containing alcohol dehydrogenase  61.37 
 
 		 418 aa  511  1e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2381  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.44 
 
 		 428 aa  462  1e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3630  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.68 
 
 		 422 aa  445  1.0000000000000001e-124  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2520  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.95 
 
 		 452 aa  402  1e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1420  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.33 
 
 		 428 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.332757  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5811  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.1 
 
 		 433 aa  369  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1025  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.46 
 
 		 435 aa  350  3e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2344  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.73 
 
 		 435 aa  345  1e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0239649 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01868  Fe-containing alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04520)  43.6 
 
 		 494 aa  337  2.9999999999999997e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19659  iron-containing dehydrogenase  40.66 
 
 		 465 aa  313  4.999999999999999e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0467483  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01850  alcohol dehydrogenase, putative  40.27 
 
 		 519 aa  300  4e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0520343  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0537  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.56 
 
 		 410 aa  249  7e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2720  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.57 
 
 		 437 aa  249  7e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2681  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.57 
 
 		 405 aa  210  4e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2802  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.78 
 
 		 395 aa  205  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1495  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.25 
 
 		 393 aa  203  4e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102085  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0779  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.9 
 
 		 392 aa  202  6e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2398  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.69 
 
 		 391 aa  202  8e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1643  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.9 
 
 		 382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.768849  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3692  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.35 
 
 		 387 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1409  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.48 
 
 		 393 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802441  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2049  alcohol dehydrogenase, iron-containing  38.35 
 
 		 387 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0117689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1584  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.17 
 
 		 383 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140068  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0826  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.93 
 
 		 392 aa  197  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1196  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.92 
 
 		 387 aa  194  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.58 
 
 		 393 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1833  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.72 
 
 		 382 aa  189  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.453404  normal  0.863481 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4452  iron-containing alcohol dehydrogenase  33 
 
 		 379 aa  188  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.93 
 
 		 387 aa  187  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5260  alcohol dehydrogenase  34.73 
 
 		 399 aa  186  7e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.926776 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2836  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.9 
 
 		 380 aa  186  7e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  33 
 
 		 388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0514  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.67 
 
 		 387 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0174269  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1786  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5929  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  39.12 
 
 		 387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.293449  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68500  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  39.6 
 
 		 387 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.354692 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3147  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.95 
 
 		 387 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7023  hypothetical protein  35.56 
 
 		 392 aa  184  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175699  normal  0.696509 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2005  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.18 
 
 		 400 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000571381  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3348  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.9 
 
 		 386 aa  182  7e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.478769 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2082  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.95 
 
 		 388 aa  182  7e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2001  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.2 
 
 		 387 aa  182  7e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0825  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.12 
 
 		 393 aa  182  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.313783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3326  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.87 
 
 		 393 aa  182  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.744277  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0321  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.47 
 
 		 393 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.529761 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2470  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.23 
 
 		 392 aa  181  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.5015 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.43 
 
 		 397 aa  181  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0115621 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.4 
 
 		 395 aa  181  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2334  alcohol dehydrogenase, iron-containing  30.75 
 
 		 400 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0717342  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1164  alcohol dehydrogenase, iron-containing  30.05 
 
 		 388 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.64 
 
 		 387 aa  180  4e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3523  alcohol dehydrogenase, iron-containing  32.6 
 
 		 393 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  33.9 
 
 		 382 aa  179  7e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2066  alcohol dehydrogenase, iron-containing  30.48 
 
 		 400 aa  179  9e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.904837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2006  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.48 
 
 		 400 aa  179  9e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.857021  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00437  Iron-containing alcohol dehydrogenase  32.6 
 
 		 382 aa  179  9e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000107236  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2250  alcohol dehydrogenase, iron-containing  30.48 
 
 		 400 aa  179  9e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32939e-26 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1053  Iron-containing alcohol dehydrogenase  31.13 
 
 		 382 aa  179  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489581 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2222  alcohol dehydrogenase  30.65 
 
 		 392 aa  179  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0425  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.68 
 
 		 386 aa  179  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.51 
 
 		 390 aa  179  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.71 
 
 		 384 aa  177  2e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2252  alcohol dehydrogenase, iron-containing  30.11 
 
 		 400 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.366861  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2848  alcohol dehydrogenase, class IV  30.15 
 
 		 389 aa  178  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2047  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.5 
 
 		 400 aa  178  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0159898  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0887  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.37 
 
 		 387 aa  177  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000472566  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  30.85 
 
 		 382 aa  177  4e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1990  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.26 
 
 		 390 aa  176  7e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352675  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  31.05 
 
 		 382 aa  176  7e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0242  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.95 
 
 		 387 aa  176  7e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6773  Iron-containing alcohol dehydrogenase  34.77 
 
 		 388 aa  176  8e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0251  alcohol dehydrogenase, class IV  33.42 
 
 		 390 aa  176  9e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0257  alcohol dehydrogenase, class IV  31.28 
 
 		 383 aa  176  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1594  alcohol dehydrogenase, class IV  33.42 
 
 		 390 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  30.96 
 
 		 382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1943  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.25 
 
 		 399 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2961  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.04 
 
 		 388 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.813406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0554  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.37 
 
 		 387 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3121  alcohol dehydrogenase, iron-containing  31.79 
 
 		 400 aa  173  5e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000481233 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1756  iron-containing alcohol dehydrogenase  33 
 
 		 377 aa  173  5e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0953887  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1628  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.45 
 
 		 398 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.197511  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2655  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  33.01 
 
 		 382 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2234  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.9 
 
 		 382 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10038 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0415  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.33 
 
 		 385 aa  172  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00838464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4943  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  34.29 
 
 		 385 aa  172  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375402  normal  0.972058 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2204  alcohol dehydrogenase, iron-containing  31.25 
 
 		 400 aa  172  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.9 
 
 		 387 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0853  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.3 
 
 		 387 aa  171  2e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.346156 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0255  alcohol dehydrogenase, class IV  33.16 
 
 		 390 aa  171  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2420  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.81 
 
 		 387 aa  171  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.66 
 
 		 387 aa  170  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1311  Iron-containing alcohol dehydrogenase  30.77 
 
 		 382 aa  170  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1261  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.98 
 
 		 381 aa  170  5e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.528177  normal  0.0459015 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0907  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.55 
 
 		 387 aa  169  6e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2077  Iron-containing alcohol dehydrogenase  33.92 
 
 		 385 aa  169  7e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0974208  normal  0.438292 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2277  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.62 
 
 		 388 aa  169  9e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>