262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2279 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2279  HpcH/HpaI aldolase  100 
 
 		 336 aa  676    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2789  HpcH/HpaI aldolase  99.7 
 
 		 336 aa  672    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.175467  normal  0.257367 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2208  HpcH/HpaI aldolase  79.38 
 
 		 341 aa  499  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2431  HpcH/HpaI aldolase  75.38 
 
 		 339 aa  494  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3597  HpcH/HpaI aldolase  72.42 
 
 		 356 aa  480  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3029  HpcH/HpaI aldolase  71.69 
 
 		 329 aa  474  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.37236  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1434  HpcH/HpaI aldolase  70.09 
 
 		 332 aa  439  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1804  putative citrate lyase beta subunit  63.71 
 
 		 354 aa  397  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0637103  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2173  putative lyase  55.69 
 
 		 337 aa  338  7e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.24016 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2709  putative lyase  54.76 
 
 		 350 aa  328  9e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.15345 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1830  HpcH/HpaI aldolase  51.22 
 
 		 326 aa  309  4e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.650441 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4357  HpcH/HpaI aldolase  51.94 
 
 		 340 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6859  HpcH/HpaI aldolase  51.51 
 
 		 338 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750259  normal  0.224007 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2154  HpcH/HpaI aldolase  52.74 
 
 		 326 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.377613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2899  lyase  50.75 
 
 		 338 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1999  lyase protein  53.99 
 
 		 320 aa  301  7.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.697821  normal  0.433586 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2868  malyl-CoA lyase or citrate lyase, beta subunit  50.61 
 
 		 327 aa  296  3e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2490  HpcH/HpaI aldolase  50.91 
 
 		 326 aa  296  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.33076 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0657  lyase, putative  53.43 
 
 		 339 aa  294  1e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2328  putative citrate lyase beta subunit  52.13 
 
 		 326 aa  291  8e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1826  putative lyase  52.24 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0496  putative lyase  52.24 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1618  putative lyase  52.24 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2337  putative lyase  52.24 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2475  putative lyase  52.24 
 
 		 339 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4429  Citrate lyase subunit beta-like protein  48.8 
 
 		 373 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00516467  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2553  HpcH/HpaI aldolase  48.78 
 
 		 332 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.108107  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1752  putative lyase  52.68 
 
 		 331 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4148  putative citrate lyase  46.08 
 
 		 331 aa  280  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4436  HpcH/HpaI aldolase  49.85 
 
 		 378 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3931  HpcH/HpaI aldolase  49.85 
 
 		 378 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3597  HpcH/HpaI aldolase  49.85 
 
 		 335 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2155  citrate lyase beta subunit-like  50.3 
 
 		 335 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3824  HpcH/HpaI aldolase  50.6 
 
 		 334 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.508893 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4731  HpcH/HpaI aldolase  42.35 
 
 		 334 aa  269  5.9999999999999995e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3308  HpcH/HpaI aldolase  50.3 
 
 		 334 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.747689 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4652  HpcH/HpaI aldolase  50.6 
 
 		 335 aa  264  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0797  putative lyase  52.63 
 
 		 307 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3165  Citryl-CoA lyase  29.34 
 
 		 320 aa  89.7  6e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0799  citrate (pro-3S)-lyase  28.93 
 
 		 341 aa  89  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3189  citrate (pro-3S)-lyase  31.64 
 
 		 301 aa  87  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0128752  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1719  Citrate (pro-3S)-lyase  30.31 
 
 		 325 aa  86.7  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.412951 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6315  HpcH/HpaI aldolase  29.09 
 
 		 349 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185554  hitchhiker  0.008113 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3050  citrate lyase subunit beta  28.23 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5924  citrate (pro-3S)-lyase  30.42 
 
 		 325 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1771  beta subunit of citrate lyase  30.04 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0417  Citryl-CoA lyase  30.04 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  30.67 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2481  citrate (pro-3S)-lyase  29.22 
 
