More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2063 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2063  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
352 aa  706    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00184979  normal  0.72371 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3908  iron-containing alcohol dehydrogenase  72.78 
 
 
362 aa  521  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0347674 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0837  iron-containing alcohol dehydrogenase  72.7 
 
 
356 aa  508  1e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6132  iron-containing alcohol dehydrogenase  74.93 
 
 
355 aa  496  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.980292  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3335  iron-containing alcohol dehydrogenase  69.25 
 
 
358 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.330592  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4484  Iron-containing alcohol dehydrogenase  70.98 
 
 
355 aa  480  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1325  iron-containing alcohol dehydrogenase  70.98 
 
 
355 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.397668 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1589  Iron-containing alcohol dehydrogenase  66.95 
 
 
355 aa  476  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5309  iron-containing alcohol dehydrogenase  68.09 
 
 
353 aa  474  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.203818  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4129  Iron-containing alcohol dehydrogenase  68.47 
 
 
357 aa  473  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6061  iron-containing alcohol dehydrogenase  68.47 
 
 
352 aa  442  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6071  iron-containing alcohol dehydrogenase  62.71 
 
 
355 aa  436  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4611  iron-containing alcohol dehydrogenase  64.96 
 
 
353 aa  434  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.557195  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2737  Iron-containing alcohol dehydrogenase  62.71 
 
 
355 aa  428  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.413551  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5215  iron-containing alcohol dehydrogenase  64.51 
 
 
355 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3432  iron-containing alcohol dehydrogenase  62.71 
 
 
355 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4085  iron-containing alcohol dehydrogenase  62.15 
 
 
355 aa  424  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0871083  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3377  iron-containing alcohol dehydrogenase  63.66 
 
 
355 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5063  maleylacetate reductase  61.41 
 
 
355 aa  422  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0529248  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4694  Iron-containing alcohol dehydrogenase  61.54 
 
 
352 aa  419  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5623  iron-containing alcohol dehydrogenase  60.85 
 
 
355 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6463  Iron-containing alcohol dehydrogenase  54.42 
 
 
354 aa  391  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1126  maleylacetate reductase  57.93 
 
 
352 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499369  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1418  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.42 
 
 
351 aa  388  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.93105 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3908  maleylacetate reductase  59.72 
 
 
355 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5727  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.89 
 
 
352 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7440  maleylacetate reductase  54 
 
 
357 aa  368  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5540  iron-containing alcohol dehydrogenase  55.27 
 
 
352 aa  361  8e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0827042  hitchhiker  0.0000079765 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05178  maleylacetate reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07090)  52.57 
 
 
357 aa  357  9.999999999999999e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.516162  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4891  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.15 
 
 
356 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.592699  normal  0.0411098 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1960  iron-containing alcohol dehydrogenase  59.09 
 
 
355 aa  326  3e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.929327  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5062  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.44 
 
 
352 aa  326  3e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6471  Iron-containing alcohol dehydrogenase  51.27 
 
 
359 aa  310  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.312726  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4405  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.71 
 
 
351 aa  273  3e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162053  normal  0.536437 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4574  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.56 
 
 
354 aa  272  5.000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.807648 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5825  homogentisate 1,2-dioxygenase  45.11 
 
 
848 aa  267  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0876183  normal  0.90273 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1936  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.87 
 
 
358 aa  267  2e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4592  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.43 
 
 
354 aa  261  1e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4672  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.57 
 
 
363 aa  247  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4565  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.29 
 
 
358 aa  231  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.573153 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4409  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.18 
 
 
417 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.417322  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1786  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.77 
 
 
388 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1051  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.97 
 
 
340 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0705172  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  26.93 
 
 
382 aa  133  5e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.61 
 
 
389 aa  133  6e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  26.93 
 
 
382 aa  132  7.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5309  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.84 
 
 
379 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2681  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.43 
 
 
405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2082  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.5 
 
 
388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4699  Iron-containing alcohol dehydrogenase  29.32 
 
 
380 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1481  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 
382 aa  130  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1311  Iron-containing alcohol dehydrogenase  29.1 
 
 
382 aa  129  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  26.93 
 
 
382 aa  129  7.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  27.97 
 
 
382 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3267  alcetaldehyde dehydrogenase or NADPH-dependent butanol dehydrogenase  29.49 
 
 
369 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.11 
 
 
387 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.72 
 
 
382 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.47 
 
 
383 aa  124  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  28 
 
 
387 aa  123  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1851  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.27 
 
 
383 aa  123  5e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1180  1,3-propanediol dehydrogenase  26.17 
 
 
385 aa  123  6e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.440796  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1011  1,3-propanediol dehydrogenase  26.17 
 
 
385 aa  122  6e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000128902  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.2 
 
 
382 aa  122  7e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1495  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.65 
 
 
393 aa  122  8e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102085  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0394  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.1 
 
 
389 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.394023  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.87 
 
 
384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.73 
 
 
387 aa  120  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2420  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.37 
 
 
387 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  27.81 
 
 
383 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1398  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.34 
 
 
383 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145523  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0885  alcohol dehydrogenase, iron-containing  27.72 
 
 
376 aa  119  6e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.08 
 
 
384 aa  119  7e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  27.55 
 
 
381 aa  119  7.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.6 
 
 
382 aa  119  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2398  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.64 
 
 
391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.63 
 
 
387 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2042  EutG protein  28.3 
 
 
415 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.17622  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0826  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.13 
 
 
392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1046  Iron-containing alcohol dehydrogenase  28.5 
 
 
387 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0545646  hitchhiker  0.000000369007 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1336  1,3-propanediol dehydrogenase  26.98 
 
 
390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2335  alcohol dehydrogenase, iron-containing  28.42 
 
 
637 aa  117  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.359123  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.34 
 
 
383 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2097  EutG protein  28.3 
 
 
415 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2237  EutG protein  28.3 
 
 
490 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.113437  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1071  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.11 
 
 
358 aa  115  8.999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2510  1,3-propanediol dehydrogenase  28.97 
 
 
383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.4448e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2865  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.67 
 
 
402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.452469  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.19 
 
 
382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1734  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.51 
 
 
373 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1395  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.72 
 
 
407 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2650  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.78 
 
 
376 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0030  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.98 
 
 
390 aa  114  3e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000706289  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0991  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.02 
 
 
381 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260601  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4103  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.42 
 
 
371 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1490  alcohol dehydrogenase II  26.46 
 
 
382 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4452  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.3 
 
 
379 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3438  L-1,2-propanediol oxidoreductase  29.56 
 
 
383 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1196  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.7 
 
 
387 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1006  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.14 
 
 
377 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2945  dehydrogenase  27.23 
 
 
381 aa  113  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>