More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0202 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0202  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 380 aa  780    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3534  alcohol dehydrogenase, iron-containing  64.47 
 
 		 380 aa  508  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0834  iron-containing alcohol dehydrogenase  62.11 
 
 		 380 aa  486  1e-136  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.161806 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0330  iron-containing alcohol dehydrogenase  61.32 
 
 		 380 aa  481  1e-135  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.397984 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3325  iron-containing alcohol dehydrogenase  57.89 
 
 		 380 aa  457  1e-127  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.961495  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0257  alcohol dehydrogenase, class IV  43.34 
 
 		 383 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1053  Iron-containing alcohol dehydrogenase  44.95 
 
 		 382 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489581 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2234  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.15 
 
 		 382 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10038 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1986  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.54 
 
 		 382 aa  315  7e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3574  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.38 
 
 		 387 aa  311  9e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.882397  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2961  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.13 
 
 		 388 aa  302  8.000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.813406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2389  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.88 
 
 		 382 aa  295  8e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00204044  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2276  iron-containing alcohol dehydrogenase  40 
 
 		 388 aa  290  3e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.751184  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3532  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.42 
 
 		 388 aa  279  8e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0171  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.5 
 
 		 403 aa  268  1e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2726  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.73 
 
 		 385 aa  268  2e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4944  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.99 
 
 		 410 aa  264  2e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1164  alcohol dehydrogenase, iron-containing  38.42 
 
 		 388 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0466  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.15 
 
 		 384 aa  260  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1499  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.46 
 
 		 380 aa  261  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  37.74 
 
 		 382 aa  259  5.0000000000000005e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0567  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.5 
 
 		 383 aa  255  9e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0767  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.37 
 
 		 406 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3965  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.01 
 
 		 386 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000175274 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.37 
 
 		 387 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2250  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.81 
 
 		 387 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.432812 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1138  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.07 
 
 		 379 aa  252  7e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0514  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.96 
 
 		 387 aa  251  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0174269  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0143  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.75 
 
 		 387 aa  251  2e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00576851  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3877  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.01 
 
 		 386 aa  250  3e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0990  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.18 
 
 		 386 aa  250  3e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.71484 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  35.53 
 
 		 382 aa  249  6e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2277  iron-containing alcohol dehydrogenase  40 
 
 		 388 aa  249  8e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  37.23 
 
 		 388 aa  248  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  35.53 
 
 		 382 aa  248  1e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0702  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.62 
 
 		 386 aa  248  1e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.149133 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2420  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.9 
 
 		 387 aa  247  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  35.42 
 
 		 382 aa  247  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1046  Iron-containing alcohol dehydrogenase  38.11 
 
 		 387 aa  247  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0545646  hitchhiker  0.000000369007 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3303  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  36.34 
 
 		 387 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284133  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3987  Iron-containing alcohol dehydrogenase  37.47 
 
 		 382 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0251  alcohol dehydrogenase, class IV  37.67 
 
 		 390 aa  244  9.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.99 
 
 		 383 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.01 
 
 		 387 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0887  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.08 
 
 		 387 aa  244  9.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000472566  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4285  alcohol dehydrogenase II  36.55 
 
 		 382 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.01 
 
 		 387 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0554  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.03 
 
 		 387 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1196  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.29 
 
 		 387 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38750  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  36.34 
 
 		 387 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1311  Iron-containing alcohol dehydrogenase  36.76 
 
 		 382 aa  241  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5476  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.73 
 
 		 402 aa  241  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.377553  normal  0.588653 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  36.22 
 
 		 382 aa  239  4e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1934  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.41 
 
 		 386 aa  239  5.999999999999999e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.586861  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2865  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.27 
 
 		 402 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.452469  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1594  alcohol dehydrogenase, class IV  37.14 
 
 		 390 aa  238  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1398  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.8 
 
 		 383 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145523  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.86 
 
 		 382 aa  238  2e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.71 
 
 		 382 aa  236  4e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1971  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.07 
 
 		 387 aa  236  4e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.13542  normal  0.138356 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0321  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.16 
 
 		 393 aa  236  6e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.529761 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  34.83 
 
 		 381 aa  235  7e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  37.53 
 
 		 383 aa  236  7e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0825  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.9 
 
 		 393 aa  235  8e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.313783  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2682  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.19 
 
 		 387 aa  235  9e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3080  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.19 
 
 		 387 aa  235  9e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1636  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.43 
 
 		 387 aa  235  1.0000000000000001e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000919335 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0255  alcohol dehydrogenase, class IV  36.07 
 
 		 390 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3121  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.19 
 
 		 387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00478821  normal  0.275447 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2578  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.62 
 
 		 382 aa  234  3e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2001  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.49 
 
 		 387 aa  233  5e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.62 
 
 		 382 aa  231  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4160  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.75 
 
 		 383 aa  231  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.98 
 
 		 382 aa  230  3e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.08 
 
 		 384 aa  229  4e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.45 
 
 		 382 aa  230  4e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134341 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2430  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.87 
 
 		 384 aa  229  5e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.71 
 
 		 382 aa  229  6e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.71 
 
 		 382 aa  229  6e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1359  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.19 
 
 		 382 aa  228  9e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.759734  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1851  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.6 
 
 		 383 aa  228  1e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.24 
 
 		 393 aa  228  1e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1490  alcohol dehydrogenase II  35.71 
 
 		 382 aa  227  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1152  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.45 
 
 		 382 aa  226  4e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.305094  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.21 
 
 		 383 aa  225  8e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1943  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.78 
 
 		 399 aa  225  9e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2335  alcohol dehydrogenase, iron-containing  38.04 
 
 		 637 aa  224  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.359123  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0142  putative alcohol dehydrogenase  35.26 
 
 		 383 aa  224  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.555201  normal  0.893326 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.66 
 
 		 382 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1011  1,3-propanediol dehydrogenase  32.47 
 
 		 385 aa  223  3e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000128902  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1180  1,3-propanediol dehydrogenase  32.47 
 
 		 385 aa  223  4e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.440796  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3038  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.83 
 
 		 382 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1312  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.83 
 
 		 382 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3881  putative alcohol dehydrogenase  34.82 
 
 		 383 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.656284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1348  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.66 
 
 		 382 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4231  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.11 
 
 		 383 aa  223  6e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.995734  hitchhiker  0.000246581 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3523  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.07 
 
 		 393 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.99 
 
 		 389 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1839  L-1,2-propanediol oxidoreductase  33.6 
 
 		 383 aa  221  9.999999999999999e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3658  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.6 
 
 		 383 aa  222  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>