More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1868 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1868  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 394 aa  791    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2631  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.95 
 
 		 383 aa  299  6e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1868  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.99 
 
 		 381 aa  299  6e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.50517  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2128  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.43 
 
 		 381 aa  293  4e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.705476  normal  0.429829 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2781  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.74 
 
 		 398 aa  291  1e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4549  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.79 
 
 		 381 aa  286  5.999999999999999e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0678  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.68 
 
 		 389 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2891  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.21 
 
 		 383 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2792  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.1 
 
 		 392 aa  280  3e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413135  normal  0.203588 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0681  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.42 
 
 		 381 aa  280  3e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2945  dehydrogenase  41.32 
 
 		 381 aa  277  3e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2394  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.23 
 
 		 389 aa  275  8e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.219268  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0991  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.21 
 
 		 381 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2317  Iron-containing alcohol dehydrogenase  38.95 
 
 		 381 aa  273  3e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.735115  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2176  hypothetical protein  39.74 
 
 		 386 aa  273  5.000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0687  alcohol dehydrogenase, iron-containing  41.04 
 
 		 389 aa  267  2.9999999999999995e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.377875  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0734  alcohol dehydrogenase, iron-containing  40.78 
 
 		 389 aa  265  1e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.434692  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2204  hypothetical protein  38.95 
 
 		 386 aa  264  2e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2530  alcohol dehydrogenase  38.74 
 
 		 388 aa  261  2e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.840072  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1612  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.42 
 
 		 381 aa  256  5e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3883  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.48 
 
 		 390 aa  255  8e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5983  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2742  Iron-containing alcohol dehydrogenase  36.69 
 
 		 384 aa  247  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0794554  normal  0.0588178 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2470  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.8 
 
 		 392 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.5015 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4700  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.2 
 
 		 377 aa  243  6e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2103  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.04 
 
 		 388 aa  241  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0158602  normal  0.562089 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2957  methanol dehydrogenase, NAD-dependent  36.69 
 
 		 384 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0476972  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0109  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.76 
 
 		 378 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3155  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.79 
 
 		 380 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2650  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.26 
 
 		 380 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2157  iron-containing alcohol dehydrogenase  40 
 
 		 380 aa  226  8e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.44 
 
 		 389 aa  225  8e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3383  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.58 
 
 		 378 aa  223  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469103  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  37.44 
 
 		 388 aa  222  9e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2526  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.31 
 
 		 378 aa  220  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00912528 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1756  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.31 
 
 		 377 aa  219  5e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0953887  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3418  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.68 
 
 		 378 aa  219  6e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4439  lactaldehyde reductase  38.64 
 
 		 382 aa  215  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0986  putative NAD-dependent 4-hyddoxybutyrate dehydrogenase oxidoreductase protein  36.88 
 
 		 382 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.222848 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4327  lactaldehyde reductase  38.64 
 
 		 382 aa  215  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.238519 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4258  lactaldehyde reductase  38.64 
 
 		 382 aa  215  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4287  lactaldehyde reductase  38.64 
 
 		 382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4373  lactaldehyde reductase  38.64 
 
 		 382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  36.09 
 
 		 382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  36.09 
 
 		 382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.6 
 
 		 382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1943  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.2 
 
 		 378 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.612033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  34.63 
 
 		 382 aa  214  2.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2939  L-1,2-propanediol oxidoreductase  36.02 
 
 		 383 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.284503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.6 
 
 		 382 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.6 
 
 		 382 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2001  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.29 
 
 		 387 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  34.54 
 
 		 382 aa  213  5.999999999999999e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3758  lactaldehyde reductase  37.6 
 
 		 382 aa  213  5.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4063  L-1,2-propanediol oxidoreductase  35.77 
 
 		 383 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.17 
 
 		 382 aa  212  9e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3848  lactaldehyde reductase  37.6 
 
 		 382 aa  212  9e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.48 
 
 		 384 aa  212  1e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1164  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.12 
 
 		 388 aa  212  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0746  lactaldehyde reductase  37.34 
 
 		 382 aa  211  1e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0727941 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49580  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.48 
 
 		 393 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.164623  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02644  L-1,2-propanediol oxidoreductase  35.52 
 
 		 383 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2943  L-1,2-propanediol oxidoreductase  36.6 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02606  hypothetical protein  35.52 
 
 		 383 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.26 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134341 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3532  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.13 
 
 		 388 aa  211  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0825  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.57 
 
 		 393 aa  211  2e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.313783  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0889  lactaldehyde reductase  36.6 
 
 		 382 aa  210  3e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3104  L-1,2-propanediol oxidoreductase  36.6 
 
 		 382 aa  210  3e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.189679  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0913  L-1,2-propanediol oxidoreductase  35.52 
 
 		 383 aa  210  4e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1316  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  36.48 
 
 		 382 aa  209  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4074  lactaldehyde reductase  37.08 
 
 		 382 aa  209  5e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.47 
 
 		 382 aa  209  6e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1435  Alcohol dehydrogenase  36.62 
 
 		 382 aa  209  8e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0578775 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  35.31 
 
 		 383 aa  209  8e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1490  alcohol dehydrogenase II  36 
 
 		 382 aa  208  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4348  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.67 
 
 		 385 aa  208  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.159902  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2655  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  37.27 
 
 		 382 aa  208  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2578  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.68 
 
 		 382 aa  209  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2864  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.57 
 
 		 378 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3296  L-1,2-propanediol oxidoreductase  36.87 
 
 		 382 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3133  L-1,2-propanediol oxidoreductase  36.87 
 
 		 382 aa  208  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.708471  normal  0.183731 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1258  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.16 
 
 		 382 aa  207  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.28 
 
 		 382 aa  207  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3116  L-1,2-propanediol oxidoreductase  36.87 
 
 		 382 aa  208  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.303713  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3196  L-1,2-propanediol oxidoreductase  36.87 
 
 		 382 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0321  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.95 
 
 		 393 aa  208  2e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.529761 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1481  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.28 
 
 		 382 aa  207  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3181  L-1,2-propanediol oxidoreductase  36.87 
 
 		 382 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.292144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1359  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.16 
 
 		 382 aa  206  4e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.759734  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1196  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.35 
 
 		 387 aa  207  4e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1646  putative NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.27 
 
 		 382 aa  207  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627044  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2865  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.23 
 
 		 402 aa  206  4e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.452469  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0905  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  37.01 
 
 		 382 aa  206  6e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.631296  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1823  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  37.01 
 
 		 382 aa  206  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0445  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  37.01 
 
 		 382 aa  206  6e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1435  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  37.01 
 
 		 382 aa  206  6e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0717  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  37.01 
 
 		 382 aa  206  6e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1668  NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.01 
 
 		 382 aa  206  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3987  Iron-containing alcohol dehydrogenase  35.81 
 
 		 382 aa  206  7e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2726  iron-containing alcohol dehydrogenase  32 
 
 		 385 aa  206  7e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>