More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3465 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3465  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
377 aa  734    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.117346  normal  0.139258 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0063  iron-containing alcohol dehydrogenase  84.88 
 
 
379 aa  618  1e-176  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1756  iron-containing alcohol dehydrogenase  60.16 
 
 
377 aa  435  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0953887  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6426  Iron-containing alcohol dehydrogenase  57.87 
 
 
376 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2655  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  55.87 
 
 
382 aa  382  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1316  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  54.31 
 
 
382 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0905  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  55.35 
 
 
382 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.631296  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1823  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  55.35 
 
 
382 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0717  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  55.35 
 
 
382 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1668  NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase  55.35 
 
 
382 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1435  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  55.35 
 
 
382 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0445  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  55.35 
 
 
382 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1646  putative NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase  55.09 
 
 
382 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627044  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6101  dehydrogenase  52.66 
 
 
370 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1435  Alcohol dehydrogenase  53 
 
 
382 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0578775 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2864  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.14 
 
 
378 aa  373  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1418  Iron-containing alcohol dehydrogenase  52.22 
 
 
382 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.909336  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2526  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.63 
 
 
378 aa  365  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00912528 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1609  alcohol dehydrogenase  51.44 
 
 
382 aa  364  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3418  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.4 
 
 
378 aa  365  1e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1476  Alcohol dehydrogenase  51.96 
 
 
382 aa  363  2e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.178772  normal  0.0760523 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3383  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.57 
 
 
378 aa  362  8e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469103  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1798  putative NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase oxidoreductase protein  54.45 
 
 
378 aa  358  7e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0986  putative NAD-dependent 4-hyddoxybutyrate dehydrogenase oxidoreductase protein  52.74 
 
 
382 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.222848 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3155  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.13 
 
 
380 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2650  iron-containing alcohol dehydrogenase  49.87 
 
 
380 aa  354  1e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691454  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2157  iron-containing alcohol dehydrogenase  49.87 
 
 
380 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1943  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.05 
 
 
378 aa  352  5e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.612033  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1771  NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase oxidoreductase protein  54.05 
 
 
382 aa  352  8e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.705877 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1711  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.16 
 
 
378 aa  348  1e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.226626  normal  0.372623 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1993  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.16 
 
 
378 aa  347  2e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4502  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.27 
 
 
378 aa  329  5.0000000000000004e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.49519  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2781  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.69 
 
 
398 aa  252  8.000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409479  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0681  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.01 
 
 
381 aa  251  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1868  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.84 
 
 
381 aa  251  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.50517  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4700  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.8 
 
 
377 aa  246  4.9999999999999997e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0991  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.47 
 
 
381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260601  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2128  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.05 
 
 
381 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.705476  normal  0.429829 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2317  Iron-containing alcohol dehydrogenase  40.68 
 
 
381 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.735115  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2631  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.42 
 
 
383 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129708  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2470  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.99 
 
 
392 aa  236  4e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.5015 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0109  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.74 
 
 
378 aa  233  6e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2945  dehydrogenase  39.52 
 
 
381 aa  230  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2204  hypothetical protein  37.14 
 
 
386 aa  230  3e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2176  hypothetical protein  37.14 
 
 
386 aa  228  1e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0257  alcohol dehydrogenase, class IV  38.14 
 
 
383 aa  227  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.19 
 
 
387 aa  228  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4549  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.11 
 
 
381 aa  228  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0678  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.01 
 
 
389 aa  226  4e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2891  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.21 
 
 
383 aa  226  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339449  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2957  methanol dehydrogenase, NAD-dependent  38.36 
 
 
384 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0476972  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2848  alcohol dehydrogenase, class IV  37.87 
 
 
389 aa  223  4e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2792  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.74 
 
 
392 aa  222  7e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413135  normal  0.203588 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2530  alcohol dehydrogenase  37.04 
 
 
388 aa  218  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.840072  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.9 
 
 
382 aa  218  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.81 
 
 
389 aa  218  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1612  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.37 
 
 
381 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4285  alcohol dehydrogenase II  39.25 
 
 
382 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3987  Iron-containing alcohol dehydrogenase  39.25 
 
 
382 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2103  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.52 
 
 
388 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0158602  normal  0.562089 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.36 
 
 
382 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  37.29 
 
 
381 aa  215  9e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2742  Iron-containing alcohol dehydrogenase  37.3 
 
 
384 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0794554  normal  0.0588178 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.58 
 
 
384 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2290  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.91 
 
 
394 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000188362  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49580  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.71 
 
 
393 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.164623  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.57 
 
 
382 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.57 
 
 
382 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.63 
 
 
382 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2510  1,3-propanediol dehydrogenase  39.57 
 
 
383 aa  212  7e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.4448e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  38.56 
 
 
383 aa  211  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1258  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.74 
 
 
382 aa  211  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2578  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.43 
 
 
382 aa  211  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  36.07 
 
 
382 aa  211  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  35.2 
 
 
382 aa  211  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2001  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.85 
 
 
387 aa  211  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.86 
 
 
382 aa  210  3e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.134341 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  36.29 
 
 
382 aa  210  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1359  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.97 
 
 
382 aa  209  4e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.759734  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1490  alcohol dehydrogenase II  37.17 
 
 
382 aa  210  4e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  35.79 
 
 
382 aa  209  5e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1311  Iron-containing alcohol dehydrogenase  39.01 
 
 
382 aa  209  7e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3658  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.17 
 
 
383 aa  208  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  37.14 
 
 
382 aa  208  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.09 
 
 
393 aa  207  3e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.12 
 
 
387 aa  206  5e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  37.27 
 
 
388 aa  206  6e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0687  alcohol dehydrogenase, iron-containing  39.01 
 
 
389 aa  206  7e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.377875  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1152  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.57 
 
 
382 aa  205  8e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.305094  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1934  iron-containing alcohol dehydrogenase  40 
 
 
386 aa  205  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.586861  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4348  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.95 
 
 
385 aa  205  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.159902  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  37.47 
 
 
382 aa  204  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3523  alcohol dehydrogenase, iron-containing  37.72 
 
 
393 aa  204  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0887  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.79 
 
 
387 aa  204  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000472566  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0825  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.76 
 
 
393 aa  204  2e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.313783  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1046  Iron-containing alcohol dehydrogenase  37.27 
 
 
387 aa  204  3e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0545646  hitchhiker  0.000000369007 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2726  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.6 
 
 
385 aa  204  3e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0734  alcohol dehydrogenase, iron-containing  38.9 
 
 
389 aa  203  4e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.434692  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2234  iron-containing alcohol dehydrogenase  35 
 
 
382 aa  202  5e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10038 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0321  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.6 
 
 
393 aa  202  5e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.529761 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>