More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6132 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012792  Vapar_6132  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
355 aa  702    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.980292  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2063  iron-containing alcohol dehydrogenase  74.93 
 
 
352 aa  530  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00184979  normal  0.72371 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0837  iron-containing alcohol dehydrogenase  70.82 
 
 
356 aa  489  1e-137  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3908  iron-containing alcohol dehydrogenase  70.17 
 
 
362 aa  490  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0347674 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3335  iron-containing alcohol dehydrogenase  69.6 
 
 
358 aa  485  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.330592  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4129  Iron-containing alcohol dehydrogenase  69.97 
 
 
357 aa  482  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4484  Iron-containing alcohol dehydrogenase  71.88 
 
 
355 aa  481  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1325  iron-containing alcohol dehydrogenase  72.16 
 
 
355 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.397668 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5309  iron-containing alcohol dehydrogenase  67.51 
 
 
353 aa  466  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.203818  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1589  Iron-containing alcohol dehydrogenase  64.53 
 
 
355 aa  444  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6061  iron-containing alcohol dehydrogenase  68.17 
 
 
352 aa  443  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4694  Iron-containing alcohol dehydrogenase  64.69 
 
 
352 aa  429  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4611  iron-containing alcohol dehydrogenase  64.12 
 
 
353 aa  422  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.557195  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2737  Iron-containing alcohol dehydrogenase  62.46 
 
 
355 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.413551  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6071  iron-containing alcohol dehydrogenase  62.18 
 
 
355 aa  420  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5063  maleylacetate reductase  61.73 
 
 
355 aa  417  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0529248  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3432  iron-containing alcohol dehydrogenase  62.18 
 
 
355 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4085  iron-containing alcohol dehydrogenase  61.9 
 
 
355 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0871083  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3377  iron-containing alcohol dehydrogenase  62.46 
 
 
355 aa  411  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5215  iron-containing alcohol dehydrogenase  63.03 
 
 
355 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5623  iron-containing alcohol dehydrogenase  61.17 
 
 
355 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7440  maleylacetate reductase  57.95 
 
 
357 aa  392  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05178  maleylacetate reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07090)  54.02 
 
 
357 aa  384  1e-105  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.516162  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1418  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.26 
 
 
351 aa  384  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.93105 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3908  maleylacetate reductase  60.34 
 
 
355 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5727  iron-containing alcohol dehydrogenase  57.55 
 
 
352 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1126  maleylacetate reductase  58.36 
 
 
352 aa  378  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499369  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6463  Iron-containing alcohol dehydrogenase  51.69 
 
 
354 aa  363  3e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4891  iron-containing alcohol dehydrogenase  55.68 
 
 
356 aa  358  9.999999999999999e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.592699  normal  0.0411098 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5540  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.98 
 
 
352 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0827042  hitchhiker  0.0000079765 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1960  iron-containing alcohol dehydrogenase  62.72 
 
 
355 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.929327  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5062  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.69 
 
 
352 aa  323  2e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6471  Iron-containing alcohol dehydrogenase  53.35 
 
 
359 aa  317  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.312726  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4405  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.46 
 
 
351 aa  276  6e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162053  normal  0.536437 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1936  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.74 
 
 
358 aa  271  1e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4574  iron-containing alcohol dehydrogenase  46 
 
 
354 aa  263  4e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.807648 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4592  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.76 
 
 
354 aa  262  6e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4672  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.89 
 
 
363 aa  261  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5825  homogentisate 1,2-dioxygenase  43.85 
 
 
848 aa  251  2e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0876183  normal  0.90273 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4565  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.76 
 
 
358 aa  241  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.573153 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4409  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.34 
 
 
417 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.417322  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5309  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.06 
 
 
379 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4699  Iron-containing alcohol dehydrogenase  31.61 
 
 
380 aa  149  9e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2082  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.86 
 
 
388 aa  133  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1786  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.85 
 
 
388 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  28.84 
 
 
382 aa  129  8.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1051  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.64 
 
 
340 aa  129  8.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0705172  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2455  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.52 
 
 
392 aa  125  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1071  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.29 
 
 
358 aa  124  3e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1011  1,3-propanediol dehydrogenase  27.62 
 
 
385 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000128902  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2681  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.35 
 
 
405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  27.61 
 
 
382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1180  1,3-propanediol dehydrogenase  27.62 
 
 
385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.440796  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2398  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.46 
 
 
391 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2097  EutG protein  31.58 
 
 
415 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.44 
 
 
383 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1006  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.36 
 
 
377 aa  119  7e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1481  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.32 
 
 
382 aa  119  9e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2042  EutG protein  31.58 
 
 
415 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.17622  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0063  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.23 
 
 
379 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2237  EutG protein  31.58 
 
 
490 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.113437  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  29.1 
 
 
383 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2317  Iron-containing alcohol dehydrogenase  31.82 
 
 
381 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.735115  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.98 
 
 
382 aa  117  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0991  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.82 
 
 
381 aa  116  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260601  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.17 
 
 
389 aa  116  5e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1943  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.97 
 
 
399 aa  116  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0825  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.09 
 
 
393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.313783  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.73 
 
 
387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0885  alcohol dehydrogenase, iron-containing  25.76 
 
 
376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0779  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.13 
 
 
392 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.01 
 
 
387 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1024  Iron-containing alcohol dehydrogenase  30.59 
 
 
366 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00115837  unclonable  0.00000000647947 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3438  L-1,2-propanediol oxidoreductase  28.31 
 
 
383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1311  Iron-containing alcohol dehydrogenase  27.51 
 
 
382 aa  114  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.08 
 
 
382 aa  114  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1868  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.73 
 
 
381 aa  114  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.50517  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1851  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.48 
 
 
383 aa  114  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.43 
 
 
383 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.13 
 
 
382 aa  113  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5260  alcohol dehydrogenase  28.89 
 
 
399 aa  112  8.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.926776 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3658  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.97 
 
 
383 aa  112  8.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0321  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.09 
 
 
393 aa  112  9e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.529761 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3523  alcohol dehydrogenase, iron-containing  27.3 
 
 
393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  25.91 
 
 
382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0681  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.75 
 
 
381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1336  1,3-propanediol dehydrogenase  25.83 
 
 
390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0521  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.19 
 
 
383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000118982 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3267  alcetaldehyde dehydrogenase or NADPH-dependent butanol dehydrogenase  27.99 
 
 
369 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3116  L-1,2-propanediol oxidoreductase  28.53 
 
 
382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.303713  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2290  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.79 
 
 
394 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000188362  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3133  L-1,2-propanediol oxidoreductase  28.53 
 
 
382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.708471  normal  0.183731 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0668  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.91 
 
 
383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2277  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.07 
 
 
388 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2510  1,3-propanediol dehydrogenase  30.07 
 
 
383 aa  110  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.4448e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1495  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.34 
 
 
393 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102085  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.32 
 
 
387 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.54 
 
 
384 aa  110  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0621  L-1,2-propanediol oxidoreductase  26.39 
 
 
383 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.529612  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3181  L-1,2-propanediol oxidoreductase  28.24 
 
 
382 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.292144  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>