More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4502 on replicon NC_008243
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008243  Meso_4502  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
378 aa  756    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.49519  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6426  Iron-containing alcohol dehydrogenase  54.21 
 
 
376 aa  388  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1756  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.93 
 
 
377 aa  372  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0953887  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1435  Alcohol dehydrogenase  51.19 
 
 
382 aa  368  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0578775 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1418  Iron-containing alcohol dehydrogenase  49.35 
 
 
382 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.909336  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1771  NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase oxidoreductase protein  51.72 
 
 
382 aa  364  2e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.705877 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1476  Alcohol dehydrogenase  50.66 
 
 
382 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.178772  normal  0.0760523 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3418  iron-containing alcohol dehydrogenase  49.47 
 
 
378 aa  357  2.9999999999999997e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1646  putative NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase  50.13 
 
 
382 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627044  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1668  NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase  49.87 
 
 
382 aa  353  4e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0905  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  49.87 
 
 
382 aa  353  4e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.631296  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0445  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  49.87 
 
 
382 aa  353  4e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1823  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  49.87 
 
 
382 aa  353  4e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2655  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  49.87 
 
 
382 aa  352  4e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0717  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  49.87 
 
 
382 aa  353  4e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1435  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  49.87 
 
 
382 aa  353  4e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6101  dehydrogenase  49.6 
 
 
370 aa  352  5e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3155  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.03 
 
 
380 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1316  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  49.08 
 
 
382 aa  351  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2650  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.77 
 
 
380 aa  348  7e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691454  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2526  iron-containing alcohol dehydrogenase  49.08 
 
 
378 aa  348  9e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00912528 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2864  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.03 
 
 
378 aa  347  2e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1609  alcohol dehydrogenase  47.78 
 
 
382 aa  346  4e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2157  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.51 
 
 
380 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0986  putative NAD-dependent 4-hyddoxybutyrate dehydrogenase oxidoreductase protein  48.56 
 
 
382 aa  340  4e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.222848 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3383  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.14 
 
 
378 aa  336  2.9999999999999997e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469103  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1943  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.01 
 
 
378 aa  335  1e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.612033  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1993  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.81 
 
 
378 aa  333  3e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1711  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.54 
 
 
378 aa  333  3e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.226626  normal  0.372623 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3465  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.56 
 
 
377 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.117346  normal  0.139258 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1798  putative NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase oxidoreductase protein  48.68 
 
 
378 aa  331  1e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0063  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.62 
 
 
379 aa  322  8e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2781  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.48 
 
 
398 aa  247  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409479  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2128  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.18 
 
 
381 aa  246  6.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.705476  normal  0.429829 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2945  dehydrogenase  38.34 
 
 
381 aa  241  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1868  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.4 
 
 
381 aa  239  5.999999999999999e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.50517  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2631  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.53 
 
 
383 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129708  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2176  hypothetical protein  37.83 
 
 
386 aa  235  8e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0681  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.21 
 
 
381 aa  232  8.000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2204  hypothetical protein  37.3 
 
 
386 aa  231  1e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0678  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.57 
 
 
389 aa  223  4e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2742  Iron-containing alcohol dehydrogenase  37.47 
 
 
384 aa  222  7e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0794554  normal  0.0588178 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2530  alcohol dehydrogenase  35.71 
 
 
388 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.840072  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0991  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.68 
 
 
381 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260601  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2317  Iron-containing alcohol dehydrogenase  35.68 
 
 
381 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.735115  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2891  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.36 
 
 
383 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339449  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4549  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.81 
 
 
381 aa  220  3e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2957  methanol dehydrogenase, NAD-dependent  36.94 
 
 
384 aa  219  5e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0476972  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2792  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.81 
 
 
392 aa  219  5e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413135  normal  0.203588 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2470  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.87 
 
 
392 aa  216  4e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.5015 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2290  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.5 
 
 
394 aa  210  3e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000188362  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0687  alcohol dehydrogenase, iron-containing  37.37 
 
 
389 aa  210  4e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.377875  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4700  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.49 
 
 
377 aa  206  6e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0734  alcohol dehydrogenase, iron-containing  36.86 
 
 
389 aa  206  7e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.434692  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1612  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.29 
 
 
381 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2103  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.45 
 
 
388 aa  204  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0158602  normal  0.562089 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0767  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.19 
 
 
406 aa  203  3e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.02 
 
 
383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.58 
 
 
382 aa  201  3e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2510  1,3-propanediol dehydrogenase  37.81 
 
 
383 aa  199  6e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.4448e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2836  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.39 
 
 
380 aa  197  2.0000000000000003e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0257  alcohol dehydrogenase, class IV  35.17 
 
 
383 aa  197  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.08 
 
 
389 aa  197  3e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1490  alcohol dehydrogenase II  35.86 
 
 
382 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2082  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.9 
 
 
388 aa  195  8.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3883  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.58 
 
 
390 aa  195  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5983  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2420  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.34 
 
 
387 aa  194  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.08 
 
 
387 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  36.15 
 
 
388 aa  193  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4348  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.65 
 
 
385 aa  194  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.159902  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.8 
 
 
382 aa  193  4e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1786  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.8 
 
 
388 aa  193  5e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.23 
 
 
382 aa  192  7e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0825  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.96 
 
 
393 aa  192  7e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.313783  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.06 
 
 
393 aa  191  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  34.66 
 
 
382 aa  192  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1312  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.32 
 
 
382 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3038  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.32 
 
 
382 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219975  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.23 
 
 
382 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.23 
 
 
382 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1011  1,3-propanediol dehydrogenase  34.83 
 
 
385 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000128902  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1348  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.06 
 
 
382 aa  190  4e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1180  1,3-propanediol dehydrogenase  34.83 
 
 
385 aa  190  4e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.440796  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0321  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.96 
 
 
393 aa  190  5e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.529761 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.81 
 
 
382 aa  189  5e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4231  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.57 
 
 
383 aa  189  5e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.995734  hitchhiker  0.000246581 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0164  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.83 
 
 
383 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0466  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.35 
 
 
384 aa  189  7e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0109  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.51 
 
 
378 aa  189  7e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4160  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.66 
 
 
383 aa  189  9e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3523  alcohol dehydrogenase, iron-containing  35.06 
 
 
393 aa  189  9e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2578  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.37 
 
 
382 aa  189  9e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.6 
 
 
384 aa  189  9e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0554  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.6 
 
 
387 aa  189  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2478  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.36 
 
 
395 aa  187  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3326  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.58 
 
 
393 aa  187  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.744277  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  36.29 
 
 
382 aa  187  3e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1359  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.57 
 
 
382 aa  186  4e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.759734  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3439  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.3 
 
 
383 aa  186  4e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.928685  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.73 
 
 
382 aa  186  7e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>