150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2328 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2328  putative citrate lyase beta subunit  100 
 
 		 326 aa  668    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2490  HpcH/HpaI aldolase  90.49 
 
 		 326 aa  592  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.33076 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1830  HpcH/HpaI aldolase  73.85 
 
 		 326 aa  501  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.650441 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2154  HpcH/HpaI aldolase  75.08 
 
 		 326 aa  486  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.377613  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1999  lyase protein  74.61 
 
 		 320 aa  481  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.697821  normal  0.433586 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6859  HpcH/HpaI aldolase  61.73 
 
 		 338 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750259  normal  0.224007 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2899  lyase  61.11 
 
 		 338 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4357  HpcH/HpaI aldolase  61.11 
 
 		 340 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0657  lyase, putative  60.49 
 
 		 339 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1618  putative lyase  61.35 
 
 		 339 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1826  putative lyase  61.35 
 
 		 339 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2475  putative lyase  61.35 
 
 		 339 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2337  putative lyase  61.35 
 
 		 339 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0496  putative lyase  61.35 
 
 		 339 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1752  putative lyase  61.37 
 
 		 331 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2868  malyl-CoA lyase or citrate lyase, beta subunit  57.23 
 
 		 327 aa  372  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4436  HpcH/HpaI aldolase  58.33 
 
 		 378 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3931  HpcH/HpaI aldolase  58.33 
 
 		 378 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2553  HpcH/HpaI aldolase  56.31 
 
 		 332 aa  366  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.108107  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3597  HpcH/HpaI aldolase  58.33 
 
 		 335 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4148  putative citrate lyase  53.09 
 
 		 331 aa  362  3e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4731  HpcH/HpaI aldolase  53.42 
 
 		 334 aa  357  1.9999999999999998e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3824  HpcH/HpaI aldolase  58.95 
 
 		 334 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.508893 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2155  citrate lyase beta subunit-like  58.33 
 
 		 335 aa  354  1e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3308  HpcH/HpaI aldolase  58.64 
 
 		 334 aa  352  4e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.747689 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4652  HpcH/HpaI aldolase  59.26 
 
 		 335 aa  350  1e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4429  Citrate lyase subunit beta-like protein  52.47 
 
 		 373 aa  350  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00516467  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0797  putative lyase  60.94 
 
 		 307 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2173  putative lyase  51.99 
 
 		 337 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.24016 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1804  putative citrate lyase beta subunit  48.84 
 
 		 354 aa  308  9e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0637103  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2709  putative lyase  49.55 
 
 		 350 aa  306  3e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.15345 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2431  HpcH/HpaI aldolase  51.22 
 
 		 339 aa  305  7e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2208  HpcH/HpaI aldolase  51.96 
 
 		 341 aa  296  3e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3597  HpcH/HpaI aldolase  48.02 
 
 		 356 aa  288  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2279  HpcH/HpaI aldolase  50.91 
 
 		 336 aa  281  8.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2789  HpcH/HpaI aldolase  50.91 
 
 		 336 aa  281  8.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.175467  normal  0.257367 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3029  HpcH/HpaI aldolase  46.67 
 
 		 329 aa  281  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.37236  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1434  HpcH/HpaI aldolase  48.78 
 
 		 332 aa  273  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1580  Citryl-CoA lyase  27.55 
 
 		 303 aa  77.8  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.264708  hitchhiker  0.00335996 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5924  citrate (pro-3S)-lyase  28.57 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0799  citrate (pro-3S)-lyase  25.16 
 
 		 341 aa  72.8  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3050  citrate lyase subunit beta  27.47 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1754  Citrate (pro-3S)-lyase  27.49 
 
 		 324 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1719  Citrate (pro-3S)-lyase  29.63 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.412951 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2138  Citrate (pro-3S)-lyase  27.49 
 
 		 324 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1802  citrate (pro-3S)-lyase  27.49 
 
