More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2891 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2631  iron-containing alcohol dehydrogenase  96.87 
 
 
383 aa  761    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129708  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2891  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
383 aa  780    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339449  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2128  iron-containing alcohol dehydrogenase  84.21 
 
 
381 aa  674    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.705476  normal  0.429829 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1868  iron-containing alcohol dehydrogenase  77.89 
 
 
381 aa  629  1e-179  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.50517  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2317  Iron-containing alcohol dehydrogenase  74.21 
 
 
381 aa  588  1e-167  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.735115  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0991  iron-containing alcohol dehydrogenase  73.68 
 
 
381 aa  585  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260601  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0681  iron-containing alcohol dehydrogenase  72.11 
 
 
381 aa  580  1e-164  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2781  iron-containing alcohol dehydrogenase  72.63 
 
 
398 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409479  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4549  iron-containing alcohol dehydrogenase  69.76 
 
 
381 aa  568  1e-161  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2945  dehydrogenase  69.47 
 
 
381 aa  560  1e-158  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1612  iron-containing alcohol dehydrogenase  73.68 
 
 
381 aa  553  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2204  hypothetical protein  57.94 
 
 
386 aa  470  1.0000000000000001e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3883  iron-containing alcohol dehydrogenase  64.4 
 
 
390 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5983  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0687  alcohol dehydrogenase, iron-containing  62.57 
 
 
389 aa  467  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.377875  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0734  alcohol dehydrogenase, iron-containing  62.3 
 
 
389 aa  464  1e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.434692  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2176  hypothetical protein  57.41 
 
 
386 aa  463  1e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2792  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.05 
 
 
392 aa  464  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413135  normal  0.203588 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0678  iron-containing alcohol dehydrogenase  55.7 
 
 
389 aa  443  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2103  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.66 
 
 
388 aa  392  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0158602  normal  0.562089 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2530  alcohol dehydrogenase  48.41 
 
 
388 aa  391  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.840072  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2742  Iron-containing alcohol dehydrogenase  45.19 
 
 
384 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0794554  normal  0.0588178 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2957  methanol dehydrogenase, NAD-dependent  46.34 
 
 
384 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0476972  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2394  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.1 
 
 
389 aa  346  3e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.219268  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1868  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.64 
 
 
394 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49580  iron-containing alcohol dehydrogenase  40 
 
 
393 aa  279  7e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.164623  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4700  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.52 
 
 
377 aa  268  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1756  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.33 
 
 
377 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0953887  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2470  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.23 
 
 
392 aa  264  2e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.5015 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6426  Iron-containing alcohol dehydrogenase  40.69 
 
 
376 aa  262  6.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3155  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.93 
 
 
380 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1435  Alcohol dehydrogenase  38.64 
 
 
382 aa  256  4e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0578775 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0109  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.04 
 
 
378 aa  253  4.0000000000000004e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6101  dehydrogenase  38.99 
 
 
370 aa  251  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2526  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.83 
 
 
378 aa  251  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00912528 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2650  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.83 
 
 
380 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691454  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1418  Iron-containing alcohol dehydrogenase  39.51 
 
 
382 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.909336  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1476  Alcohol dehydrogenase  38.32 
 
 
382 aa  248  2e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.178772  normal  0.0760523 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.12 
 
 
384 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2157  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.56 
 
 
380 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1609  alcohol dehydrogenase  37.96 
 
 
382 aa  242  9e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3418  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.77 
 
 
378 aa  242  9e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1943  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.99 
 
 
378 aa  241  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.612033  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2655  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  38.28 
 
 
382 aa  239  4e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1316  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  36.03 
 
 
382 aa  239  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3383  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.91 
 
 
378 aa  239  8e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469103  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1771  NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase oxidoreductase protein  37.86 
 
 
382 aa  236  6e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.705877 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2864  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.34 
 
 
378 aa  236  6e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1646  putative NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.5 
 
 
382 aa  233  5e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627044  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0063  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.69 
 
 
379 aa  233  5e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1435  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  37.5 
 
 
382 aa  233  6e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0905  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  37.5 
 
 
382 aa  233  6e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.631296  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1823  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  37.5 
 
 
382 aa  233  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1668  NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.5 
 
 
382 aa  233  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0717  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  37.5 
 
 
382 aa  233  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0445  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  37.5 
 
 
382 aa  233  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.2 
 
 
387 aa  229  5e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.2 
 
 
387 aa  227  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
389 aa  227  3e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3465  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.46 
 
 
377 aa  226  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.117346  normal  0.139258 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1196  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.58 
 
 
387 aa  226  4e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2420  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.25 
 
 
387 aa  224  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4502  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.36 
 
 
378 aa  224  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.49519  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0554  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.55 
 
 
387 aa  224  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1851  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.54 
 
 
383 aa  224  3e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0986  putative NAD-dependent 4-hyddoxybutyrate dehydrogenase oxidoreductase protein  36.08 
 
 
382 aa  223  4e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.222848 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  34.47 
 
 
388 aa  223  4e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2001  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.46 
 
 
387 aa  222  9e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1798  putative NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase oxidoreductase protein  38.54 
 
 
378 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1046  Iron-containing alcohol dehydrogenase  34.48 
 
 
387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0545646  hitchhiker  0.000000369007 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0887  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.11 
 
 
387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000472566  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2848  alcohol dehydrogenase, class IV  35.09 
 
 
389 aa  219  6e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2335  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.82 
 
 
637 aa  218  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.359123  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  33.16 
 
 
382 aa  217  2e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1993  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.33 
 
 
378 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.16 
 
 
382 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1711  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.33 
 
 
378 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.226626  normal  0.372623 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.37 
 
 
387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  33.16 
 
 
381 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1011  1,3-propanediol dehydrogenase  34.37 
 
 
385 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000128902  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0255  alcohol dehydrogenase, class IV  32.63 
 
 
390 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1943  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.17 
 
 
399 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1180  1,3-propanediol dehydrogenase  34.11 
 
 
385 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.440796  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1477  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
402 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.743318  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2042  EutG protein  33.94 
 
 
415 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.17622  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3326  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.78 
 
 
393 aa  212  1e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.744277  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.75 
 
 
382 aa  211  1e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2097  EutG protein  33.94 
 
 
415 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  31.43 
 
 
382 aa  211  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2237  EutG protein  33.94 
 
 
490 aa  211  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.113437  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0441  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.28 
 
 
399 aa  210  4e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0251  alcohol dehydrogenase, class IV  31.85 
 
 
390 aa  209  6e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  31.43 
 
 
382 aa  208  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0514  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.9 
 
 
387 aa  208  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0174269  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1164  alcohol dehydrogenase, iron-containing  32.1 
 
 
388 aa  208  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1594  alcohol dehydrogenase, class IV  31.85 
 
 
390 aa  207  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.9 
 
 
393 aa  207  2e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  33.07 
 
 
382 aa  207  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1481  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.79 
 
 
382 aa  207  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2290  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.15 
 
 
388 aa  207  4e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  32.21 
 
 
382 aa  207  4e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>