More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1062 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1062  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
314 aa  639    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1051  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.44 
 
 
340 aa  129  8.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0705172  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5309  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.33 
 
 
379 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0885  alcohol dehydrogenase, iron-containing  30.77 
 
 
376 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4484  Iron-containing alcohol dehydrogenase  29.85 
 
 
355 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4409  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.6 
 
 
417 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.417322  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1325  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.22 
 
 
355 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.397668 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4699  Iron-containing alcohol dehydrogenase  32.57 
 
 
380 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3335  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.84 
 
 
358 aa  102  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.330592  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2275  propanol dehydrogenase  29.93 
 
 
370 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0229422 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2229  propanediol utilization: propanol dehydrogenase  29.74 
 
 
370 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176556  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2063  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.06 
 
 
352 aa  100  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00184979  normal  0.72371 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2175  propanediol utilization: propanol dehydrogenase  29.67 
 
 
370 aa  99  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5421  iron-containing alcohol dehydrogenase  33 
 
 
372 aa  98.6  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2222  propanol dehydrogenase  29.56 
 
 
370 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.806517 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05178  maleylacetate reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07090)  27.76 
 
 
357 aa  97.8  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.516162  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2388  propanediol utilization: propanol dehydrogenase  29.37 
 
 
370 aa  97.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2650  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.89 
 
 
376 aa  95.1  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0837  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.03 
 
 
356 aa  94.4  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1126  maleylacetate reductase  27.68 
 
 
352 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499369  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2293  propanediol utilization protein PduQ  26.73 
 
 
370 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4891  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.95 
 
 
356 aa  93.6  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.592699  normal  0.0411098 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1369  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.5 
 
 
368 aa  93.6  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2455  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.37 
 
 
392 aa  93.2  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1418  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.48 
 
 
351 aa  92.8  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.93105 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1050  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.26 
 
 
373 aa  92.4  9e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5982  Iron-containing alcohol dehydrogenase  32.16 
 
 
372 aa  92  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.306668  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4129  Iron-containing alcohol dehydrogenase  26.56 
 
 
357 aa  91.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5141  putative alcohol dehydrogenase  25.57 
 
 
386 aa  92  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237581  normal  0.0395804 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5063  maleylacetate reductase  28.99 
 
 
355 aa  90.5  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0529248  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1589  Iron-containing alcohol dehydrogenase  27.76 
 
 
355 aa  90.1  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0904  Iron-containing alcohol dehydrogenase  23.92 
 
 
386 aa  89.4  8e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.445883  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5309  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.44 
 
 
353 aa  89.4  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.203818  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3908  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.38 
 
 
362 aa  88.6  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0347674 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00437  Iron-containing alcohol dehydrogenase  27.04 
 
 
382 aa  87.8  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000107236  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3279  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.33 
 
 
378 aa  87.8  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6061  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.34 
 
 
352 aa  87  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5062  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.62 
 
 
352 aa  87.4  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6463  Iron-containing alcohol dehydrogenase  26.02 
 
 
354 aa  87  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4611  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.39 
 
 
353 aa  86.7  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.557195  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4672  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.87 
 
 
363 aa  86.3  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3267  alcetaldehyde dehydrogenase or NADPH-dependent butanol dehydrogenase  27.76 
 
 
369 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1421  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.58 
 
 
378 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.75 
 
 
389 aa  84.3  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7440  maleylacetate reductase  29.7 
 
 
357 aa  83.6  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0198  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.57 
 
 
370 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3908  maleylacetate reductase  27.41 
 
 
355 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6132  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.21 
 
 
355 aa  82.8  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.980292  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2737  Iron-containing alcohol dehydrogenase  28.04 
 
 
355 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.413551  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0834  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.24 
 
 
380 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.161806 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0330  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.49 
 
 
380 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.397984 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0627  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  24.83 
 
 
872 aa  78.2  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02110  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  24.75 
 
 
887 aa  79  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4103  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.74 
 
 
371 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6071  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.84 
 
 
355 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5623  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.3 
 
 
355 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3377  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.84 
 
 
355 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  27.88 
 
 
382 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1006  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.83 
 
 
377 aa  77.4  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1734  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.91 
 
 
373 aa  76.6  0.0000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0425  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.28 
 
 
386 aa  77  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5215  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.47 
 
 
355 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05234  Fe-containing alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06800)  30 
 
 
414 aa  76.6  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.868028  normal  0.105972 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4592  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.77 
 
 
354 aa  76.3  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  27.51 
 
 
382 aa  76.3  0.0000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6471  Iron-containing alcohol dehydrogenase  24.07 
 
 
359 aa  75.9  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.312726  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4085  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.94 
 
 
355 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0871083  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02344  predicted alcohol dehydrogenase in ethanolamine utilization  30.14 
 
 
395 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1217  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.14 
 
 
395 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2582  ethanolamine utilization protein EutG  30.14 
 
 
395 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3674  ethanolamine utilization protein EutG  30.14 
 
 
395 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2599  ethanolamine utilization protein EutG  30.14 
 
 
395 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1224  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.14 
 
 
395 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02306  hypothetical protein  30.14 
 
 
395 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4574  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.67 
 
 
354 aa  75.1  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.807648 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0853  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.26 
 
 
387 aa  74.3  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.346156 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4694  Iron-containing alcohol dehydrogenase  25.31 
 
 
352 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0202  iron-containing alcohol dehydrogenase  23.67 
 
 
380 aa  74.7  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2077  Iron-containing alcohol dehydrogenase  26.87 
 
 
385 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0974208  normal  0.438292 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2478  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.9 
 
 
395 aa  75.1  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1960  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.97 
 
 
355 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.929327  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1265  NADPH-dependent butanol dehydrogenase  28.42 
 
 
388 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00856884  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2730  ethanolamine utilization protein EutG  30.14 
 
 
395 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3919  alcohol dehydrogenase  26.99 
 
 
385 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0768529  normal  0.635531 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3534  alcohol dehydrogenase, iron-containing  25.21 
 
 
380 aa  73.9  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1465  NADPH-dependent butanol dehydrogenase  28.37 
 
 
388 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3432  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.57 
 
 
355 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4453  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  25.27 
 
 
867 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.657364  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1536  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.8 
 
 
388 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4504  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  27.16 
 
 
867 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6293  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.8 
 
 
388 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.488488 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6952  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.8 
 
 
388 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1426  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.36 
 
 
396 aa  73.2  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2250  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.62 
 
 
387 aa  73.2  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.432812 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0379  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  26.98 
 
 
881 aa  72.8  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5727  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.66 
 
 
352 aa  72.8  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5540  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.59 
 
 
352 aa  72.8  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0827042  hitchhiker  0.0000079765 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0907  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.69 
 
 
387 aa  72.8  0.000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4405  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.1 
 
 
351 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162053  normal  0.536437 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3412  alcohol dehydrogenase  27.78 
 
 
385 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.117335 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>