More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2103 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2103  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 388 aa  792    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0158602  normal  0.562089 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2530  alcohol dehydrogenase  69.07 
 
 		 388 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.840072  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0678  iron-containing alcohol dehydrogenase  61.88 
 
 		 389 aa  481  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2204  hypothetical protein  58.58 
 
 		 386 aa  449  1e-125  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2176  hypothetical protein  58.31 
 
 		 386 aa  444  1e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2792  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.26 
 
 		 392 aa  414  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413135  normal  0.203588 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2742  Iron-containing alcohol dehydrogenase  50.91 
 
 		 384 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0794554  normal  0.0588178 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2631  iron-containing alcohol dehydrogenase  49.87 
 
 		 383 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2128  iron-containing alcohol dehydrogenase  49.48 
 
 		 381 aa  394  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.705476  normal  0.429829 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2317  Iron-containing alcohol dehydrogenase  49.87 
 
 		 381 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.735115  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0991  iron-containing alcohol dehydrogenase  49.61 
 
 		 381 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1868  iron-containing alcohol dehydrogenase  49.22 
 
 		 381 aa  390  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.50517  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0734  alcohol dehydrogenase, iron-containing  52.32 
 
 		 389 aa  386  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.434692  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2957  methanol dehydrogenase, NAD-dependent  50.39 
 
 		 384 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0476972  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0687  alcohol dehydrogenase, iron-containing  52.58 
 
 		 389 aa  387  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.377875  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3883  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.28 
 
 		 390 aa  383  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5983  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4549  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.88 
 
 		 381 aa  384  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2891  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.66 
 
 		 383 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2781  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.92 
 
 		 398 aa  375  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2945  dehydrogenase  47.91 
 
 		 381 aa  373  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1612  iron-containing alcohol dehydrogenase  49.61 
 
 		 381 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0681  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.63 
 
 		 381 aa  369  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49580  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.25 
 
 		 393 aa  306  3e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.164623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2394  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.26 
 
 		 389 aa  303  5.000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.219268  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2470  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.54 
 
 		 392 aa  263  4e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.5015 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0109  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.7 
 
 		 378 aa  254  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4700  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.68 
 
 		 377 aa  247  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1868  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.04 
 
 		 394 aa  239  8e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1756  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.48 
 
 		 377 aa  236  6e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0953887  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1851  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.85 
 
 		 383 aa  225  1e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6101  dehydrogenase  38.22 
 
 		 370 aa  221  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2864  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.55 
 
 		 378 aa  219  7e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2001  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.97 
 
 		 387 aa  219  7.999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1316  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  34.79 
 
 		 382 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3418  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.77 
 
 		 378 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  36.88 
 
 		 388 aa  216  4e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.08 
 
 		 389 aa  216  5e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1418  Iron-containing alcohol dehydrogenase  35.94 
 
 		 382 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.909336  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0554  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.81 
 
 		 387 aa  215  9e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.42 
 
 		 384 aa  215  9.999999999999999e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2526  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.9 
 
 		 378 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00912528 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3326  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.26 
 
 		 393 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.744277  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0887  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.79 
 
 		 387 aa  212  7.999999999999999e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000472566  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2848  alcohol dehydrogenase, class IV  37.27 
 
 		 389 aa  212  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3465  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.56 
 
 		 377 aa  211  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.117346  normal  0.139258 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1481  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.73 
 
 		 382 aa  211  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6426  Iron-containing alcohol dehydrogenase  37.5 
 
 		 376 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  33.51 
 
 		 382 aa  210  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.05 
 
 		 387 aa  210  4e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.05 
 
 		 387 aa  210  4e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3383  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.46 
 
 		 378 aa  209  5e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469103  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1435  Alcohol dehydrogenase  33.16 
 
 		 382 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0578775 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1196  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.56 
 
 		 387 aa  207  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.9 
 
 		 382 aa  206  8e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  33.51 
 
 		 382 aa  205  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2655  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  34.28 
 
 		 382 aa  205  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  33.42 
 
 		 382 aa  205  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1476  Alcohol dehydrogenase  33.16 
 
 		 382 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.178772  normal  0.0760523 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0321  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.52 
 
 		 393 aa  204  2e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.529761 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1490  alcohol dehydrogenase II  34.11 
 
 		 382 aa  204  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.49 
 
 		 393 aa  204  2e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1943  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.98 
 
 		 378 aa  204  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.612033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.47 
 
 		 382 aa  204  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.68 
 
 		 382 aa  204  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2650  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.98 
 
 		 380 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0825  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.52 
 
 		 393 aa  203  4e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.313783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3155  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.07 
 
 		 380 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.68 
 
 		 382 aa  203  4e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.68 
 
 		 382 aa  203  4e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1646  putative NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase  34.02 
 
 		 382 aa  202  5e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627044  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0986  putative NAD-dependent 4-hyddoxybutyrate dehydrogenase oxidoreductase protein  33.16 
 
 		 382 aa  202  6e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.222848 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0514  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.42 
 
 		 387 aa  202  6e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0174269  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0717  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  34.02 
 
 		 382 aa  202  7e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0905  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  34.02 
 
 		 382 aa  202  7e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.631296  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1435  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  34.02 
 
 		 382 aa  202  7e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1823  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  34.02 
 
 		 382 aa  202  7e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0445  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  34.02 
 
 		 382 aa  202  7e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2510  1,3-propanediol dehydrogenase  35.46 
 
 		 383 aa  202  7e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.4448e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1668  NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase  34.02 
 
 		 382 aa  202  7e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0063  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.8 
 
 		 379 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1258  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.68 
 
 		 382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2157  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.72 
 
 		 380 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2802  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.68 
 
 		 395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 		 383 aa  200  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2335  alcohol dehydrogenase, iron-containing  32.64 
 
 		 637 aa  201  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.359123  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2042  EutG protein  32.9 
 
 		 415 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.17622  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.9 
 
 		 382 aa  199  5e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134341 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.69 
 
 		 382 aa  199  5e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2237  EutG protein  32.9 
 
 		 490 aa  199  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.113437  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2097  EutG protein  32.9 
 
 		 415 aa  199  7e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1348  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.07 
 
 		 382 aa  199  9e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1312  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.08 
 
 		 382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1943  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.09 
 
 		 399 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3038  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.08 
 
 		 382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1359  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.13 
 
 		 382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.759734  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2803  1,3-propanediol dehydrogenase  37.01 
 
 		 394 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1046  Iron-containing alcohol dehydrogenase  33.77 
 
 		 387 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0545646  hitchhiker  0.000000369007 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1152  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.13 
 
 		 382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.305094  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  31.98 
 
 		 382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.65 
 
 		 382 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>