More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp0986 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp0986  putative NAD-dependent 4-hyddoxybutyrate dehydrogenase oxidoreductase protein  100 
 
 		 382 aa  770    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.222848 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1316  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  77.23 
 
 		 382 aa  616  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1609  alcohol dehydrogenase  74.08 
 
 		 382 aa  600  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1435  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  75.65 
 
 		 382 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1668  NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase  75.65 
 
 		 382 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0905  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  75.65 
 
 		 382 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.631296  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1823  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  75.65 
 
 		 382 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0717  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  75.65 
 
 		 382 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1646  putative NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase  75.65 
 
 		 382 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627044  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0445  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  75.65 
 
 		 382 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2655  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  74.87 
 
 		 382 aa  584  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1418  Iron-containing alcohol dehydrogenase  73.56 
 
 		 382 aa  579  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.909336  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1435  Alcohol dehydrogenase  71.47 
 
 		 382 aa  566  1e-160  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0578775 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1771  NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase oxidoreductase protein  73.04 
 
 		 382 aa  556  1e-157  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.705877 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1476  Alcohol dehydrogenase  71.2 
 
 		 382 aa  553  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.178772  normal  0.0760523 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2526  iron-containing alcohol dehydrogenase  65.45 
 
 		 378 aa  500  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00912528 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3418  iron-containing alcohol dehydrogenase  65.71 
 
 		 378 aa  492  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1993  iron-containing alcohol dehydrogenase  66.49 
 
 		 378 aa  485  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1711  iron-containing alcohol dehydrogenase  66.75 
 
 		 378 aa  486  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.226626  normal  0.372623 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2864  iron-containing alcohol dehydrogenase  62.57 
 
 		 378 aa  481  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1943  iron-containing alcohol dehydrogenase  62.57 
 
 		 378 aa  476  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.612033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3383  iron-containing alcohol dehydrogenase  63.87 
 
 		 378 aa  475  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469103  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1798  putative NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase oxidoreductase protein  62.83 
 
 		 378 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2650  iron-containing alcohol dehydrogenase  56.77 
 
 		 380 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3155  iron-containing alcohol dehydrogenase  56.25 
 
 		 380 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2157  iron-containing alcohol dehydrogenase  57.03 
 
 		 380 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6426  Iron-containing alcohol dehydrogenase  58.64 
 
 		 376 aa  422  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1756  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.14 
 
 		 377 aa  379  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0953887  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6101  dehydrogenase  48.17 
 
 		 370 aa  356  3.9999999999999996e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0063  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.74 
 
 		 379 aa  348  1e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3465  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.74 
 
 		 377 aa  333  3e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.117346  normal  0.139258 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4502  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.56 
 
 		 378 aa  318  1e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.49519  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2470  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.79 
 
 		 392 aa  246  4.9999999999999997e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.5015 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2781  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.7 
 
 		 398 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0681  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.28 
 
 		 381 aa  239  6.999999999999999e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4549  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.28 
 
 		 381 aa  233  4.0000000000000004e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2176  hypothetical protein  36.29 
 
 		 386 aa  228  1e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1868  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.77 
 
 		 381 aa  227  3e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.50517  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2631  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.94 
 
 		 383 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2128  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.43 
 
 		 381 aa  226  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.705476  normal  0.429829 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0991  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.21 
 
 		 381 aa  225  8e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260601  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2204  hypothetical protein  36.65 
 
 		 386 aa  224  2e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2317  Iron-containing alcohol dehydrogenase  36.69 
 
 		 381 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.735115  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0678  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.21 
 
 		 389 aa  219  6e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  33 
 
 		 389 aa  217  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2945  dehydrogenase  36.03 
 
 		 381 aa  216  5e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2290  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.01 
 
 		 394 aa  216  7e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000188362  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.58 
 
 		 393 aa  212  7.999999999999999e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1612  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.18 
 
 		 381 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3523  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34 
 
 		 393 aa  211  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0109  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.05 
 
 		 378 aa  210  4e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.09 
 
 		 382 aa  209  8e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  34.09 
 
 		 382 aa  209  9e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1786  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.32 
 
 		 388 aa  207  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1943  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.97 
 
 		 399 aa  207  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2742  Iron-containing alcohol dehydrogenase  34.82 
 
 		 384 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0794554  normal  0.0588178 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2891  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.08 
 
 		 383 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1046  Iron-containing alcohol dehydrogenase  34.77 
 
 		 387 aa  202  6e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0545646  hitchhiker  0.000000369007 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4700  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.85 
 
 		 377 aa  202  6e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0825  iron-containing alcohol dehydrogenase  35 
 
 		 393 aa  202  7e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.313783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3326  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.08 
 
 		 393 aa  202  9e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.744277  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1868  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.88 
 
 		 394 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.76 
 
 		 387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0687  alcohol dehydrogenase, iron-containing  36.69 
 
 		 389 aa  200  3e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.377875  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2276  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.31 
 
 		 388 aa  200  3e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.751184  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2082  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.84 
 
 		 388 aa  200  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2957  methanol dehydrogenase, NAD-dependent  35.87 
 
 		 384 aa  199  6e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0476972  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  35.2 
 
 		 381 aa  199  6e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4348  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.03 
 
 		 385 aa  199  7e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.159902  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2961  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.66 
 
 		 388 aa  199  7e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.813406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1934  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.67 
 
 		 386 aa  199  7.999999999999999e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.586861  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1986  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.4 
 
 		 382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0734  alcohol dehydrogenase, iron-containing  36.43 
 
 		 389 aa  198  1.0000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.434692  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  35.77 
 
 		 388 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2430  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.34 
 
 		 384 aa  197  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.15 
 
 		 387 aa  197  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2234  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.44 
 
 		 382 aa  197  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10038 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49580  iron-containing alcohol dehydrogenase  40 
 
 		 393 aa  197  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.164623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.65 
 
 		 387 aa  196  6e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2001  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.28 
 
 		 387 aa  196  7e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1053  Iron-containing alcohol dehydrogenase  35.48 
 
 		 382 aa  196  8.000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489581 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0767  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.31 
 
 		 406 aa  196  8.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2103  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.16 
 
 		 388 aa  195  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0158602  normal  0.562089 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.65 
 
 		 387 aa  195  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.99 
 
 		 384 aa  194  2e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2530  alcohol dehydrogenase  32.99 
 
 		 388 aa  193  4e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.840072  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2478  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.4 
 
 		 395 aa  193  4e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0321  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.5 
 
 		 393 aa  192  7e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.529761 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2792  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.02 
 
 		 392 aa  192  9e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413135  normal  0.203588 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  34.15 
 
 		 382 aa  191  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0257  alcohol dehydrogenase, class IV  34.45 
 
 		 383 aa  191  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4944  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.55 
 
 		 410 aa  191  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0567  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.57 
 
 		 383 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2420  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.02 
 
 		 387 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0514  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.91 
 
 		 387 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0174269  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1196  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.93 
 
 		 387 aa  190  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.96 
 
 		 383 aa  189  8e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.59 
 
 		 382 aa  189  9e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3883  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.14 
 
 		 390 aa  188  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5983  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2277  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.1 
 
 		 388 aa  187  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>