 		 324 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.23047 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1771  beta subunit of citrate lyase  26.57 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0417  Citryl-CoA lyase  26.57 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3254  Citryl-CoA lyase  28.22 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0663527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1078  citrate lyase  29.63 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132128  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3165  Citryl-CoA lyase  27.51 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  27.05 
 
 		 324 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3663  Citryl-CoA lyase  26.6 
 
 		 323 aa  66.2  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0830  citrate lyase  27.08 
 
 		 282 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0807208  normal  0.0919126 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2481  citrate (pro-3S)-lyase  24.91 
 
 		 379 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.565353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6108  HpcH/HpaI aldolase  29.73 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000904095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5950  HpcH/HpaI aldolase  29.75 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6559  citrate (pro-3S)-lyase  26.57 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527752  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4393  HpcH/HpaI aldolase  24.91 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1348  HpcH/HpaI aldolase  34.39 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  29.7 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0131  HpcH/HpaI aldolase  31.23 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2805  HpcH/HpaI aldolase  23.26 
 
 		 355 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6255  HpcH/HpaI aldolase  28.48 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0114  HpcH/HpaI aldolase  31.23 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4946  HpcH/HpaI aldolase  26.8 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3004  citrate (pro-3S)-lyase  29.63 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  0.725704 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3810  HpcH/HpaI aldolase  26.47 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3189  citrate (pro-3S)-lyase  30.57 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0128752  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3153  citrate (pro-3S)-lyase  25.3 
 
 		 308 aa  58.9  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.835356  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6909  citrate (pro-3S)-lyase  24.25 
 
 		 316 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  26.74 
 
 		 294 aa  58.9  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1739  citrate lyase, beta subunit, putative  27.05 
 
 		 320 aa  57  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000771015  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0471  citrate lyase  25.26 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.750948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2561  citrate (pro-3S)-lyase  23.9 
 
 		 331 aa  57  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1154  Citrate (pro-3S)-lyase  28.81 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4636  Citrate (pro-3S)-lyase  27.24 
 
 		 319 aa  55.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1192  Citrate (pro-3S)-lyase  28.34 
 
 		 313 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.151099  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8404  Citrate (pro-3S)-lyase  26.59 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.927075 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0805  Citrate (pro-3S)-lyase  26.85 
 
 		 319 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0217  citrate lyase  24.74 
 
 		 325 aa  54.3  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342299  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2830  Citryl-CoA lyase  25.78 
 
 		 304 aa  53.9  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4300  Citrate (pro-3S)-lyase  28.01 
 
 		 301 aa  53.5  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.097194  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4213  HpcH/HpaI aldolase  23.87 
 
 		 351 aa  53.9  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2490  citrate lyase  26.56 
 
 		 310 aa  53.9  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  26.74 
 
 		 293 aa  53.1  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  24.9 
 
 		 274 aa  53.1  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  29.27 
 
 		 286 aa  53.1  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  22.88 
 
 		 289 aa  53.1  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4487  citrate (pro-3S)-lyase  26.69 
 
 		 318 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0353068  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2214  HpcH/HpaI aldolase  31.12 
 
 		 267 aa  52.4  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0660288  normal  0.0595234 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2209  Citryl-CoA lyase  26.56 
 
 		 318 aa  52  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.759332  normal  0.498106 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1243  HpcH/HpaI aldolase  26.51 
 
 		 282 aa  52  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31934  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0618  Citrate (pro-3S)-lyase  28.96 
 
 		 270 aa  52  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0840536 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  24.82 
 
 		 292 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4082  citrate lyase  27.98 
 
 		 270 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0723  Citryl-CoA lyase  25.49 
 
 		 318 aa  52  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1107  HpcH/HpaI aldolase  29.94 
 
 		 189 aa  51.6  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0731  HpcH/HpaI aldolase  24.89 
 
 		 349 aa  51.2  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0544  citrate (pro-3S)-lyase  25.09 
 
 		 297 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.368833 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>