 		 379 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.565353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7178  HpcH/HpaI aldolase  28.42 
 
 		 350 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102062  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3663  Citryl-CoA lyase  28.17 
 
 		 323 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  28.03 
 
 		 324 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1739  citrate lyase, beta subunit, putative  30.63 
 
 		 320 aa  79.3  0.00000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000771015  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1754  Citrate (pro-3S)-lyase  28.22 
 
 		 324 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2830  Citryl-CoA lyase  29.19 
 
 		 304 aa  79  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6559  citrate (pro-3S)-lyase  28.17 
 
 		 323 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527752  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4213  HpcH/HpaI aldolase  29.2 
 
 		 351 aa  79  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2805  HpcH/HpaI aldolase  28.39 
 
 		 355 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0471  citrate lyase  29.51 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.750948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0213  HpcH/HpaI aldolase  29.14 
 
 		 303 aa  77.8  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1253  Citryl-CoA lyase  32.81 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1580  Citryl-CoA lyase  26.84 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.264708  hitchhiker  0.00335996 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2138  Citrate (pro-3S)-lyase  27.53 
 
 		 324 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  33.62 
 
 		 286 aa  75.9  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1802  citrate (pro-3S)-lyase  27.53 
 
 		 324 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.23047 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4285  HpcH/HpaI aldolase  27.37 
 
 		 349 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0181473  normal  0.111861 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3870  HpcH/HpaI aldolase  29.91 
 
 		 346 aa  74.7  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3917  HpcH/HpaI aldolase  27.37 
 
 		 349 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.243397 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3254  Citryl-CoA lyase  28.52 
 
 		 327 aa  73.9  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0663527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2324  Citrate (pro-3S)-lyase  36.57 
 
 		 347 aa  74.3  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4390  HpcH/HpaI aldolase  25.58 
 
 		 349 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.345408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1154  Citrate (pro-3S)-lyase  35.44 
 
 		 288 aa  73.2  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  28.1 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1650  HpcH/HpaI aldolase  27.37 
 
 		 349 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.806088  normal  0.193855 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2804  citrate lyase  32.31 
 
 		 313 aa  72.8  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0830  citrate lyase  26.74 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0807208  normal  0.0919126 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6600  HpcH/HpaI aldolase  28.98 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.0929834 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3898  Citrate (pro-3S)-lyase  31.4 
 
 		 290 aa  70.9  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.107361  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  27.91 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1348  HpcH/HpaI aldolase  31.91 
 
 		 276 aa  70.1  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0217  citrate lyase  27.78 
 
 		 325 aa  68.9  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342299  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2581  putative citrate lyase beta subunit  29.33 
 
 		 278 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1621  HpcH/HpaI aldolase  34.5 
 
 		 362 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0115166  decreased coverage  0.0000000158082 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6514  HpcH/HpaI aldolase  28.3 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0406501 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0560  putative HpcH/HpaI aldolase  26.72 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00111477  normal  0.30107 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2561  citrate (pro-3S)-lyase  24.66 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4636  Citrate (pro-3S)-lyase  28.45 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1078  citrate lyase  28.44 
 
 		 316 aa  67  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132128  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1777  Citrate (pro-3S)-lyase  29.67 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  28.22 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3520  Citryl-CoA lyase  32.03 
 
 		 284 aa  66.2  0.0000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.897264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  28.22 
 
 		 292 aa  65.5  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3163  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  32.48 
 
 		 280 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.517185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3098  HpcH/HpaI aldolase  24.12 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136599  normal  0.227792 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2214  HpcH/HpaI aldolase  31.65 
 
 		 267 aa  65.5  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0660288  normal  0.0595234 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  30.23 
 
 		 286 aa  65.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4393  HpcH/HpaI aldolase  26.36 
 
 		 363 aa  65.9  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2028  HpcH/HpaI aldolase  31.36 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2166  citrate lyase  28.51 
 
 		 338 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4487  citrate (pro-3S)-lyase  29.41 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0353068  normal  0.0397424 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>