More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_6101 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_6101  dehydrogenase  100 
 
 		 370 aa  748    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6426  Iron-containing alcohol dehydrogenase  59.47 
 
 		 376 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1756  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.94 
 
 		 377 aa  384  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0953887  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1418  Iron-containing alcohol dehydrogenase  50.66 
 
 		 382 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.909336  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1316  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  51.31 
 
 		 382 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2864  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.79 
 
 		 378 aa  375  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1646  putative NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase  51.05 
 
 		 382 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627044  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3383  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.06 
 
 		 378 aa  373  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469103  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1435  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  50.79 
 
 		 382 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0905  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  50.79 
 
 		 382 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.631296  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1823  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  50.79 
 
 		 382 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2655  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  50.92 
 
 		 382 aa  373  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1668  NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase  50.79 
 
 		 382 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1435  Alcohol dehydrogenase  49.08 
 
 		 382 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0578775 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0717  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  50.79 
 
 		 382 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0445  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  50.79 
 
 		 382 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2526  iron-containing alcohol dehydrogenase  50 
 
 		 378 aa  369  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00912528 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1476  Alcohol dehydrogenase  48.82 
 
 		 382 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.178772  normal  0.0760523 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1609  alcohol dehydrogenase  48.56 
 
 		 382 aa  368  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1943  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.98 
 
 		 378 aa  367  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.612033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0063  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.82 
 
 		 379 aa  364  1e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1798  putative NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase oxidoreductase protein  52.12 
 
 		 378 aa  363  2e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3465  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.53 
 
 		 377 aa  363  2e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.117346  normal  0.139258 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3155  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.95 
 
 		 380 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2650  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.95 
 
 		 380 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2157  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.95 
 
 		 380 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3418  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.68 
 
 		 378 aa  361  1e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0986  putative NAD-dependent 4-hyddoxybutyrate dehydrogenase oxidoreductase protein  48.17 
 
 		 382 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.222848 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1711  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.31 
 
 		 378 aa  351  1e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.226626  normal  0.372623 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1993  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.31 
 
 		 378 aa  350  2e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1771  NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase oxidoreductase protein  49.34 
 
 		 382 aa  350  3e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.705877 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4502  iron-containing alcohol dehydrogenase  49.6 
 
 		 378 aa  330  2e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.49519  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2317  Iron-containing alcohol dehydrogenase  41.22 
 
 		 381 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.735115  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0991  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.69 
 
 		 381 aa  259  4e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0681  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.04 
 
 		 381 aa  259  4e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2781  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.14 
 
 		 398 aa  253  3e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2631  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.42 
 
 		 383 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129708  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2176  hypothetical protein  40.27 
 
 		 386 aa  250  3e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2204  hypothetical protein  40.53 
 
 		 386 aa  248  1e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4549  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.83 
 
 		 381 aa  246  4e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2945  dehydrogenase  38.62 
 
 		 381 aa  243  5e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2128  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.56 
 
 		 381 aa  242  6e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.705476  normal  0.429829 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0678  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.63 
 
 		 389 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1612  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.43 
 
 		 381 aa  239  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0687  alcohol dehydrogenase, iron-containing  40.53 
 
 		 389 aa  238  2e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.377875  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1868  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.1 
 
 		 381 aa  236  6e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.50517  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3883  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.26 
 
 		 390 aa  236  7e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5983  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2891  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.99 
 
 		 383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339449  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0734  alcohol dehydrogenase, iron-containing  40 
 
 		 389 aa  233  3e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.434692  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4700  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.97 
 
 		 377 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2470  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.14 
 
 		 392 aa  227  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.5015 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2792  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.4 
 
 		 392 aa  226  5.0000000000000005e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413135  normal  0.203588 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2742  Iron-containing alcohol dehydrogenase  36.87 
 
 		 384 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0794554  normal  0.0588178 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2957  methanol dehydrogenase, NAD-dependent  36.77 
 
 		 384 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0476972  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.33 
 
 		 389 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1943  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.44 
 
 		 399 aa  219  7e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0109  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.27 
 
 		 378 aa  218  8.999999999999998e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  37.91 
 
 		 382 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.02 
 
 		 384 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2103  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.22 
 
 		 388 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0158602  normal  0.562089 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.48 
 
 		 387 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  37.64 
 
 		 382 aa  212  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3523  alcohol dehydrogenase, iron-containing  36.7 
 
 		 393 aa  211  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  37.22 
 
 		 382 aa  208  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  37.88 
 
 		 388 aa  207  3e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2394  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.81 
 
 		 389 aa  207  3e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.219268  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1786  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.7 
 
 		 388 aa  207  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0825  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.17 
 
 		 393 aa  206  5e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.313783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  38.24 
 
 		 383 aa  206  7e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.85 
 
 		 383 aa  205  8e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2234  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.86 
 
 		 382 aa  204  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10038 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0257  alcohol dehydrogenase, class IV  34.28 
 
 		 383 aa  205  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0767  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 406 aa  204  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  36.39 
 
 		 382 aa  204  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0514  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.46 
 
 		 387 aa  204  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0174269  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1986  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.86 
 
 		 382 aa  202  5e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.37 
 
 		 393 aa  202  6e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0321  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.17 
 
 		 393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.529761 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.83 
 
 		 387 aa  199  5e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1196  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.31 
 
 		 387 aa  199  6e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  36.31 
 
 		 381 aa  199  7e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2530  alcohol dehydrogenase  34.29 
 
 		 388 aa  199  7e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.840072  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2082  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.17 
 
 		 388 aa  199  7e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  36.94 
 
 		 382 aa  199  7.999999999999999e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2042  EutG protein  38.27 
 
 		 415 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.17622  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2097  EutG protein  38.27 
 
 		 415 aa  199  9e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2510  1,3-propanediol dehydrogenase  36.66 
 
 		 383 aa  199  9e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.4448e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2276  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.92 
 
 		 388 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.751184  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2237  EutG protein  38.27 
 
 		 490 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.113437  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4063  L-1,2-propanediol oxidoreductase  35.39 
 
 		 383 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2939  L-1,2-propanediol oxidoreductase  35.39 
 
 		 383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.284503  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0889  lactaldehyde reductase  35.39 
 
 		 382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1053  Iron-containing alcohol dehydrogenase  33.6 
 
 		 382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489581 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4348  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.83 
 
 		 385 aa  197  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.159902  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0913  L-1,2-propanediol oxidoreductase  35.39 
 
 		 383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3104  L-1,2-propanediol oxidoreductase  35.39 
 
 		 382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.189679  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3326  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.41 
 
 		 393 aa  197  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.744277  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.03 
 
 		 382 aa  197  3e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2943  L-1,2-propanediol oxidoreductase  35.12 
 
 		 382 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4074  lactaldehyde reductase  35.75 
 
 		 382 aa  196  4.0000000000000005e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>