More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1051 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1051  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
340 aa  662    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0705172  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4409  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.98 
 
 
417 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.417322  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4699  Iron-containing alcohol dehydrogenase  39.25 
 
 
380 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5309  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.13 
 
 
379 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2455  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.91 
 
 
392 aa  182  7e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5141  putative alcohol dehydrogenase  34.1 
 
 
386 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237581  normal  0.0395804 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5982  Iron-containing alcohol dehydrogenase  37.71 
 
 
372 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.306668  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5421  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.86 
 
 
372 aa  154  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1589  Iron-containing alcohol dehydrogenase  34.07 
 
 
355 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4484  Iron-containing alcohol dehydrogenase  34.08 
 
 
355 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2063  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.62 
 
 
352 aa  142  6e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00184979  normal  0.72371 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1325  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.87 
 
 
355 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.397668 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3908  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.23 
 
 
362 aa  138  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0347674 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3335  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.96 
 
 
358 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.330592  normal  0.657196 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05178  maleylacetate reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07090)  30.38 
 
 
357 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.516162  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1062  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.77 
 
 
314 aa  134  3e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4129  Iron-containing alcohol dehydrogenase  33.75 
 
 
357 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6071  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.17 
 
 
355 aa  132  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4694  Iron-containing alcohol dehydrogenase  34.39 
 
 
352 aa  132  9e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5727  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.87 
 
 
352 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1126  maleylacetate reductase  32.81 
 
 
352 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499369  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3432  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.29 
 
 
355 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05234  Fe-containing alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06800)  30.51 
 
 
414 aa  129  7.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.868028  normal  0.105972 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6132  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.38 
 
 
355 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.980292  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4891  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.09 
 
 
356 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.592699  normal  0.0411098 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5623  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.44 
 
 
355 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0837  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.2 
 
 
356 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4611  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.53 
 
 
353 aa  127  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.557195  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5063  maleylacetate reductase  34.06 
 
 
355 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0529248  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4085  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.97 
 
 
355 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0871083  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5215  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.75 
 
 
355 aa  126  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2143  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.78 
 
 
365 aa  125  9e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3377  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.54 
 
 
355 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3908  maleylacetate reductase  34.32 
 
 
355 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5062  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.66 
 
 
352 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2737  Iron-containing alcohol dehydrogenase  33.44 
 
 
355 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.413551  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0441  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.4 
 
 
399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  27.27 
 
 
382 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7440  maleylacetate reductase  30.16 
 
 
357 aa  120  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4348  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.12 
 
 
385 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.159902  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1071  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.46 
 
 
358 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1418  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.3 
 
 
351 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.93105 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2495  lactaldehyde reductase  25.35 
 
 
382 aa  118  9.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  25.28 
 
 
382 aa  116  6e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.86 
 
 
384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  26.14 
 
 
382 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5309  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.31 
 
 
353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.203818  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2250  alcohol dehydrogenase, iron-containing  26.65 
 
 
400 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32939e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2066  alcohol dehydrogenase, iron-containing  26.65 
 
 
400 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.904837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2006  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.65 
 
 
400 aa  114  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.857021  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2802  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.75 
 
 
395 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1851  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.77 
 
 
383 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6061  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.72 
 
 
352 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2222  alcohol dehydrogenase  26.67 
 
 
392 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2082  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.18 
 
 
388 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6463  Iron-containing alcohol dehydrogenase  29.14 
 
 
354 aa  113  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0443  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  28.73 
 
 
858 aa  113  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1839  L-1,2-propanediol oxidoreductase  27.25 
 
 
383 aa  112  7.000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1786  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.83 
 
 
388 aa  112  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  28.65 
 
 
383 aa  112  9e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0080  alcohol dehydrogenase, iron-containing  24.72 
 
 
384 aa  112  9e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2334  alcohol dehydrogenase, iron-containing  26.36 
 
 
400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0717342  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0153  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.46 
 
 
396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.264412  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2322  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  27.11 
 
 
904 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1083  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.85 
 
 
381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.458923  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.5 
 
 
389 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3258  phosphonate metabolism-associated iron-containing alcohol dehydrogenase  30 
 
 
401 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.423792  normal  0.216617 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2252  alcohol dehydrogenase, iron-containing  25.86 
 
 
400 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.366861  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2005  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.86 
 
 
400 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000571381  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0927  L-1,2-propanediol oxidoreductase  25.29 
 
 
382 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0355578  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5825  homogentisate 1,2-dioxygenase  32.88 
 
 
848 aa  109  8.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0876183  normal  0.90273 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1046  L-1,2-propanediol oxidoreductase  25.58 
 
 
382 aa  109  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.968246  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0772  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  25.33 
 
 
887 aa  109  8.000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.24171 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  28.7 
 
 
382 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0813  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.19 
 
 
387 aa  108  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.112525  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0836  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.19 
 
 
387 aa  108  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  24.39 
 
 
382 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  24.39 
 
 
382 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.35 
 
 
382 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.35 
 
 
382 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3279  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.65 
 
 
378 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0521  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.45 
 
 
383 aa  107  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000118982 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  25.94 
 
 
381 aa  107  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.15 
 
 
390 aa  106  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1990  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.1 
 
 
390 aa  106  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352675  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0177  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.89 
 
 
383 aa  106  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000105782  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1421  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.36 
 
 
378 aa  106  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1756  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.75 
 
 
377 aa  106  6e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0953887  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1052  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.47 
 
 
872 aa  106  6e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.05 
 
 
382 aa  106  6e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.57 
 
 
384 aa  106  7e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6451  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.25 
 
 
377 aa  106  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0514  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.46 
 
 
387 aa  105  8e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0174269  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6471  Iron-containing alcohol dehydrogenase  37.1 
 
 
359 aa  105  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.312726  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  26.33 
 
 
382 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1632  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.28 
 
 
383 aa  105  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0621  L-1,2-propanediol oxidoreductase  27.73 
 
 
383 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.529612  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0767  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.1 
 
 
406 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1464  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.21 
 
 
375 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3316  L-1,2-propanediol oxidoreductase  26.24 
 
 
383 aa  104  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>