More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1771 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1771  NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase oxidoreductase protein  100 
 
 		 382 aa  766    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.705877 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1435  Alcohol dehydrogenase  92.15 
 
 		 382 aa  715    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0578775 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1418  Iron-containing alcohol dehydrogenase  82.72 
 
 		 382 aa  653    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.909336  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1476  Alcohol dehydrogenase  92.67 
 
 		 382 aa  696    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.178772  normal  0.0760523 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1316  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  81.41 
 
 		 382 aa  634    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1668  NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase  80.89 
 
 		 382 aa  624  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0905  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  80.89 
 
 		 382 aa  624  1e-178  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.631296  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1823  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  80.89 
 
 		 382 aa  624  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0717  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  80.89 
 
 		 382 aa  624  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1435  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  80.89 
 
 		 382 aa  624  1e-178  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0445  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  80.89 
 
 		 382 aa  624  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1646  putative NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase  80.63 
 
 		 382 aa  624  1e-177  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627044  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1609  alcohol dehydrogenase  79.06 
 
 		 382 aa  619  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2655  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  79.84 
 
 		 382 aa  617  1e-176  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0986  putative NAD-dependent 4-hyddoxybutyrate dehydrogenase oxidoreductase protein  73.04 
 
 		 382 aa  574  1.0000000000000001e-163  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.222848 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3418  iron-containing alcohol dehydrogenase  71.47 
 
 		 378 aa  543  1e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2526  iron-containing alcohol dehydrogenase  69.9 
 
 		 378 aa  539  9.999999999999999e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00912528 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2864  iron-containing alcohol dehydrogenase  69.37 
 
 		 378 aa  536  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1943  iron-containing alcohol dehydrogenase  68.59 
 
 		 378 aa  521  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.612033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1711  iron-containing alcohol dehydrogenase  70.68 
 
 		 378 aa  517  1.0000000000000001e-145  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.226626  normal  0.372623 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1993  iron-containing alcohol dehydrogenase  70.42 
 
 		 378 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1798  putative NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase oxidoreductase protein  70.94 
 
 		 378 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3383  iron-containing alcohol dehydrogenase  67.8 
 
 		 378 aa  512  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469103  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3155  iron-containing alcohol dehydrogenase  60.36 
 
 		 380 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2157  iron-containing alcohol dehydrogenase  61.2 
 
 		 380 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2650  iron-containing alcohol dehydrogenase  60.68 
 
 		 380 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6426  Iron-containing alcohol dehydrogenase  62.83 
 
 		 376 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1756  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.19 
 
 		 377 aa  393  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0953887  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6101  dehydrogenase  49.34 
 
 		 370 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0063  iron-containing alcohol dehydrogenase  53 
 
 		 379 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4502  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.72 
 
 		 378 aa  350  3e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.49519  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3465  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.05 
 
 		 377 aa  349  5e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.117346  normal  0.139258 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2128  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.54 
 
 		 381 aa  261  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.705476  normal  0.429829 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2781  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.64 
 
 		 398 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2631  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.52 
 
 		 383 aa  253  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4549  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.09 
 
 		 381 aa  250  3e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1868  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.12 
 
 		 381 aa  249  6e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.50517  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2945  dehydrogenase  38.34 
 
 		 381 aa  246  4.9999999999999997e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2470  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.92 
 
 		 392 aa  246  4.9999999999999997e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.5015 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0681  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.08 
 
 		 381 aa  245  9.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0991  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.53 
 
 		 381 aa  243  6e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2317  Iron-containing alcohol dehydrogenase  39.01 
 
 		 381 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.735115  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0678  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.73 
 
 		 389 aa  233  6e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2176  hypothetical protein  35.25 
 
 		 386 aa  232  8.000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2891  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.86 
 
 		 383 aa  232  9e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339449  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2204  hypothetical protein  35.25 
 
 		 386 aa  232  1e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.84 
 
 		 389 aa  224  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1612  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.86 
 
 		 381 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2792  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.62 
 
 		 392 aa  219  6e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413135  normal  0.203588 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1786  iron-containing alcohol dehydrogenase  40 
 
 		 388 aa  219  7e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0109  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.68 
 
 		 378 aa  217  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2082  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.43 
 
 		 388 aa  217  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2742  Iron-containing alcohol dehydrogenase  35.17 
 
 		 384 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0794554  normal  0.0588178 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0687  alcohol dehydrogenase, iron-containing  37.98 
 
 		 389 aa  213  5.999999999999999e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.377875  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4700  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.06 
 
 		 377 aa  213  5.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2530  alcohol dehydrogenase  33.68 
 
 		 388 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.840072  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0734  alcohol dehydrogenase, iron-containing  37.73 
 
 		 389 aa  211  2e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.434692  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.27 
 
 		 387 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2430  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.31 
 
 		 384 aa  210  4e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.81 
 
 		 387 aa  209  7e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1046  Iron-containing alcohol dehydrogenase  35.46 
 
 		 387 aa  208  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0545646  hitchhiker  0.000000369007 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.27 
 
 		 387 aa  207  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2290  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.35 
 
 		 394 aa  207  3e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000188362  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0257  alcohol dehydrogenase, class IV  35.23 
 
 		 383 aa  206  4e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4074  lactaldehyde reductase  35.2 
 
 		 382 aa  205  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2103  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.68 
 
 		 388 aa  203  5e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0158602  normal  0.562089 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.74 
 
 		 384 aa  203  5e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  35.94 
 
 		 388 aa  202  6e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1261  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.47 
 
 		 381 aa  202  7e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.528177  normal  0.0459015 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2957  methanol dehydrogenase, NAD-dependent  35.86 
 
 		 384 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0476972  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1868  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.27 
 
 		 394 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1477  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.94 
 
 		 402 aa  201  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.743318  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1986  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.27 
 
 		 382 aa  200  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4348  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.3 
 
 		 385 aa  200  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.159902  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.11 
 
 		 393 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2848  alcohol dehydrogenase, class IV  34.44 
 
 		 389 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4231  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.19 
 
 		 383 aa  199  6e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.995734  hitchhiker  0.000246581 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3883  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.73 
 
 		 390 aa  199  9e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5983  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0887  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.5 
 
 		 387 aa  199  9e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000472566  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2420  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.18 
 
 		 387 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  34.55 
 
 		 382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1164  alcohol dehydrogenase, iron-containing  35.57 
 
 		 388 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2961  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.68 
 
 		 388 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.813406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.16 
 
 		 382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0767  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.9 
 
 		 406 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  33.16 
 
 		 382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0554  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.76 
 
 		 387 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1053  Iron-containing alcohol dehydrogenase  34.2 
 
 		 382 aa  197  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489581 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  34.69 
 
 		 381 aa  197  3e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2001  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.53 
 
 		 387 aa  197  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1196  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.3 
 
 		 387 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.48 
 
 		 387 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  33.59 
 
 		 382 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  32.41 
 
 		 382 aa  196  7e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4258  lactaldehyde reductase  33.84 
 
 		 382 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4373  lactaldehyde reductase  33.84 
 
 		 382 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4287  lactaldehyde reductase  33.84 
 
 		 382 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4439  lactaldehyde reductase  33.84 
 
 		 382 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2836  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.2 
 
 		 380 aa  194  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  33.84 
 
 		 382 aa  194  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>