More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1936 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1936  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
358 aa  712    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4565  iron-containing alcohol dehydrogenase  82.35 
 
 
358 aa  547  1e-154  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.573153 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4574  iron-containing alcohol dehydrogenase  67.34 
 
 
354 aa  439  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.807648 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4592  iron-containing alcohol dehydrogenase  66.19 
 
 
354 aa  429  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4405  iron-containing alcohol dehydrogenase  60.11 
 
 
351 aa  391  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162053  normal  0.536437 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4672  iron-containing alcohol dehydrogenase  60.92 
 
 
363 aa  381  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3335  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.15 
 
 
358 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.330592  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4129  Iron-containing alcohol dehydrogenase  47.83 
 
 
357 aa  282  6.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4484  Iron-containing alcohol dehydrogenase  47.37 
 
 
355 aa  280  4e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1325  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.66 
 
 
355 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.397668 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4611  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.54 
 
 
353 aa  275  6e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.557195  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4891  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.48 
 
 
356 aa  271  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.592699  normal  0.0411098 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5309  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.02 
 
 
353 aa  268  8e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.203818  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2063  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.15 
 
 
352 aa  268  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00184979  normal  0.72371 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1589  Iron-containing alcohol dehydrogenase  43.82 
 
 
355 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6463  Iron-containing alcohol dehydrogenase  41.62 
 
 
354 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2737  Iron-containing alcohol dehydrogenase  45.24 
 
 
355 aa  265  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.413551  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3908  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.73 
 
 
362 aa  265  1e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0347674 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0837  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.48 
 
 
356 aa  264  2e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4694  Iron-containing alcohol dehydrogenase  46.31 
 
 
352 aa  260  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3432  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.51 
 
 
355 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3908  maleylacetate reductase  45.89 
 
 
355 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5063  maleylacetate reductase  45.48 
 
 
355 aa  256  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0529248  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6071  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.22 
 
 
355 aa  255  8e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5623  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.09 
 
 
355 aa  253  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4085  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.93 
 
 
355 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0871083  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3377  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.93 
 
 
355 aa  246  4e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6132  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.74 
 
 
355 aa  245  9e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.980292  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5215  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.22 
 
 
355 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7440  maleylacetate reductase  40.64 
 
 
357 aa  238  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6061  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.3 
 
 
352 aa  236  7e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5062  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.96 
 
 
352 aa  235  7e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05178  maleylacetate reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07090)  37.04 
 
 
357 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.516162  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5727  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.6 
 
 
352 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1418  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.47 
 
 
351 aa  231  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.93105 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6471  Iron-containing alcohol dehydrogenase  43.19 
 
 
359 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.312726  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1960  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.43 
 
 
355 aa  220  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.929327  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1126  maleylacetate reductase  40.58 
 
 
352 aa  220  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499369  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5540  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.47 
 
 
352 aa  206  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0827042  hitchhiker  0.0000079765 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5825  homogentisate 1,2-dioxygenase  37.57 
 
 
848 aa  188  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0876183  normal  0.90273 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1756  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.18 
 
 
377 aa  133  5e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0953887  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0837  L-1,2-propanediol oxidoreductase  27.15 
 
 
383 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03444  predicted Fe-containing alcohol dehydrogenase  28.06 
 
 
383 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0119  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.06 
 
 
383 aa  125  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03395  hypothetical protein  28.06 
 
 
383 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4087  putative alcohol dehydrogenase  28.06 
 
 
383 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3794  putative alcohol dehydrogenase  28.06 
 
 
383 aa  124  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3917  putative alcohol dehydrogenase  28.06 
 
 
383 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0124  putative alcohol dehydrogenase  28.06 
 
 
383 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4960  putative alcohol dehydrogenase  28.06 
 
 
383 aa  124  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2781  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.74 
 
 
398 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409479  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4004  putative alcohol dehydrogenase  27.5 
 
 
383 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3438  L-1,2-propanediol oxidoreductase  27.42 
 
 
383 aa  119  9e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2681  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.64 
 
 
405 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0621  L-1,2-propanediol oxidoreductase  26.75 
 
 
383 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.529612  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1071  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.21 
 
 
358 aa  117  3e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.32 
 
 
389 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3439  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.03 
 
 
383 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.928685  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3881  putative alcohol dehydrogenase  26.39 
 
 
383 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.656284  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  27.01 
 
 
381 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2317  Iron-containing alcohol dehydrogenase  30.85 
 
 
381 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.735115  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4409  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.78 
 
 
417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.417322  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0991  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.85 
 
 
381 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260601  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2836  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.53 
 
 
380 aa  115  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4348  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.49 
 
 
385 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.159902  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2082  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.44 
 
 
388 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2599  ethanolamine utilization protein EutG  31.96 
 
 
395 aa  114  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1495  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.27 
 
 
393 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102085  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4373  lactaldehyde reductase  29.26 
 
 
382 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4258  lactaldehyde reductase  29.26 
 
 
382 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4074  lactaldehyde reductase  29.45 
 
 
382 aa  114  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5141  putative alcohol dehydrogenase  27.78 
 
 
386 aa  113  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237581  normal  0.0395804 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4287  lactaldehyde reductase  29.26 
 
 
382 aa  113  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.2 
 
 
384 aa  113  6e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4439  lactaldehyde reductase  29.26 
 
 
382 aa  113  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5309  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.12 
 
 
379 aa  113  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1839  L-1,2-propanediol oxidoreductase  26.7 
 
 
383 aa  113  6e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3674  ethanolamine utilization protein EutG  31.96 
 
 
395 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02344  predicted alcohol dehydrogenase in ethanolamine utilization  31.62 
 
 
395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4327  lactaldehyde reductase  29.26 
 
 
382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.238519 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  25.94 
 
 
382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2582  ethanolamine utilization protein EutG  31.62 
 
 
395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1224  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.62 
 
 
395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2455  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.15 
 
 
392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02306  hypothetical protein  31.62 
 
 
395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2819  ethanolamine utilization protein EutG  31.62 
 
 
395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1311  Iron-containing alcohol dehydrogenase  28.43 
 
 
382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0172  alcohol dehydrogenase  30.91 
 
 
388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1046  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.53 
 
 
382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1217  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.27 
 
 
395 aa  110  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1851  iron-containing alcohol dehydrogenase  25 
 
 
383 aa  110  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5260  alcohol dehydrogenase  27.82 
 
 
399 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.926776 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.8 
 
 
382 aa  110  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.020336  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0063  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.83 
 
 
379 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  25.76 
 
 
382 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2730  ethanolamine utilization protein EutG  31.62 
 
 
395 aa  110  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1481  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.8 
 
 
382 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2495  lactaldehyde reductase  24.27 
 
 
382 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3316  L-1,2-propanediol oxidoreductase  25.97 
 
 
383 aa  109  6e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  25.48 
 
 
382 aa  109  6e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>