More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3437 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3437  Peptidase M23  100 
 
 
296 aa  595  1e-169  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.112257  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  36.52 
 
 
569 aa  76.6  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  35.44 
 
 
425 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  35.44 
 
 
425 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  34.97 
 
 
412 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  43.33 
 
 
503 aa  73.6  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  38.79 
 
 
421 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  37.9 
 
 
490 aa  73.6  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  38.79 
 
 
421 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  37.93 
 
 
420 aa  72  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1900  M24/M37 family peptidase  38.74 
 
 
471 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0520216  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  37.93 
 
 
400 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2055  peptidase  38.74 
 
 
512 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.485622  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1887  M24/M37 family peptidase  38.74 
 
 
472 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0768301  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2447  M23/M37 familypeptidase  40.54 
 
 
499 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.372819  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  35.16 
 
 
465 aa  70.5  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0321  metallopeptidase  38.74 
 
 
509 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255107  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1665  peptidase  38.74 
 
 
470 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  31.2 
 
 
312 aa  70.1  0.00000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2495  Peptidase M23  42.73 
 
 
331 aa  70.1  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  38.68 
 
 
533 aa  69.3  0.00000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  35.35 
 
 
470 aa  68.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0504  peptidase M23B  41.3 
 
 
419 aa  68.9  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  36.7 
 
 
474 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  36.7 
 
 
475 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3784  M24/M37 family peptidase  35.16 
 
 
439 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4275  peptidase M23B  37.39 
 
 
695 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0353482 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2607  peptidase M23B  36.96 
 
 
581 aa  68.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0305  peptidase M23  40.74 
 
 
294 aa  67.4  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0127827  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2136  Peptidase M23  39.39 
 
 
437 aa  67  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1360  Peptidase M23  31.61 
 
 
348 aa  67.4  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.119813  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  38.83 
 
 
325 aa  67.4  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05623  hypothetical protein  37.38 
 
 
328 aa  67  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  36.96 
 
 
480 aa  67  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4919  Peptidase M23  35.65 
 
 
676 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  33.91 
 
 
687 aa  66.6  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  35.09 
 
 
460 aa  66.2  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  35.51 
 
 
387 aa  66.2  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  31.25 
 
 
590 aa  65.9  0.0000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3774  peptidase M23B  42.06 
 
 
266 aa  65.9  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0660  peptidase M23B  35.65 
 
 
690 aa  65.9  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.375288  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0681  M24/M37 family peptidase  36.96 
 
 
577 aa  65.9  0.0000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19390  metalloendopeptidase-like membrane protein  38.4 
 
 
287 aa  65.1  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.341339  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4572  Peptidase M23  35.94 
 
 
615 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  35.51 
 
 
313 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  35.14 
 
 
457 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3111  peptidase M23B  36.07 
 
 
225 aa  65.1  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.324565  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  35.51 
 
 
233 aa  65.1  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  37.23 
 
 
439 aa  65.1  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3063  peptidase M23B  35.71 
 
 
377 aa  65.1  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000502081  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  36.36 
 
 
303 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  36.13 
 
 
824 aa  65.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3607  peptidase M23B  36.28 
 
 
469 aa  65.1  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0610326  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0955  Peptidase M23  36.11 
 
 
699 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0673  M24/M37 family peptidase  35.87 
 
 
577 aa  64.3  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38498  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5408  Peptidase M23  38.32 
 
 
538 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252675  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3533  Peptidase M23  41.3 
 
 
321 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1023  peptidase M23B  36.11 
 
 
697 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.490188 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0352  peptidase M23B  38.89 
 
 
430 aa  64.3  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3386  peptidase M23B  41.3 
 
 
318 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4245  peptidase M23B  33.91 
 
 
680 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  32.31 
 
 
238 aa  64.3  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4092  peptidase M23B  34.78 
 
 
681 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2227  peptidase M23B  37.1 
 
 
172 aa  64.7  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3469  Peptidase M23  41.3 
 
 
319 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318022  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4328  peptidase M23B  36.45 
 
 
360 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4708  peptidase M23B  36.45 
 
 
360 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  31.75 
 
 
741 aa  64.3  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3043  peptidase M23B  37.37 
 
 
621 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1150  Peptidase M23  36.11 
 
 
697 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.812424  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4414  peptidase M23B  36.45 
 
 
360 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307323  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  33.7 
 
 
473 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3257  peptidase M23  37.09 
 
 
450 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000116683  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  34.41 
 
 
477 aa  63.9  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  34.41 
 
 
477 aa  63.9  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2268  Peptidase M23  32.37 
 
 
344 aa  64.3  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177888  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  34.86 
 
 
503 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5984  peptidase M23B  35.71 
 
 
284 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0310033  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4988  peptidase M23B  37.18 
 
 
457 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  33.33 
 
 
517 aa  63.9  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3172  peptidase M23B  37.18 
 
 
457 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2717  Peptidase M23  35.46 
 
 
272 aa  63.9  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000153286  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  33.7 
 
 
475 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  35.94 
 
 
229 aa  63.5  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  33.7 
 
 
473 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2125  peptidase M23B  36.54 
 
 
249 aa  63.5  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000148266  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0197  peptidase M23B  32.62 
 
 
192 aa  63.5  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00125912  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1331  M23 peptidase domain-containing protein  35.92 
 
 
389 aa  63.5  0.000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0203  peptidase M23B  32.62 
 
 
192 aa  63.5  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0953  Peptidase M23  33.94 
 
 
336 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0464  peptidase M23B  38.89 
 
 
484 aa  63.2  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2498  peptidase M23B  34.19 
 
 
646 aa  63.2  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.13296 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000457  peptidase M23  31.78 
 
 
325 aa  63.5  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2941  peptidase M23B  38.1 
 
 
454 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00362  peptidase  34.13 
 
 
279 aa  62.8  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0922306  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  32.76 
 
 
460 aa  62.8  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3948  peptidase M23B  36.52 
 
 
311 aa  62.8  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.703848  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4205  peptidase M23B  34.03 
 
 
236 aa  62.8  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2390  peptidase M23  35.19 
 
 
674 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  33.7 
 
 
472 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>