More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_49580 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_49580  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
393 aa  769    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.164623  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0678  iron-containing alcohol dehydrogenase  49.35 
 
 
389 aa  347  3e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2204  hypothetical protein  46.77 
 
 
386 aa  331  1e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2176  hypothetical protein  46.51 
 
 
386 aa  326  5e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2530  alcohol dehydrogenase  43 
 
 
388 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.840072  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2792  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.48 
 
 
392 aa  313  3.9999999999999997e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413135  normal  0.203588 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2103  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.43 
 
 
388 aa  311  1e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0158602  normal  0.562089 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2957  methanol dehydrogenase, NAD-dependent  45.74 
 
 
384 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0476972  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2742  Iron-containing alcohol dehydrogenase  44.7 
 
 
384 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0794554  normal  0.0588178 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2631  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.52 
 
 
383 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129708  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1868  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.01 
 
 
381 aa  296  6e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.50517  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2128  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.73 
 
 
381 aa  296  6e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.705476  normal  0.429829 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2945  dehydrogenase  41.84 
 
 
381 aa  289  6e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2317  Iron-containing alcohol dehydrogenase  45.03 
 
 
381 aa  289  6e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.735115  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0991  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.3 
 
 
381 aa  289  6e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260601  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2891  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.67 
 
 
383 aa  286  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339449  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2781  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.21 
 
 
398 aa  282  7.000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409479  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4549  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.17 
 
 
381 aa  279  7e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0681  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.72 
 
 
381 aa  278  9e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0734  alcohol dehydrogenase, iron-containing  41.9 
 
 
389 aa  276  4e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.434692  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3883  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.28 
 
 
390 aa  276  4e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5983  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0687  alcohol dehydrogenase, iron-containing  42.16 
 
 
389 aa  276  5e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.377875  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1612  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.92 
 
 
381 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2394  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.51 
 
 
389 aa  263  6e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.219268  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0109  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.2 
 
 
378 aa  248  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2470  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.46 
 
 
392 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.5015 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4700  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.28 
 
 
377 aa  241  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1435  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  41.01 
 
 
382 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0905  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  41.01 
 
 
382 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.631296  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1823  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  41.01 
 
 
382 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0717  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  41.01 
 
 
382 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0445  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  41.01 
 
 
382 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1646  putative NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.01 
 
 
382 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627044  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1668  NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.01 
 
 
382 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2655  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  40.51 
 
 
382 aa  223  6e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0986  putative NAD-dependent 4-hyddoxybutyrate dehydrogenase oxidoreductase protein  40.26 
 
 
382 aa  219  5e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.222848 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1609  alcohol dehydrogenase  38.83 
 
 
382 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1868  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.74 
 
 
394 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0063  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.6 
 
 
379 aa  216  5e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3326  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.65 
 
 
393 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.744277  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1316  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  37.88 
 
 
382 aa  216  8e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1435  Alcohol dehydrogenase  38.56 
 
 
382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0578775 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3465  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.71 
 
 
377 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.117346  normal  0.139258 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.67 
 
 
389 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3418  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.73 
 
 
378 aa  211  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1418  Iron-containing alcohol dehydrogenase  38.05 
 
 
382 aa  210  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.909336  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.08 
 
 
384 aa  210  4e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1476  Alcohol dehydrogenase  38.56 
 
 
382 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.178772  normal  0.0760523 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6426  Iron-containing alcohol dehydrogenase  39.43 
 
 
376 aa  207  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1756  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.73 
 
 
377 aa  206  5e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0953887  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0321  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.66 
 
 
393 aa  206  8e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.529761 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.41 
 
 
393 aa  206  8e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2526  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.87 
 
 
378 aa  205  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00912528 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.84 
 
 
382 aa  204  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3523  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.83 
 
 
393 aa  204  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1943  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.5 
 
 
378 aa  203  4e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.612033  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.04 
 
 
383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.08 
 
 
382 aa  200  3e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2864  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.67 
 
 
378 aa  200  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1851  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.63 
 
 
383 aa  199  6e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2803  1,3-propanediol dehydrogenase  34.9 
 
 
394 aa  199  7e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.99 
 
 
387 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0825  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.66 
 
 
393 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.313783  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0627  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  32.61 
 
 
872 aa  197  3e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1798  putative NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase oxidoreductase protein  37.89 
 
 
378 aa  197  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0702  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.62 
 
 
386 aa  197  3e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.149133 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1481  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.5 
 
 
382 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3383  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.95 
 
 
378 aa  196  7e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469103  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1943  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.65 
 
 
399 aa  195  9e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2726  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.01 
 
 
385 aa  195  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1771  NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase oxidoreductase protein  39.85 
 
 
382 aa  194  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.705877 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  34.19 
 
 
388 aa  194  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2001  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.57 
 
 
387 aa  194  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3155  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.72 
 
 
380 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2848  alcohol dehydrogenase, class IV  33.33 
 
 
389 aa  193  4e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0441  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.61 
 
 
399 aa  193  5e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2650  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.76 
 
 
380 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691454  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2157  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.02 
 
 
380 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1180  1,3-propanediol dehydrogenase  31.91 
 
 
385 aa  192  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.440796  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2277  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.42 
 
 
388 aa  192  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  32.48 
 
 
382 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  32.48 
 
 
382 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1011  1,3-propanediol dehydrogenase  31.91 
 
 
385 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000128902  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1046  Iron-containing alcohol dehydrogenase  35.64 
 
 
387 aa  189  5e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0545646  hitchhiker  0.000000369007 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0415  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.72 
 
 
385 aa  189  7e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00838464  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.42 
 
 
387 aa  189  8e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0746  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  35.77 
 
 
867 aa  188  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3848  lactaldehyde reductase  35.23 
 
 
382 aa  188  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.29 
 
 
383 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2495  lactaldehyde reductase  31.43 
 
 
382 aa  189  1e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.73 
 
 
382 aa  189  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4490  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  35.77 
 
 
867 aa  188  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3758  lactaldehyde reductase  35.23 
 
 
382 aa  188  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.74 
 
 
387 aa  188  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0746  lactaldehyde reductase  34.97 
 
 
382 aa  187  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0727941 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  34.02 
 
 
382 aa  187  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13900  Iron-containing alcohol dehydrogenase  36.13 
 
 
386 aa  187  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00279166  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2420  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.43 
 
 
387 aa  187  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0887  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.25 
 
 
387 aa  187  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000472566  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1711  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.02 
 
 
378 aa  187  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.226626  normal  0.372623 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>