More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4085 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4085  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
355 aa  709    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0871083  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6071  iron-containing alcohol dehydrogenase  89.83 
 
 
355 aa  640    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3432  iron-containing alcohol dehydrogenase  98.87 
 
 
355 aa  701    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2737  Iron-containing alcohol dehydrogenase  87.89 
 
 
355 aa  629  1e-179  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.413551  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3377  iron-containing alcohol dehydrogenase  90.4 
 
 
355 aa  624  1e-178  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5215  iron-containing alcohol dehydrogenase  89.86 
 
 
355 aa  615  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5623  iron-containing alcohol dehydrogenase  80.23 
 
 
355 aa  544  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5063  maleylacetate reductase  73.16 
 
 
355 aa  503  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0529248  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3908  maleylacetate reductase  70.62 
 
 
355 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2063  iron-containing alcohol dehydrogenase  62.15 
 
 
352 aa  424  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00184979  normal  0.72371 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0837  iron-containing alcohol dehydrogenase  62.39 
 
 
356 aa  418  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3335  iron-containing alcohol dehydrogenase  62.78 
 
 
358 aa  418  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.330592  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5309  iron-containing alcohol dehydrogenase  61.41 
 
 
353 aa  414  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.203818  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4129  Iron-containing alcohol dehydrogenase  60.4 
 
 
357 aa  409  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4484  Iron-containing alcohol dehydrogenase  63.07 
 
 
355 aa  408  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1325  iron-containing alcohol dehydrogenase  61.93 
 
 
355 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.397668 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1589  Iron-containing alcohol dehydrogenase  58.82 
 
 
355 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4611  iron-containing alcohol dehydrogenase  62.15 
 
 
353 aa  402  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.557195  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3908  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.97 
 
 
362 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0347674 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6061  iron-containing alcohol dehydrogenase  62.71 
 
 
352 aa  392  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4694  Iron-containing alcohol dehydrogenase  61.58 
 
 
352 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6132  iron-containing alcohol dehydrogenase  61.9 
 
 
355 aa  380  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.980292  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05178  maleylacetate reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07090)  53.24 
 
 
357 aa  370  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.516162  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1418  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.13 
 
 
351 aa  364  2e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.93105 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4891  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.55 
 
 
356 aa  359  4e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.592699  normal  0.0411098 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5727  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.7 
 
 
352 aa  350  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1960  iron-containing alcohol dehydrogenase  60.45 
 
 
355 aa  341  1e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.929327  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7440  maleylacetate reductase  51.69 
 
 
357 aa  333  3e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5540  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.71 
 
 
352 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0827042  hitchhiker  0.0000079765 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6463  Iron-containing alcohol dehydrogenase  49.72 
 
 
354 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5062  iron-containing alcohol dehydrogenase  50 
 
 
352 aa  322  8e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6471  Iron-containing alcohol dehydrogenase  53.67 
 
 
359 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.312726  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1126  maleylacetate reductase  51.57 
 
 
352 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499369  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4405  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.48 
 
 
351 aa  270  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162053  normal  0.536437 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5825  homogentisate 1,2-dioxygenase  44.85 
 
 
848 aa  255  8e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0876183  normal  0.90273 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1936  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.93 
 
 
358 aa  245  6.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4592  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.94 
 
 
354 aa  245  9.999999999999999e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4574  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.71 
 
 
354 aa  244  9.999999999999999e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.807648 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4565  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.12 
 
 
358 aa  233  4.0000000000000004e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.573153 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4672  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.42 
 
 
363 aa  228  9e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2681  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.15 
 
 
405 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.88 
 
 
384 aa  143  4e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3267  alcetaldehyde dehydrogenase or NADPH-dependent butanol dehydrogenase  32.75 
 
 
369 aa  140  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4409  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.82 
 
 
417 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.417322  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2082  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.46 
 
 
388 aa  136  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1495  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.91 
 
 
393 aa  136  5e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102085  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2430  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.23 
 
 
384 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.63 
 
 
384 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.29 
 
 
397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0115621 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5309  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.61 
 
 
379 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1786  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.72 
 
 
388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.83 
 
 
382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4699  Iron-containing alcohol dehydrogenase  30.08 
 
 
380 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2290  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.71 
 
 
388 aa  129  6e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2290  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.52 
 
 
394 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000188362  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13900  Iron-containing alcohol dehydrogenase  32.53 
 
 
386 aa  129  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00279166  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2510  1,3-propanediol dehydrogenase  31.86 
 
 
383 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.4448e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.96 
 
 
389 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.2 
 
 
383 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.45 
 
 
393 aa  127  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2277  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.09 
 
 
388 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 
387 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.88 
 
 
387 aa  127  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1071  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.81 
 
 
358 aa  126  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1180  1,3-propanediol dehydrogenase  30.51 
 
 
385 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.440796  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1011  1,3-propanediol dehydrogenase  30.51 
 
 
385 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000128902  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.22 
 
 
387 aa  126  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2398  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.62 
 
 
391 aa  126  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  26.67 
 
 
382 aa  125  8.000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02110  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  26.27 
 
 
887 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0321  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.06 
 
 
393 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.529761 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2042  EutG protein  30.82 
 
 
415 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.17622  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  26.39 
 
 
382 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0887  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.63 
 
 
387 aa  124  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000472566  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2097  EutG protein  30.82 
 
 
415 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2237  EutG protein  30.82 
 
 
490 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.113437  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5260  alcohol dehydrogenase  29.28 
 
 
399 aa  124  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.926776 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3412  Iron-containing alcohol dehydrogenase  32.88 
 
 
392 aa  123  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0172  alcohol dehydrogenase  30.5 
 
 
388 aa  123  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0837  L-1,2-propanediol oxidoreductase  28.04 
 
 
383 aa  122  6e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0990  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.05 
 
 
386 aa  122  7e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.71484 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3848  lactaldehyde reductase  29.77 
 
 
382 aa  122  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3181  L-1,2-propanediol oxidoreductase  31.05 
 
 
382 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.292144  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0746  lactaldehyde reductase  29.77 
 
 
382 aa  122  7e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0727941 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.81 
 
 
382 aa  122  9e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3758  lactaldehyde reductase  29.45 
 
 
382 aa  122  9e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  29.56 
 
 
382 aa  122  9e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0825  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.61 
 
 
393 aa  122  9e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.313783  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0889  lactaldehyde reductase  31.58 
 
 
382 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0565  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.4 
 
 
389 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.79087 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2939  L-1,2-propanediol oxidoreductase  31.58 
 
 
383 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.284503  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2943  L-1,2-propanediol oxidoreductase  31.48 
 
 
382 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3057  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.88 
 
 
373 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0713063 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3296  L-1,2-propanediol oxidoreductase  31.05 
 
 
382 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.61 
 
 
387 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3104  L-1,2-propanediol oxidoreductase  31.58 
 
 
382 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.189679  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3133  L-1,2-propanediol oxidoreductase  31.05 
 
 
382 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.708471  normal  0.183731 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6952  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.55 
 
 
388 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3196  L-1,2-propanediol oxidoreductase  31.05 
 
 
382 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4063  L-1,2-propanediol oxidoreductase  31.58 
 
 
383 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>