281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2162 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2162  amine oxidase  100 
 
 		 811 aa  1628    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.352891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5459  amine oxidase  48.33 
 
 		 506 aa  415  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.723961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5080  amine oxidase  47.92 
 
 		 506 aa  412  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.984429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5168  amine oxidase  47.92 
 
 		 506 aa  412  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26460  hypothetical protein  48.33 
 
 		 482 aa  404  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.214193  normal  0.663003 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1844  amine oxidase  46.75 
 
 		 511 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3813  amine oxidase  48.19 
 
 		 523 aa  399  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966571  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3090  putative beta-carotene desaturase/methylase  45.95 
 
 		 520 aa  383  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1580  amine oxidase  47.05 
 
 		 481 aa  385  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.128087  normal  0.0872032 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4947  amine oxidase  45.81 
 
 		 551 aa  363  8e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00497379  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3570  amine oxidase  43.62 
 
 		 546 aa  355  2e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.145794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0282  amine oxidase  45.8 
 
 		 508 aa  347  4e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112092  normal  0.233816 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0241  amine oxidase  45.03 
 
 		 508 aa  346  8e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2500  amine oxidase  43.07 
 
 		 519 aa  340  7e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00015741  hitchhiker  0.0084988 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3812  Rieske (2Fe-2S) domain protein  51.82 
 
 		 325 aa  288  2.9999999999999996e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1581  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  48.95 
 
 		 335 aa  276  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812557  normal  0.120024 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5460  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  50.33 
 
 		 338 aa  274  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5081  Rieske (2Fe-2S) region  50.33 
 
 		 338 aa  272  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.040812  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5169  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  50.33 
 
 		 338 aa  272  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.787894  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3571  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  48.7 
 
 		 336 aa  260  8e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3077  putative methylesterase  47.56 
 
 		 334 aa  257  7e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0868692  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26470  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  48.69 
 
 		 335 aa  253  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.241643  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1843  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45.74 
 
 		 367 aa  240  6.999999999999999e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2256  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.13 
 
 		 643 aa  163  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.429922  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1698  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.66 
 
 		 640 aa  162  3e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0435  gamma-carotene desaturase  40.55 
 
 		 639 aa  160  9e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1875  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.25 
 
 		 639 aa  158  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0135993 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0659  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.94 
 
 		 644 aa  153  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.31 
 
 		 642 aa  151  5e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  35.91 
 
 		 647 aa  140  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  35.91 
 
 		 647 aa  140  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  34.72 
 
 		 647 aa  140  8.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  34.42 
 
 		 645 aa  136  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3577  UDP-galactopyranose mutase  33.02 
 
 		 648 aa  135  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0482479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0368  amine oxidase  26.04 
 
 		 503 aa  107  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4330  amine oxidase  27.14 
 
 		 500 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  26.28 
 
 		 488 aa  102  3e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0830  zeta-carotene desaturase  24.95 
 
 		 453 aa  101  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.762196  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  25.77 
 
 		 488 aa  101  7e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  25.2 
 
 		 482 aa  100  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3430  carotene 7,8-desaturase  25.69 
 
 		 490 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  23.43 
 
 		 499 aa  100  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0679  carotene 7,8-desaturase  24.59 
 
 		 489 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2686  carotene 7,8-desaturase  25.69 
 
 		 490 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3736  amine oxidase  27.1 
 
 		 520 aa  99.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  26.89 
 
 		 589 aa  99.4  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  25.2 
 
 		 478 aa  98.6  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  25.05 
 
 		 483 aa  97.4  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  24.84 
 
 		 453 aa  95.5  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  24.52 
 
 		 455 aa  94.7  6e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3204  squalene-associated FAD-dependent desaturase  24.67 
 
 		 477 aa  94.7  6e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.55236  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  22.56 
 
 		 484 aa  94  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  25.79 
 
 		 453 aa  94  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  23.55 
 
 		 486 aa  93.2  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4788  carotene 7,8-desaturase  25.25 
 
 		 479 aa  93.2  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0916  Carotene 7,8-desaturase  23.06 
 
 		 453 aa  92  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  25 
 
 		 486 aa  91.3  6e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  23.42 
 
 		 484 aa  91.3  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0200  zeta-carotene desaturase  24.55 
 
 		 479 aa  90.1  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  26.25 
 
 		 471 aa  89.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  22.02 
 
 		 484 aa  90.1  2e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4135  carotene 7,8-desaturase  27.88 
 
 		 451 aa  87.8  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  25.05 
 
 		 453 aa  86.3  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  24.26 
 
 		 479 aa  86.7  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15806  pds-like3, phytoene desaturase-like protein  25.71 
 
 		 506 aa  84  0.000000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.488175  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  24.63 
 
 		 459 aa  84.3  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53974  zeta-carotene desaturase  22.18 
 
 		 591 aa  82.8  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.246168  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  27.35 
 
 		 438 aa  83.2  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  24.74 
 
 		 475 aa  82.8  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  24.9 
 
 		 475 aa  82.4  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  22.94 
 
 		 453 aa  78.6  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4516  amine oxidase  26.47 
 
 		 432 aa  78.2  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23100  squalene-associated FAD-dependent desaturase  26.82 
 
 		 439 aa  77.8  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.620646  normal  0.191871 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  24.64 
 
 		 473 aa  77.8  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26211  zeta-carotene desaturase  25.1 
 
 		 490 aa  77.8  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1512  zeta-carotene desaturase  22.13 
 
 		 481 aa  77  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.311968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  24.95 
 
 		 472 aa  76.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  22.75 
 
 		 599 aa  75.9  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  23.23 
 
 		 466 aa  75.5  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  22.92 
 
 		 465 aa  75.1  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2440  squalene-associated FAD-dependent desaturase  25.85 
 
 		 447 aa  73.9  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  25.52 
 
 		 477 aa  73.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  24.38 
 
 		 472 aa  73.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  22.98 
 
 		 466 aa  73.9  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1346  zeta-carotene desaturase-like  26.09 
 
 		 543 aa  73.2  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  23.3 
 
 		 474 aa  72  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  24.13 
 
 		 552 aa  70.9  0.00000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  22.77 
 
 		 472 aa  70.5  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  23.32 
 
 		 463 aa  70.5  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5326  amine oxidase  26.93 
 
 		 452 aa  68.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  24.53 
 
 		 479 aa  69.3  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4945  amine oxidase  26.93 
 
 		 452 aa  68.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5033  amine oxidase  26.93 
 
 		 452 aa  68.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  23.09 
 
 		 472 aa  68.9  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  23.24 
 
 		 461 aa  68.2  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  22.18 
 
 		 624 aa  67.8  0.0000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  23.81 
 
 		 462 aa  67.4  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11831  zeta-carotene desaturase-like protein  26.01 
 
 		 543 aa  67.4  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.253964 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  23.6 
 
 		 464 aa  66.2  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6709  Rieske (2Fe-2S) protein  44.19 
 
 		 373 aa  65.1  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>