153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4731 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4731  HpcH/HpaI aldolase  100 
 
 		 334 aa  677    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4148  putative citrate lyase  64.71 
 
 		 331 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4429  Citrate lyase subunit beta-like protein  62.85 
 
 		 373 aa  422  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00516467  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2868  malyl-CoA lyase or citrate lyase, beta subunit  58.54 
 
 		 327 aa  390  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2553  HpcH/HpaI aldolase  60 
 
 		 332 aa  390  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.108107  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2490  HpcH/HpaI aldolase  54.69 
 
 		 326 aa  354  8.999999999999999e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.33076 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1830  HpcH/HpaI aldolase  54.35 
 
 		 326 aa  354  1e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.650441 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2154  HpcH/HpaI aldolase  55.28 
 
 		 326 aa  347  2e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.377613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6859  HpcH/HpaI aldolase  51.69 
 
 		 338 aa  345  4e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750259  normal  0.224007 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2328  putative citrate lyase beta subunit  53.42 
 
 		 326 aa  345  6e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4357  HpcH/HpaI aldolase  50.31 
 
 		 340 aa  341  9e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1999  lyase protein  56.54 
 
 		 320 aa  341  1e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.697821  normal  0.433586 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2899  lyase  51.09 
 
 		 338 aa  341  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0657  lyase, putative  54.18 
 
 		 339 aa  333  3e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1618  putative lyase  54.49 
 
 		 339 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1826  putative lyase  54.49 
 
 		 339 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2475  putative lyase  54.49 
 
 		 339 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2337  putative lyase  54.49 
 
 		 339 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0496  putative lyase  54.49 
 
 		 339 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3597  HpcH/HpaI aldolase  52.94 
 
 		 335 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4436  HpcH/HpaI aldolase  52.94 
 
 		 378 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3931  HpcH/HpaI aldolase  52.94 
 
 		 378 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1752  putative lyase  55.24 
 
 		 331 aa  326  3e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2155  citrate lyase beta subunit-like  53.05 
 
 		 335 aa  322  6e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3308  HpcH/HpaI aldolase  53.35 
 
 		 334 aa  322  6e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.747689 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3824  HpcH/HpaI aldolase  53.35 
 
 		 334 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.508893 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4652  HpcH/HpaI aldolase  54.21 
 
 		 335 aa  318  9e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2173  putative lyase  50.16 
 
 		 337 aa  308  5.9999999999999995e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.24016 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0797  putative lyase  55.17 
 
 		 307 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2709  putative lyase  45.62 
 
 		 350 aa  293  2e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.15345 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1804  putative citrate lyase beta subunit  44.21 
 
 		 354 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0637103  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2431  HpcH/HpaI aldolase  43.77 
 
 		 339 aa  261  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2208  HpcH/HpaI aldolase  44.61 
 
 		 341 aa  261  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3597  HpcH/HpaI aldolase  41.12 
 
 		 356 aa  258  8e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3029  HpcH/HpaI aldolase  42.07 
 
 		 329 aa  252  5.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.37236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2279  HpcH/HpaI aldolase  42.35 
 
 		 336 aa  250  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2789  HpcH/HpaI aldolase  42.35 
 
 		 336 aa  250  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.175467  normal  0.257367 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1434  HpcH/HpaI aldolase  43.58 
 
 		 332 aa  249  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1580  Citryl-CoA lyase  27.14 
 
 		 303 aa  79.7  0.00000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.264708  hitchhiker  0.00335996 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3189  citrate (pro-3S)-lyase  29.71 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0128752  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0799  citrate (pro-3S)-lyase  25.71 
 
 		 341 aa  73.6  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6909  citrate (pro-3S)-lyase  26.6 
 
 		 316 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3810  HpcH/HpaI aldolase  30.16 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3050  citrate lyase subunit beta  24.74 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2481  citrate (pro-3S)-lyase  25.97 
 
 		 379 aa  67.8  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.565353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1771  beta subunit of citrate lyase  25.26 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0417  Citryl-CoA lyase  25.26 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3165  Citryl-CoA lyase  24.14 
 
 		 320 aa  64.3  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6108  HpcH/HpaI aldolase  29.69 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000904095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  27.23 
 
