More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2792 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2792  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 392 aa  805    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413135  normal  0.203588 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1868  iron-containing alcohol dehydrogenase  59.58 
 
 		 381 aa  480  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.50517  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2128  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.53 
 
 		 381 aa  473  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.705476  normal  0.429829 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2631  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.31 
 
 		 383 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0681  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.36 
 
 		 381 aa  461  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0678  iron-containing alcohol dehydrogenase  57.48 
 
 		 389 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2781  iron-containing alcohol dehydrogenase  55.91 
 
 		 398 aa  441  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409479  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2204  hypothetical protein  55.12 
 
 		 386 aa  438  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2891  iron-containing alcohol dehydrogenase  57.74 
 
 		 383 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339449  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2176  hypothetical protein  54.33 
 
 		 386 aa  432  1e-120  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2317  Iron-containing alcohol dehydrogenase  56.23 
 
 		 381 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.735115  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0991  iron-containing alcohol dehydrogenase  56.23 
 
 		 381 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4549  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.07 
 
 		 381 aa  433  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0734  alcohol dehydrogenase, iron-containing  56.96 
 
 		 389 aa  428  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.434692  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3883  iron-containing alcohol dehydrogenase  56.04 
 
 		 390 aa  428  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5983  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0687  alcohol dehydrogenase, iron-containing  57.22 
 
 		 389 aa  429  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.377875  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2945  dehydrogenase  52.67 
 
 		 381 aa  407  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1612  iron-containing alcohol dehydrogenase  55.17 
 
 		 381 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2530  alcohol dehydrogenase  48.45 
 
 		 388 aa  403  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.840072  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2103  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.26 
 
 		 388 aa  403  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0158602  normal  0.562089 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2957  methanol dehydrogenase, NAD-dependent  50.13 
 
 		 384 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0476972  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2742  Iron-containing alcohol dehydrogenase  50.4 
 
 		 384 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0794554  normal  0.0588178 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2394  iron-containing alcohol dehydrogenase  49.61 
 
 		 389 aa  351  1e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.219268  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49580  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.48 
 
 		 393 aa  292  9e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.164623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4700  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.74 
 
 		 377 aa  263  3e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1868  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.1 
 
 		 394 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0109  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.11 
 
 		 378 aa  258  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2470  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.05 
 
 		 392 aa  249  6e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.5015 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3418  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.36 
 
 		 378 aa  229  7e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3155  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.4 
 
 		 380 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6101  dehydrogenase  38.4 
 
 		 370 aa  226  5.0000000000000005e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6426  Iron-containing alcohol dehydrogenase  38.98 
 
 		 376 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2864  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.5 
 
 		 378 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3383  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.53 
 
 		 378 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469103  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1756  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.28 
 
 		 377 aa  224  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0953887  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1435  Alcohol dehydrogenase  36.88 
 
 		 382 aa  223  6e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0578775 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2650  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.33 
 
 		 380 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1609  alcohol dehydrogenase  37.4 
 
 		 382 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1316  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  37.21 
 
 		 382 aa  219  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2526  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.83 
 
 		 378 aa  219  6e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00912528 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1476  Alcohol dehydrogenase  36.62 
 
 		 382 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.178772  normal  0.0760523 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1943  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.42 
 
 		 378 aa  218  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.612033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2655  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  37.92 
 
 		 382 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2157  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.07 
 
 		 380 aa  216  7e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1418  Iron-containing alcohol dehydrogenase  37.11 
 
 		 382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.909336  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1646  putative NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.82 
 
 		 382 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627044  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0445  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  37.82 
 
 		 382 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1435  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  37.82 
 
 		 382 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0905  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  37.82 
 
 		 382 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.631296  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1823  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  37.82 
 
 		 382 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1668  NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.82 
 
 		 382 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0717  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  37.82 
 
 		 382 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 389 aa  211  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.42 
 
 		 384 aa  209  6e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3465  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.74 
 
 		 377 aa  209  6e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.117346  normal  0.139258 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1851  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.14 
 
 		 383 aa  209  6e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  35.94 
 
 		 388 aa  207  4e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 		 382 aa  206  4e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2848  alcohol dehydrogenase, class IV  35.14 
 
 		 389 aa  205  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  34.33 
 
 		 382 aa  204  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0063  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.17 
 
 		 379 aa  203  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.97 
 
 		 383 aa  203  5e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4502  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.81 
 
 		 378 aa  203  5e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.49519  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1798  putative NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase oxidoreductase protein  36.55 
 
 		 378 aa  202  6e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.61 
 
 		 382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2001  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.29 
 
 		 387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  33.51 
 
 		 381 aa  201  3e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.15 
 
 		 382 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1993  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.29 
 
 		 378 aa  199  6e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1771  NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase oxidoreductase protein  36.62 
 
 		 382 aa  199  7e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.705877 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1711  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.29 
 
 		 378 aa  199  7e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.226626  normal  0.372623 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.3 
 
 		 382 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4285  alcohol dehydrogenase II  33.16 
 
 		 382 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.82 
 
 		 382 aa  197  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.65 
 
 		 383 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4594  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.38 
 
 		 384 aa  195  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2578  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.07 
 
 		 382 aa  194  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1481  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.27 
 
 		 382 aa  194  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.3 
 
 		 382 aa  194  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.3 
 
 		 382 aa  194  3e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3987  Iron-containing alcohol dehydrogenase  32.73 
 
 		 382 aa  193  4e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1071  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.15 
 
 		 358 aa  193  4e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0986  putative NAD-dependent 4-hyddoxybutyrate dehydrogenase oxidoreductase protein  34.02 
 
 		 382 aa  192  9e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.222848 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1490  alcohol dehydrogenase II  32.3 
 
 		 382 aa  192  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  31.34 
 
 		 382 aa  192  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1943  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.86 
 
 		 399 aa  192  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  31.34 
 
 		 382 aa  192  1e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  31.88 
 
 		 382 aa  192  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  33.08 
 
 		 382 aa  191  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3881  putative alcohol dehydrogenase  32.99 
 
 		 383 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.656284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.52 
 
 		 382 aa  190  4e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134341 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1359  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.04 
 
 		 382 aa  190  4e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.759734  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1152  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.08 
 
 		 382 aa  190  4e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.305094  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.29 
 
 		 387 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.78 
 
 		 382 aa  189  7e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0142  putative alcohol dehydrogenase  35.26 
 
 		 383 aa  189  7e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.555201  normal  0.893326 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2803  1,3-propanediol dehydrogenase  32.46 
 
 		 394 aa  189  9e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1348  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.52 
 
 		 382 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3758  lactaldehyde reductase  31.5 
 
 		 382 aa  188  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2277  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.16 
 
 		 388 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>