More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1589 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1589  Iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 355 aa  712    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2063  iron-containing alcohol dehydrogenase  66.95 
 
 		 352 aa  476  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00184979  normal  0.72371 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3908  iron-containing alcohol dehydrogenase  64.96 
 
 		 362 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0347674 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0837  iron-containing alcohol dehydrogenase  64.49 
 
 		 356 aa  446  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4129  Iron-containing alcohol dehydrogenase  63.94 
 
 		 357 aa  436  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5309  iron-containing alcohol dehydrogenase  62.71 
 
 		 353 aa  436  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.203818  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3335  iron-containing alcohol dehydrogenase  61.19 
 
 		 358 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.330592  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4484  Iron-containing alcohol dehydrogenase  61.82 
 
 		 355 aa  421  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1325  iron-containing alcohol dehydrogenase  62.11 
 
 		 355 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.397668 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6132  iron-containing alcohol dehydrogenase  64.53 
 
 		 355 aa  411  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.980292  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6071  iron-containing alcohol dehydrogenase  59.1 
 
 		 355 aa  411  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6061  iron-containing alcohol dehydrogenase  61.86 
 
 		 352 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4085  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.82 
 
 		 355 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0871083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4611  iron-containing alcohol dehydrogenase  59.44 
 
 		 353 aa  401  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.557195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3432  iron-containing alcohol dehydrogenase  57.98 
 
 		 355 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4694  Iron-containing alcohol dehydrogenase  58.19 
 
 		 352 aa  395  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2737  Iron-containing alcohol dehydrogenase  58.54 
 
 		 355 aa  391  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.413551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3377  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.54 
 
 		 355 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5215  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.26 
 
 		 355 aa  388  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6463  Iron-containing alcohol dehydrogenase  54.52 
 
 		 354 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5623  iron-containing alcohol dehydrogenase  57.42 
 
 		 355 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1418  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.11 
 
 		 351 aa  375  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.93105 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5063  maleylacetate reductase  56.02 
 
 		 355 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0529248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1126  maleylacetate reductase  51.7 
 
 		 352 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7440  maleylacetate reductase  52.31 
 
 		 357 aa  355  5.999999999999999e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05178  maleylacetate reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07090)  50.85 
 
 		 357 aa  354  1e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.516162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5727  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.56 
 
 		 352 aa  354  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3908  maleylacetate reductase  53.78 
 
 		 355 aa  350  2e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5540  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.12 
 
 		 352 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0827042  hitchhiker  0.0000079765 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4891  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.28 
 
 		 356 aa  335  7.999999999999999e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.592699  normal  0.0411098 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5062  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.83 
 
 		 352 aa  323  3e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1960  iron-containing alcohol dehydrogenase  56.78 
 
 		 355 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.929327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6471  Iron-containing alcohol dehydrogenase  48.27 
 
 		 359 aa  273  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.312726  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4574  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.86 
 
 		 354 aa  269  5e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.807648 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4592  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.2 
 
 		 354 aa  268  8.999999999999999e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4405  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.63 
 
 		 351 aa  267  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162053  normal  0.536437 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1936  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.82 
 
 		 358 aa  262  8e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4565  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.78 
 
 		 358 aa  243  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.573153 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4672  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.34 
 
 		 363 aa  241  1e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5825  homogentisate 1,2-dioxygenase  44.08 
 
 		 848 aa  238  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0876183  normal  0.90273 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4409  iron-containing alcohol dehydrogenase  29 
 
 		 417 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.417322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5309  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.18 
 
 		 379 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1051  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.75 
 
 		 340 aa  138  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0705172  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  28.69 
 
 		 381 aa  136  5e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  27.54 
 
 		 382 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.19 
 
 		 389 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.95 
 
 		 387 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4348  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.68 
 
 		 385 aa  133  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.159902  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  28.42 
 
 		 382 aa  133  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4699  Iron-containing alcohol dehydrogenase  27.64 
 
 		 380 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2290  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.89 
 
 		 394 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000188362  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.79 
 
 		 393 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1046  Iron-containing alcohol dehydrogenase  29.81 
 
 		 387 aa  130  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0545646  hitchhiker  0.000000369007 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.33 
 
 		 387 aa  130  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.59 
 
 		 384 aa  129  6e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  30.41 
 
 		 382 aa  129  8.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  26.74 
 
 		 382 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2681  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.12 
 
 		 405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02644  L-1,2-propanediol oxidoreductase  28.99 
 
 		 383 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0889  lactaldehyde reductase  28.99 
 
 		 382 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4063  L-1,2-propanediol oxidoreductase  28.99 
 
 		 383 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3104  L-1,2-propanediol oxidoreductase  28.99 
 
 		 382 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.189679  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02606  hypothetical protein  28.99 
 
 		 383 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2939  L-1,2-propanediol oxidoreductase  28.99 
 
 		 383 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.284503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2943  L-1,2-propanediol oxidoreductase  28.99 
 
 		 382 aa  127  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.27 
 
 		 382 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1261  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.67 
 
 		 381 aa  126  5e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.528177  normal  0.0459015 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  27.3 
 
 		 382 aa  126  5e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  27.3 
 
 		 382 aa  126  6e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3181  L-1,2-propanediol oxidoreductase  27.66 
 
 		 382 aa  126  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.292144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2082  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.12 
 
 		 388 aa  125  8.000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1786  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.87 
 
 		 388 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2420  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.17 
 
 		 387 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3116  L-1,2-propanediol oxidoreductase  27.66 
 
 		 382 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.303713  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0913  L-1,2-propanediol oxidoreductase  28.72 
 
 		 383 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3296  L-1,2-propanediol oxidoreductase  27.66 
 
 		 382 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.34 
 
 		 382 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.34 
 
 		 382 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3196  L-1,2-propanediol oxidoreductase  27.66 
 
 		 382 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3133  L-1,2-propanediol oxidoreductase  27.66 
 
 		 382 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.708471  normal  0.183731 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1071  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.9 
 
 		 358 aa  123  4e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1152  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.07 
 
 		 382 aa  123  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.305094  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.54 
 
 		 382 aa  123  4e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1011  1,3-propanediol dehydrogenase  27.44 
 
 		 385 aa  123  4e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000128902  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0837  L-1,2-propanediol oxidoreductase  26.53 
 
 		 383 aa  123  5e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0885  alcohol dehydrogenase, iron-containing  26.3 
 
 		 376 aa  123  5e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1180  1,3-propanediol dehydrogenase  27.44 
 
 		 385 aa  123  6e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.440796  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.07 
 
 		 382 aa  122  7e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1851  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.09 
 
 		 383 aa  122  8e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.93 
 
 		 387 aa  122  9e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2277  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.78 
 
 		 388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0927  L-1,2-propanediol oxidoreductase  26.39 
 
 		 382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0355578  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0887  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.36 
 
 		 387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000472566  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0030  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.99 
 
 		 390 aa  120  3e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000706289  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3316  L-1,2-propanediol oxidoreductase  27.2 
 
 		 383 aa  120  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1481  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.49 
 
 		 382 aa  120  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1495  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.98 
 
 		 393 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102085  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2455  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.37 
 
 		 392 aa  120  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  29.14 
 
 		 383 aa  119  6e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.61 
 
 		 382 aa  119  6e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134341 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>