 		 274 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0830  citrate lyase  27.5 
 
 		 282 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0807208  normal  0.0919126 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2805  HpcH/HpaI aldolase  23.53 
 
 		 355 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0471  citrate lyase  26.62 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.750948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0217  citrate lyase  24.74 
 
 		 325 aa  58.9  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342299  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4556  HpcH/HpaI aldolase  30.84 
 
 		 274 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.936359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1348  HpcH/HpaI aldolase  34.42 
 
 		 276 aa  58.9  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  23.61 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3898  Citrate (pro-3S)-lyase  27.02 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.107361  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4082  citrate lyase  30.23 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4393  HpcH/HpaI aldolase  21.96 
 
 		 363 aa  57.8  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2830  Citryl-CoA lyase  27.5 
 
 		 304 aa  57  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6894  Citryl-CoA lyase  32.45 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4636  Citrate (pro-3S)-lyase  26.42 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0560  putative HpcH/HpaI aldolase  25.7 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00111477  normal  0.30107 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1754  Citrate (pro-3S)-lyase  25 
 
 		 324 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2028  HpcH/HpaI aldolase  31.06 
 
 		 295 aa  55.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4213  HpcH/HpaI aldolase  24.52 
 
 		 351 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2490  citrate lyase  28.1 
 
 		 310 aa  55.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2118  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  29.37 
 
 		 280 aa  55.8  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6559  citrate (pro-3S)-lyase  25.44 
 
 		 323 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527752  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2138  Citrate (pro-3S)-lyase  26.46 
 
 		 324 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0213  HpcH/HpaI aldolase  28.45 
 
 		 303 aa  55.1  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0618  Citrate (pro-3S)-lyase  30.23 
 
 		 270 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0840536 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2156  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  29.85 
 
 		 280 aa  54.7  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.928394  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1802  citrate (pro-3S)-lyase  26.46 
 
 		 324 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.23047 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2266  HpcH/HpaI aldolase  29.85 
 
 		 280 aa  54.7  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4946  HpcH/HpaI aldolase  27.13 
 
 		 269 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1739  citrate lyase, beta subunit, putative  25.17 
 
 		 320 aa  54.3  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000771015  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2561  citrate (pro-3S)-lyase  23.18 
 
 		 331 aa  54.3  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  26.32 
 
 		 324 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4300  Citrate (pro-3S)-lyase  30.34 
 
 		 301 aa  54.3  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.097194  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3663  Citryl-CoA lyase  25.17 
 
 		 323 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0202  HpcH/HpaI aldolase  33.13 
 
 		 290 aa  53.5  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0989  putative citrate lyase, beta subunit  26.96 
 
 		 274 aa  53.1  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.911423 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5924  citrate (pro-3S)-lyase  25.26 
 
 		 325 aa  53.5  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0168  citrate lyase, beta subunit, putative  34.96 
 
 		 274 aa  52.8  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0332252  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0149  putative citrate lyase, beta subunit  34.96 
 
 		 274 aa  52.8  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.678865  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0114  HpcH/HpaI aldolase  28.1 
 
 		 289 aa  52.8  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0131  HpcH/HpaI aldolase  28.1 
 
 		 289 aa  52.8  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1777  Citrate (pro-3S)-lyase  25.32 
 
 		 312 aa  52.4  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  28.16 
 
 		 286 aa  52  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1719  Citrate (pro-3S)-lyase  24.74 
 
 		 325 aa  51.6  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.412951 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  27.09 
 
 		 282 aa  51.6  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1313  putative citrate lyase beta subunit  28.99 
 
 		 275 aa  51.2  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5950  HpcH/HpaI aldolase  28.93 
 
 		 291 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3153  citrate (pro-3S)-lyase  24.72 
 
 		 308 aa  50.8  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.835356  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0511  HpcH/HpaI aldolase  24.11 
 
 		 293 aa  50.8  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1650  HpcH/HpaI aldolase  23.44 
 
 		 349 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.806088  normal  0.193855 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0805  Citrate (pro-3S)-lyase  26.24 
 
 		 319 aa  50.4  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3436  HpcH/HpaI aldolase  28.69 
 
 		 278 aa  50.4  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>