More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4129 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4129  Iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 357 aa  712    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0837  iron-containing alcohol dehydrogenase  71.07 
 
 		 356 aa  501  1e-141  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2063  iron-containing alcohol dehydrogenase  68.47 
 
 		 352 aa  473  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00184979  normal  0.72371 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4484  Iron-containing alcohol dehydrogenase  71.14 
 
 		 355 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1325  iron-containing alcohol dehydrogenase  71.14 
 
 		 355 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.397668 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3335  iron-containing alcohol dehydrogenase  64.97 
 
 		 358 aa  461  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.330592  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5309  iron-containing alcohol dehydrogenase  65.81 
 
 		 353 aa  456  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.203818  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6132  iron-containing alcohol dehydrogenase  69.97 
 
 		 355 aa  446  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.980292  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3908  iron-containing alcohol dehydrogenase  63.43 
 
 		 362 aa  447  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0347674 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6061  iron-containing alcohol dehydrogenase  66.86 
 
 		 352 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1589  Iron-containing alcohol dehydrogenase  63.94 
 
 		 355 aa  436  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5063  maleylacetate reductase  62.15 
 
 		 355 aa  422  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0529248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4611  iron-containing alcohol dehydrogenase  64.39 
 
 		 353 aa  420  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.557195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3432  iron-containing alcohol dehydrogenase  60.97 
 
 		 355 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6071  iron-containing alcohol dehydrogenase  60.4 
 
 		 355 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4085  iron-containing alcohol dehydrogenase  60.4 
 
 		 355 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0871083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4694  Iron-containing alcohol dehydrogenase  61.65 
 
 		 352 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5727  iron-containing alcohol dehydrogenase  57.55 
 
 		 352 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2737  Iron-containing alcohol dehydrogenase  59.09 
 
 		 355 aa  403  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.413551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1418  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.98 
 
 		 351 aa  403  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.93105 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3377  iron-containing alcohol dehydrogenase  60.11 
 
 		 355 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5215  iron-containing alcohol dehydrogenase  60.8 
 
 		 355 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5623  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.97 
 
 		 355 aa  395  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5540  iron-containing alcohol dehydrogenase  57.22 
 
 		 352 aa  384  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0827042  hitchhiker  0.0000079765 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7440  maleylacetate reductase  56.23 
 
 		 357 aa  382  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3908  maleylacetate reductase  58.69 
 
 		 355 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05178  maleylacetate reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07090)  52.45 
 
 		 357 aa  377  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.516162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4891  iron-containing alcohol dehydrogenase  55.84 
 
 		 356 aa  371  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.592699  normal  0.0411098 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6463  Iron-containing alcohol dehydrogenase  52.41 
 
 		 354 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1126  maleylacetate reductase  56.06 
 
 		 352 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1960  iron-containing alcohol dehydrogenase  60.8 
 
 		 355 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.929327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5062  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.86 
 
 		 352 aa  334  1e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6471  Iron-containing alcohol dehydrogenase  53.85 
 
 		 359 aa  330  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.312726  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4405  iron-containing alcohol dehydrogenase  49.29 
 
 		 351 aa  291  1e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162053  normal  0.536437 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4574  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.32 
 
 		 354 aa  279  5e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.807648 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1936  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.83 
 
 		 358 aa  279  6e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5825  homogentisate 1,2-dioxygenase  47.79 
 
 		 848 aa  277  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0876183  normal  0.90273 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4672  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.16 
 
 		 363 aa  272  7e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4592  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.46 
 
 		 354 aa  268  2e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4565  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.79 
 
 		 358 aa  258  1e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.573153 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4409  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.9 
 
 		 417 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.417322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5309  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 379 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4699  Iron-containing alcohol dehydrogenase  33.62 
 
 		 380 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1786  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.9 
 
 		 388 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2082  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.99 
 
 		 388 aa  144  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2455  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.89 
 
 		 392 aa  137  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1011  1,3-propanediol dehydrogenase  29.69 
 
 		 385 aa  136  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000128902  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1180  1,3-propanediol dehydrogenase  29.69 
 
 		 385 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.440796  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.06 
 
 		 384 aa  134  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.84 
 
 		 389 aa  132  9e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  27.57 
 
 		 382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2681  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.39 
 
 		 405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1046  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.68 
 
 		 382 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1261  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.55 
 
 		 381 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.528177  normal  0.0459015 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  24.8 
 
 		 382 aa  128  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2495  lactaldehyde reductase  26.47 
 
 		 382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.95 
 
 		 382 aa  126  7e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1051  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.12 
 
 		 340 aa  125  8.000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0705172  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02644  L-1,2-propanediol oxidoreductase  28.69 
 
 		 383 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0889  lactaldehyde reductase  28.69 
 
 		 382 aa  125  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02606  hypothetical protein  28.69 
 
 		 383 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0767  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.21 
 
 		 406 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0681  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.52 
 
 		 381 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3104  L-1,2-propanediol oxidoreductase  28.69 
 
 		 382 aa  125  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.189679  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  25.95 
 
 		 382 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0837  L-1,2-propanediol oxidoreductase  28 
 
 		 383 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2939  L-1,2-propanediol oxidoreductase  28.69 
 
 		 383 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.284503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2943  L-1,2-propanediol oxidoreductase  28.69 
 
 		 382 aa  125  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4063  L-1,2-propanediol oxidoreductase  28.69 
 
 		 383 aa  125  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.61 
 
 		 383 aa  124  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.42 
 
 		 382 aa  124  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.69 
 
 		 387 aa  123  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1495  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.13 
 
 		 393 aa  123  5e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102085  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2781  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.46 
 
 		 398 aa  123  6e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0913  L-1,2-propanediol oxidoreductase  28.34 
 
 		 383 aa  122  7e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5260  alcohol dehydrogenase  29.09 
 
 		 399 aa  122  8e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.926776 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  27.54 
 
 		 382 aa  122  9e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2317  Iron-containing alcohol dehydrogenase  29.89 
 
 		 381 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.735115  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1046  Iron-containing alcohol dehydrogenase  28.68 
 
 		 387 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0545646  hitchhiker  0.000000369007 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4549  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.81 
 
 		 381 aa  121  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.23 
 
 		 382 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.020336  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  25.95 
 
 		 382 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4348  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.46 
 
 		 385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.159902  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  26.42 
 
 		 381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.42 
 
 		 387 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0991  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.89 
 
 		 381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2836  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.45 
 
 		 380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  25.68 
 
 		 382 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.31 
 
 		 384 aa  120  3e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3987  Iron-containing alcohol dehydrogenase  26.22 
 
 		 382 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1418  Iron-containing alcohol dehydrogenase  31.44 
 
 		 382 aa  119  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.909336  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1311  Iron-containing alcohol dehydrogenase  26.68 
 
 		 382 aa  119  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2049  alcohol dehydrogenase, iron-containing  31.28 
 
 		 387 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0117689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0779  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.58 
 
 		 392 aa  119  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2128  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.85 
 
 		 381 aa  119  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.705476  normal  0.429829 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2398  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.02 
 
 		 391 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0255  alcohol dehydrogenase, class IV  27.57 
 
 		 390 aa  119  7.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5141  putative alcohol dehydrogenase  27.27 
 
 		 386 aa  119  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237581  normal  0.0395804 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  27.03 
 
 		 383 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3692  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.28 
 
 		 387 aa  119  9e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>