More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1325 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4484  Iron-containing alcohol dehydrogenase  96.62 
 
 
355 aa  663    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1325  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
355 aa  709    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.397668 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3335  iron-containing alcohol dehydrogenase  69.91 
 
 
358 aa  511  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.330592  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2063  iron-containing alcohol dehydrogenase  70.98 
 
 
352 aa  498  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00184979  normal  0.72371 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0837  iron-containing alcohol dehydrogenase  69.91 
 
 
356 aa  489  1e-137  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4129  Iron-containing alcohol dehydrogenase  71.14 
 
 
357 aa  486  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6132  iron-containing alcohol dehydrogenase  72.16 
 
 
355 aa  470  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.980292  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3908  iron-containing alcohol dehydrogenase  67.05 
 
 
362 aa  464  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0347674 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5309  iron-containing alcohol dehydrogenase  66.09 
 
 
353 aa  460  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.203818  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6061  iron-containing alcohol dehydrogenase  69.34 
 
 
352 aa  437  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1589  Iron-containing alcohol dehydrogenase  62.11 
 
 
355 aa  431  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2737  Iron-containing alcohol dehydrogenase  62.96 
 
 
355 aa  425  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.413551  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4611  iron-containing alcohol dehydrogenase  63.9 
 
 
353 aa  422  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.557195  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5063  maleylacetate reductase  62.11 
 
 
355 aa  421  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0529248  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3432  iron-containing alcohol dehydrogenase  61.93 
 
 
355 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6071  iron-containing alcohol dehydrogenase  61.25 
 
 
355 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4085  iron-containing alcohol dehydrogenase  61.93 
 
 
355 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0871083  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3377  iron-containing alcohol dehydrogenase  62.39 
 
 
355 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5215  iron-containing alcohol dehydrogenase  62.39 
 
 
355 aa  408  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4694  Iron-containing alcohol dehydrogenase  61.03 
 
 
352 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5623  iron-containing alcohol dehydrogenase  60.51 
 
 
355 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7440  maleylacetate reductase  57.94 
 
 
357 aa  397  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1418  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.59 
 
 
351 aa  387  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.93105 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1126  maleylacetate reductase  58.48 
 
 
352 aa  386  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499369  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3908  maleylacetate reductase  59.38 
 
 
355 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05178  maleylacetate reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07090)  52.74 
 
 
357 aa  376  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.516162  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6463  Iron-containing alcohol dehydrogenase  53.87 
 
 
354 aa  371  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4891  iron-containing alcohol dehydrogenase  56.61 
 
 
356 aa  372  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.592699  normal  0.0411098 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5727  iron-containing alcohol dehydrogenase  55.17 
 
 
352 aa  368  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5540  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.45 
 
 
352 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0827042  hitchhiker  0.0000079765 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1960  iron-containing alcohol dehydrogenase  60.92 
 
 
355 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.929327  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6471  Iron-containing alcohol dehydrogenase  52.56 
 
 
359 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.312726  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5062  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.57 
 
 
352 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4405  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.88 
 
 
351 aa  291  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162053  normal  0.536437 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4574  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.13 
 
 
354 aa  282  8.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.807648 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1936  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.66 
 
 
358 aa  277  2e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5825  homogentisate 1,2-dioxygenase  46.13 
 
 
848 aa  270  2.9999999999999997e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0876183  normal  0.90273 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4672  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.02 
 
 
363 aa  264  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4592  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.32 
 
 
354 aa  258  8e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4565  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.9 
 
 
358 aa  248  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.573153 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4409  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.23 
 
 
417 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.417322  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1051  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.44 
 
 
340 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0705172  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5309  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.23 
 
 
379 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3267  alcetaldehyde dehydrogenase or NADPH-dependent butanol dehydrogenase  29.32 
 
 
369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4699  Iron-containing alcohol dehydrogenase  30.05 
 
 
380 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2082  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.09 
 
 
388 aa  133  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2681  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.5 
 
 
405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2455  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.75 
 
 
392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1495  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.98 
 
 
393 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102085  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  27.2 
 
 
382 aa  130  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1786  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.09 
 
 
388 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1311  Iron-containing alcohol dehydrogenase  28.27 
 
 
382 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  29.33 
 
 
382 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0837  L-1,2-propanediol oxidoreductase  28.12 
 
 
383 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.07 
 
 
384 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0621  L-1,2-propanediol oxidoreductase  27.85 
 
 
383 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.529612  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  25.87 
 
 
382 aa  126  6e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1071  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.38 
 
 
358 aa  125  8.000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1011  1,3-propanediol dehydrogenase  27.51 
 
 
385 aa  125  8.000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000128902  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  28.07 
 
 
383 aa  125  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1180  1,3-propanediol dehydrogenase  27.51 
 
 
385 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.440796  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  25.6 
 
 
382 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.33 
 
 
382 aa  124  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  26.51 
 
 
382 aa  124  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  26.13 
 
 
382 aa  123  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2430  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.15 
 
 
384 aa  123  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.81 
 
 
389 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.07 
 
 
382 aa  122  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.39 
 
 
382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0826  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.63 
 
 
392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4348  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.75 
 
 
385 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.159902  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1046  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.37 
 
 
382 aa  119  7.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  26.79 
 
 
382 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3987  Iron-containing alcohol dehydrogenase  26.72 
 
 
382 aa  119  9e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.85 
 
 
387 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0779  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.36 
 
 
392 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3438  L-1,2-propanediol oxidoreductase  28.23 
 
 
383 aa  118  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1395  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.43 
 
 
407 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3316  L-1,2-propanediol oxidoreductase  26.67 
 
 
383 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2398  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.14 
 
 
391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.59 
 
 
387 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1851  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.79 
 
 
383 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2510  1,3-propanediol dehydrogenase  31.67 
 
 
383 aa  117  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.4448e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.53 
 
 
383 aa  117  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1006  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.15 
 
 
377 aa  117  3e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  25.72 
 
 
381 aa  117  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0887  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.46 
 
 
387 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000472566  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4285  alcohol dehydrogenase II  27.47 
 
 
382 aa  116  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.13 
 
 
387 aa  116  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1261  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.32 
 
 
381 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.528177  normal  0.0459015 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1756  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.68 
 
 
377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0953887  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1481  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.24 
 
 
382 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0885  alcohol dehydrogenase, iron-containing  26.23 
 
 
376 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2865  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.47 
 
 
402 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.452469  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02644  L-1,2-propanediol oxidoreductase  27.73 
 
 
383 aa  113  5e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3104  L-1,2-propanediol oxidoreductase  27.73 
 
 
382 aa  113  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.189679  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0889  lactaldehyde reductase  27.73 
 
 
382 aa  113  5e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4063  L-1,2-propanediol oxidoreductase  27.73 
 
 
383 aa  113  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02606  hypothetical protein  27.73 
 
 
383 aa  113  5e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.08 
 
 
383 aa  113  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>