More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4694 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4694  Iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
352 aa  698    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2063  iron-containing alcohol dehydrogenase  61.54 
 
 
352 aa  434  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00184979  normal  0.72371 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5309  iron-containing alcohol dehydrogenase  63.82 
 
 
353 aa  432  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.203818  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3335  iron-containing alcohol dehydrogenase  62.36 
 
 
358 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.330592  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0837  iron-containing alcohol dehydrogenase  62.07 
 
 
356 aa  421  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4129  Iron-containing alcohol dehydrogenase  61.65 
 
 
357 aa  422  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4611  iron-containing alcohol dehydrogenase  62.68 
 
 
353 aa  419  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.557195  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1589  Iron-containing alcohol dehydrogenase  58.19 
 
 
355 aa  414  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3432  iron-containing alcohol dehydrogenase  62.15 
 
 
355 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4085  iron-containing alcohol dehydrogenase  61.58 
 
 
355 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0871083  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6071  iron-containing alcohol dehydrogenase  60.73 
 
 
355 aa  411  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5063  maleylacetate reductase  61.41 
 
 
355 aa  411  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0529248  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4484  Iron-containing alcohol dehydrogenase  61.89 
 
 
355 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6132  iron-containing alcohol dehydrogenase  64.69 
 
 
355 aa  409  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.980292  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1325  iron-containing alcohol dehydrogenase  61.03 
 
 
355 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.397668 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3377  iron-containing alcohol dehydrogenase  61.86 
 
 
355 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5215  iron-containing alcohol dehydrogenase  62.71 
 
 
355 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3908  iron-containing alcohol dehydrogenase  57.47 
 
 
362 aa  397  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0347674 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2737  Iron-containing alcohol dehydrogenase  59.6 
 
 
355 aa  394  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.413551  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5623  iron-containing alcohol dehydrogenase  59.89 
 
 
355 aa  388  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6061  iron-containing alcohol dehydrogenase  59.83 
 
 
352 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1126  maleylacetate reductase  56.4 
 
 
352 aa  375  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499369  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3908  maleylacetate reductase  59.6 
 
 
355 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1418  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.42 
 
 
351 aa  369  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.93105 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4891  iron-containing alcohol dehydrogenase  56.32 
 
 
356 aa  371  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.592699  normal  0.0411098 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05178  maleylacetate reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07090)  49.29 
 
 
357 aa  344  1e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.516162  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6463  Iron-containing alcohol dehydrogenase  48.72 
 
 
354 aa  340  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7440  maleylacetate reductase  49.71 
 
 
357 aa  333  3e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5062  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.29 
 
 
352 aa  328  9e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5727  iron-containing alcohol dehydrogenase  49.28 
 
 
352 aa  318  7.999999999999999e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1960  iron-containing alcohol dehydrogenase  56.98 
 
 
355 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.929327  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5540  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.55 
 
 
352 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0827042  hitchhiker  0.0000079765 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4405  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.29 
 
 
351 aa  298  1e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162053  normal  0.536437 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6471  Iron-containing alcohol dehydrogenase  49.44 
 
 
359 aa  296  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.312726  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4574  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.4 
 
 
354 aa  272  7e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.807648 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4592  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.86 
 
 
354 aa  271  1e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1936  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.31 
 
 
358 aa  266  5e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4672  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.29 
 
 
363 aa  257  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4565  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.29 
 
 
358 aa  254  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.573153 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5825  homogentisate 1,2-dioxygenase  45.98 
 
 
848 aa  252  6e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0876183  normal  0.90273 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4409  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.89 
 
 
417 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.417322  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5309  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.16 
 
 
379 aa  142  9e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4699  Iron-containing alcohol dehydrogenase  30.71 
 
 
380 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1786  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.71 
 
 
388 aa  139  7e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2082  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.2 
 
 
388 aa  139  8.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1051  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.39 
 
 
340 aa  132  6.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0705172  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.86 
 
 
389 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  28.46 
 
 
382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2455  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.47 
 
 
392 aa  130  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2681  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.61 
 
 
405 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.19 
 
 
382 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1756  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.8 
 
 
377 aa  127  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0953887  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1490  alcohol dehydrogenase II  30.91 
 
 
382 aa  126  7e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  27.37 
 
 
382 aa  125  8.000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1261  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.05 
 
 
381 aa  125  9e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.528177  normal  0.0459015 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2803  1,3-propanediol dehydrogenase  30.03 
 
 
394 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2277  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.37 
 
 
388 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.19 
 
 
382 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  27.09 
 
 
382 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1348  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.19 
 
 
382 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.01 
 
 
382 aa  124  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3038  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.19 
 
 
382 aa  123  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219975  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1312  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.19 
 
 
382 aa  123  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1164  alcohol dehydrogenase, iron-containing  27.81 
 
 
388 aa  122  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.01 
 
 
382 aa  122  7e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.01 
 
 
382 aa  122  7e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3267  alcetaldehyde dehydrogenase or NADPH-dependent butanol dehydrogenase  29.62 
 
 
369 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4348  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.61 
 
 
385 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.159902  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1336  1,3-propanediol dehydrogenase  32.53 
 
 
390 aa  122  9.999999999999999e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0885  alcohol dehydrogenase, iron-containing  25.94 
 
 
376 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.76 
 
 
393 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2430  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.88 
 
 
384 aa  120  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.15 
 
 
387 aa  120  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.15 
 
 
387 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1046  Iron-containing alcohol dehydrogenase  30.85 
 
 
387 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0545646  hitchhiker  0.000000369007 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1636  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.07 
 
 
387 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000919335 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1180  1,3-propanediol dehydrogenase  29.05 
 
 
385 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.440796  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1011  1,3-propanediol dehydrogenase  29.05 
 
 
385 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000128902  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.61 
 
 
382 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  30.06 
 
 
382 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1071  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.38 
 
 
358 aa  120  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6952  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.98 
 
 
388 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2836  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.62 
 
 
380 aa  119  7e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  29.39 
 
 
382 aa  119  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3532  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.36 
 
 
388 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.68 
 
 
384 aa  119  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  29.49 
 
 
383 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13900  Iron-containing alcohol dehydrogenase  31.54 
 
 
386 aa  119  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00279166  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  27.61 
 
 
382 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1943  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.96 
 
 
399 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4549  iron-containing alcohol dehydrogenase  29 
 
 
381 aa  119  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2398  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.68 
 
 
391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1851  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.82 
 
 
383 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0825  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.22 
 
 
393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.313783  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1481  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.53 
 
 
382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1152  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.58 
 
 
382 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.305094  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0887  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.31 
 
 
387 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000472566  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.43 
 
 
382 aa  117  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0514  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.11 
 
 
387 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0174269  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1369  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.07 
 
 
368 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>