More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2394 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2394  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
389 aa  769    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.219268  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2176  hypothetical protein  50 
 
 
386 aa  372  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2204  hypothetical protein  49.21 
 
 
386 aa  360  3e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2792  iron-containing alcohol dehydrogenase  49.61 
 
 
392 aa  358  9.999999999999999e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413135  normal  0.203588 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0991  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.26 
 
 
381 aa  351  1e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260601  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2317  Iron-containing alcohol dehydrogenase  49.74 
 
 
381 aa  349  4e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.735115  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0678  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.66 
 
 
389 aa  348  7e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2128  iron-containing alcohol dehydrogenase  49.21 
 
 
381 aa  345  8e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.705476  normal  0.429829 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2631  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.41 
 
 
383 aa  343  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129708  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3883  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.03 
 
 
390 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5983  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1868  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.23 
 
 
381 aa  337  9.999999999999999e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.50517  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2781  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.28 
 
 
398 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409479  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0687  alcohol dehydrogenase, iron-containing  50.64 
 
 
389 aa  334  1e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.377875  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4549  iron-containing alcohol dehydrogenase  49.04 
 
 
381 aa  334  2e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0734  alcohol dehydrogenase, iron-containing  50.39 
 
 
389 aa  333  4e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.434692  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2945  dehydrogenase  48.06 
 
 
381 aa  328  1.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2891  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.1 
 
 
383 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339449  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0681  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.48 
 
 
381 aa  324  2e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1612  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.02 
 
 
381 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2530  alcohol dehydrogenase  41.86 
 
 
388 aa  301  1e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.840072  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2103  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.01 
 
 
388 aa  296  4e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0158602  normal  0.562089 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2742  Iron-containing alcohol dehydrogenase  41.62 
 
 
384 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0794554  normal  0.0588178 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2957  methanol dehydrogenase, NAD-dependent  41.53 
 
 
384 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0476972  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4700  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.95 
 
 
377 aa  267  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1868  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.78 
 
 
394 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0109  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.05 
 
 
378 aa  260  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2470  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.12 
 
 
392 aa  253  5.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.5015 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49580  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.43 
 
 
393 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.164623  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1756  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.37 
 
 
377 aa  228  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0953887  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  35.17 
 
 
381 aa  225  1e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.85 
 
 
382 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.59 
 
 
382 aa  219  6e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.59 
 
 
382 aa  219  6e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  32.82 
 
 
382 aa  219  6e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.55 
 
 
382 aa  218  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.134341 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1359  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.64 
 
 
382 aa  218  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.759734  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1490  alcohol dehydrogenase II  33.33 
 
 
382 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.3 
 
 
384 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.02 
 
 
382 aa  216  4e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2082  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.16 
 
 
388 aa  217  4e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.07 
 
 
382 aa  216  7e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3038  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.16 
 
 
382 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219975  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1348  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.07 
 
 
382 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1312  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.16 
 
 
382 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.55 
 
 
382 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3155  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.22 
 
 
380 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2578  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.81 
 
 
382 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1258  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.85 
 
 
382 aa  213  7e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  32.38 
 
 
382 aa  212  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  32.38 
 
 
382 aa  211  1e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  32.99 
 
 
382 aa  211  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6426  Iron-containing alcohol dehydrogenase  39.56 
 
 
376 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.28 
 
 
382 aa  211  2e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.55 
 
 
382 aa  211  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1786  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.16 
 
 
388 aa  210  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2650  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.24 
 
 
380 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691454  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0063  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.53 
 
 
379 aa  209  5e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.23 
 
 
383 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.07 
 
 
383 aa  209  6e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  34.46 
 
 
382 aa  209  6e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3987  Iron-containing alcohol dehydrogenase  34.55 
 
 
382 aa  209  8e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1011  1,3-propanediol dehydrogenase  33.25 
 
 
385 aa  209  9e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000128902  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  33.68 
 
 
382 aa  209  9e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1481  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.52 
 
 
382 aa  208  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1180  1,3-propanediol dehydrogenase  33.25 
 
 
385 aa  208  1e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.440796  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13900  Iron-containing alcohol dehydrogenase  36.44 
 
 
386 aa  207  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00279166  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2420  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.53 
 
 
387 aa  207  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6101  dehydrogenase  37.74 
 
 
370 aa  207  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4285  alcohol dehydrogenase II  33.76 
 
 
382 aa  207  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1152  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.07 
 
 
382 aa  207  4e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.305094  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2865  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.25 
 
 
402 aa  206  5e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.452469  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2157  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.98 
 
 
380 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3418  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.57 
 
 
378 aa  206  7e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0142  putative alcohol dehydrogenase  33.59 
 
 
383 aa  205  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.555201  normal  0.893326 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1435  Alcohol dehydrogenase  36.75 
 
 
382 aa  205  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0578775 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1196  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.55 
 
 
387 aa  205  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1311  Iron-containing alcohol dehydrogenase  34.29 
 
 
382 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0554  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.42 
 
 
387 aa  204  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2864  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.15 
 
 
378 aa  204  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.55 
 
 
389 aa  203  4e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2526  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.07 
 
 
378 aa  202  6e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00912528 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1046  Iron-containing alcohol dehydrogenase  34.36 
 
 
387 aa  202  7e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0545646  hitchhiker  0.000000369007 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2506  alcohol dehydrogenase, class IV  32.47 
 
 
387 aa  202  8e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.75007e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.97 
 
 
387 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0887  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.99 
 
 
387 aa  202  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000472566  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1418  Iron-containing alcohol dehydrogenase  37.37 
 
 
382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.909336  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  34.97 
 
 
383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3758  lactaldehyde reductase  32.98 
 
 
382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3848  lactaldehyde reductase  32.98 
 
 
382 aa  200  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0746  lactaldehyde reductase  32.98 
 
 
382 aa  200  3e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0727941 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1476  Alcohol dehydrogenase  36.48 
 
 
382 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.178772  normal  0.0760523 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3658  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.55 
 
 
383 aa  200  3.9999999999999996e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2042  EutG protein  33.77 
 
 
415 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.17622  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4348  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.65 
 
 
385 aa  199  9e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.159902  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3465  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.94 
 
 
377 aa  199  9e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.117346  normal  0.139258 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2097  EutG protein  33.77 
 
 
415 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2682  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.65 
 
 
387 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2237  EutG protein  33.77 
 
 
490 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.113437  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2510  1,3-propanediol dehydrogenase  33.42 
 
 
383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.4448e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2335  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.59 
 
 
637 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.359123  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>