More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1993 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3418  iron-containing alcohol dehydrogenase  87.83 
 
 		 378 aa  674    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1993  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 378 aa  768    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2526  iron-containing alcohol dehydrogenase  85.45 
 
 		 378 aa  659    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00912528 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3383  iron-containing alcohol dehydrogenase  83.33 
 
 		 378 aa  636    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469103  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1711  iron-containing alcohol dehydrogenase  99.21 
 
 		 378 aa  766    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.226626  normal  0.372623 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1943  iron-containing alcohol dehydrogenase  82.28 
 
 		 378 aa  627  1e-178  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.612033  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2864  iron-containing alcohol dehydrogenase  79.37 
 
 		 378 aa  621  1e-177  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1798  putative NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase oxidoreductase protein  78.04 
 
 		 378 aa  578  1e-164  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1418  Iron-containing alcohol dehydrogenase  73.82 
 
 		 382 aa  561  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.909336  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2655  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  72.51 
 
 		 382 aa  544  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1316  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  70.68 
 
 		 382 aa  545  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1609  alcohol dehydrogenase  70.94 
 
 		 382 aa  544  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0445  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  71.99 
 
 		 382 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1646  putative NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase  71.73 
 
 		 382 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627044  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0905  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  71.99 
 
 		 382 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.631296  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1823  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  71.99 
 
 		 382 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0717  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  71.99 
 
 		 382 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1668  NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase  71.99 
 
 		 382 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1435  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  71.99 
 
 		 382 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1435  Alcohol dehydrogenase  69.11 
 
 		 382 aa  536  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0578775 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1476  Alcohol dehydrogenase  69.11 
 
 		 382 aa  532  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.178772  normal  0.0760523 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1771  NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase oxidoreductase protein  70.42 
 
 		 382 aa  518  1e-146  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.705877 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0986  putative NAD-dependent 4-hyddoxybutyrate dehydrogenase oxidoreductase protein  66.49 
 
 		 382 aa  508  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.222848 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3155  iron-containing alcohol dehydrogenase  64.74 
 
 		 380 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2157  iron-containing alcohol dehydrogenase  64.47 
 
 		 380 aa  498  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2650  iron-containing alcohol dehydrogenase  64.21 
 
 		 380 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6426  Iron-containing alcohol dehydrogenase  59.37 
 
 		 376 aa  434  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1756  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.72 
 
 		 377 aa  379  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0953887  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6101  dehydrogenase  51.31 
 
 		 370 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0063  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.63 
 
 		 379 aa  355  5e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3465  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.42 
 
 		 377 aa  352  5e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.117346  normal  0.139258 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4502  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.81 
 
 		 378 aa  323  2e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.49519  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2781  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.84 
 
 		 398 aa  249  7e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409479  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2204  hypothetical protein  39.11 
 
 		 386 aa  246  4.9999999999999997e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2128  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.99 
 
 		 381 aa  243  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.705476  normal  0.429829 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2176  hypothetical protein  38.85 
 
 		 386 aa  243  3.9999999999999997e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2631  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.13 
 
 		 383 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0681  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.93 
 
 		 381 aa  240  2e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2470  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.67 
 
 		 392 aa  238  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.5015 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2317  Iron-containing alcohol dehydrogenase  38.73 
 
 		 381 aa  236  3e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.735115  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4549  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.8 
 
 		 381 aa  236  4e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0991  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.46 
 
 		 381 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1868  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.47 
 
 		 381 aa  233  6e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.50517  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4700  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.56 
 
 		 377 aa  229  5e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0678  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.12 
 
 		 389 aa  226  4e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2945  dehydrogenase  36.77 
 
 		 381 aa  224  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.34 
 
 		 393 aa  224  3e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2792  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.29 
 
 		 392 aa  222  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413135  normal  0.203588 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1612  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.46 
 
 		 381 aa  220  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2891  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.33 
 
 		 383 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  38.98 
 
 		 381 aa  217  2.9999999999999998e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  36.19 
 
 		 382 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1943  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.44 
 
 		 399 aa  216  4e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  36.19 
 
 		 382 aa  216  4e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.4 
 
 		 387 aa  216  5e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0887  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.15 
 
 		 387 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000472566  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0109  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.77 
 
 		 378 aa  214  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.04 
 
 		 389 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3523  alcohol dehydrogenase, iron-containing  36.27 
 
 		 393 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1196  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.28 
 
 		 387 aa  211  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0825  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.96 
 
 		 393 aa  211  2e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.313783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.37 
 
 		 387 aa  211  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2848  alcohol dehydrogenase, class IV  36.73 
 
 		 389 aa  211  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0687  alcohol dehydrogenase, iron-containing  38.38 
 
 		 389 aa  211  2e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.377875  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.28 
 
 		 387 aa  210  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3883  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.6 
 
 		 390 aa  209  6e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5983  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0734  alcohol dehydrogenase, iron-containing  38.12 
 
 		 389 aa  209  7e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.434692  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0767  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.86 
 
 		 406 aa  209  8e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  37.23 
 
 		 388 aa  208  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4285  alcohol dehydrogenase II  36.43 
 
 		 382 aa  208  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1164  alcohol dehydrogenase, iron-containing  36.03 
 
 		 388 aa  207  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2530  alcohol dehydrogenase  33.59 
 
 		 388 aa  207  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.840072  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0554  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.31 
 
 		 387 aa  206  4e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2082  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.79 
 
 		 388 aa  206  5e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2742  Iron-containing alcohol dehydrogenase  35.81 
 
 		 384 aa  206  7e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0794554  normal  0.0588178 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.54 
 
 		 384 aa  206  7e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2420  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.67 
 
 		 387 aa  206  7e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.61 
 
 		 383 aa  205  9e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1786  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.28 
 
 		 388 aa  205  9e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0321  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.17 
 
 		 393 aa  205  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.529761 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3987  Iron-containing alcohol dehydrogenase  37.43 
 
 		 382 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1481  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.11 
 
 		 382 aa  204  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2001  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.1 
 
 		 387 aa  204  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3326  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.91 
 
 		 393 aa  204  3e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.744277  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1477  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.01 
 
 		 402 aa  204  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.743318  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1046  Iron-containing alcohol dehydrogenase  36.24 
 
 		 387 aa  204  3e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0545646  hitchhiker  0.000000369007 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  34.63 
 
 		 382 aa  203  4e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0164  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.78 
 
 		 383 aa  203  4e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2394  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.09 
 
 		 389 aa  203  4e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.219268  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2103  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.08 
 
 		 388 aa  203  4e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0158602  normal  0.562089 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2510  1,3-propanediol dehydrogenase  36.44 
 
 		 383 aa  203  5e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.4448e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2277  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.7 
 
 		 388 aa  202  6e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.73 
 
 		 383 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2961  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.77 
 
 		 388 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.813406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3439  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.07 
 
 		 383 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.928685  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4231  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.24 
 
 		 383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.995734  hitchhiker  0.000246581 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0990  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.22 
 
 		 386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.71484 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2726  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.32 
 
 		 385 aa  200  3e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3881  putative alcohol dehydrogenase  37.78 
 
 		 383 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.656284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.96 
 
 		 382 aa  199  5e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>