178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5081 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5081  Rieske (2Fe-2S) region  100 
 
 		 338 aa  677    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.040812  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5169  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 		 338 aa  677    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.787894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5460  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  97.63 
 
 		 338 aa  662    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1843  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  65.67 
 
 		 367 aa  436  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1581  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  66.07 
 
 		 335 aa  434  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812557  normal  0.120024 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26470  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  64.42 
 
 		 335 aa  420  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.241643  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3812  Rieske (2Fe-2S) domain protein  62.18 
 
 		 325 aa  376  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3077  putative methylesterase  60 
 
 		 334 aa  354  1e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0868692  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3571  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  58.15 
 
 		 336 aa  332  5e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2162  amine oxidase  50.33 
 
 		 811 aa  272  5.000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.352891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2492  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  40 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1442  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.67 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193123  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1576  Rieske (2Fe-2S) region  37.18 
 
 		 358 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.221742  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5267  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.9 
 
 		 370 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1867  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  40.58 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.687816 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1389  putative oxygenase  32.74 
 
 		 359 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0844  Rieske (2Fe-2S) region  25.97 
 
 		 349 aa  58.5  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7059  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.16 
 
 		 364 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2387  normal  0.465604 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1488  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.89 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0113839  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6709  Rieske (2Fe-2S) protein  39.44 
 
 		 373 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2888  PrnD  37.18 
 
 		 370 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.942193  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2050  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  29.1 
 
 		 327 aa  57  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0319051  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0420  Rieske (2Fe-2S) protein  26.79 
 
 		 373 aa  57  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.1 
 
 		 373 aa  56.6  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.28876 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2143  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.69 
 
 		 372 aa  55.8  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0964  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.98 
 
 		 341 aa  55.8  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2736  PrnD  35.9 
 
 		 370 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4729  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.62 
 
 		 370 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3570  Rieske (2Fe-2S) region  27.47 
 
 		 355 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0161982  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1296  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.27 
 
 		 367 aa  55.1  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1448  Rieske (2Fe-2S) protein  44.62 
 
 		 359 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5029  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.6 
 
 		 359 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0175  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  26.16 
 
 		 363 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3124  Rieske (2Fe-2S) region  25.6 
 
 		 359 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439622  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5243  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.6 
 
 		 359 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6986  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.69 
 
 		 374 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.529476  normal  0.476808 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2045  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.42 
 
 		 355 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2904  vanillate O-demethylase, oxygenase subunit  31.17 
 
 		 354 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2686  Rieske (2Fe-2S) protein  40 
 
 		 376 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0344  Rieske (2Fe-2S) protein  35.21 
 
 		 353 aa  54.3  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2708  Rieske [2Fe-2S] region  31.17 
 
 		 354 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.104354  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3984  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.6 
 
 		 356 aa  53.9  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.643695  normal  0.0193847 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5693  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.03 
 
 		 352 aa  53.9  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0280  Rieske (2Fe-2S) protein  35.21 
 
 		 351 aa  53.9  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2170  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.62 
 
 		 355 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.461217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  34.78 
 
 		 334 aa  53.1  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5946  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.74 
 
 		 341 aa  53.1  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.930147 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3736  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.21 
 
 		 355 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.554225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4269  vanillate monooxygenase  40 
 
 		 351 aa  53.1  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2027  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.21 
 
 		 355 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13559  oxidoreductase  38.24 
 
 		 386 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000136875 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1118  PrnD  35.62 
 
 		 346 aa  52.8  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3681  Rieske (2Fe-2S) region  32.58 
 
 		 346 aa  52.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.2267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2753  Rieske (2Fe-2S) region  41.25 
 
 		 342 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0222  vanillate O-demethylase oxygenase subunit oxidoreductase protein  37.14 
 
 		 342 aa  51.6  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000016692  normal  0.0221534 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1352  vanillate monooxygenase  39.44 
 
 		 363 aa  51.6  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1105  Rieske (2Fe-2S) protein  25.6 
 
 		 358 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.080608  normal  0.368914 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2688  Rieske (2Fe-2S) protein  32.94 
 
 		 352 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3658  Rieske (2Fe-2S) region  24.87 
 
 		 356 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4709  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.87 
 
 		 356 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700082  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5124  vanillate monooxygenase  25 
 
 		 359 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4642  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.5 
 
 		 355 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.0329483 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2516  Rieske (2Fe-2S) domain protein  45.33 
 
 		 326 aa  52  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00793645  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5591  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.87 
 
 		 356 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790855 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4510  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.5 
 
 		 355 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25 
 
 		 356 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2725  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.21 
 
 		 354 aa  50.8  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0149406 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4568  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25 
 
 		 356 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.380862  hitchhiker  0.000303241 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4591  vanillate monooxygenase  25.75 
 
 		 373 aa  50.4  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.672566 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64800  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  34.21 
 
 		 351 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0565633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3160  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.37 
 
 		 347 aa  50.4  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3784  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.25 
 
 		 342 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26228  predicted protein  35.06 
 
 		 668 aa  50.4  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.281249  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0504  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.99 
 
 		 337 aa  50.1  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.725699  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5628  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  34.21 
 
 		 351 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.834519  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4233  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.84 
 
 		 362 aa  49.7  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3967  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.58 
 
 		 347 aa  49.7  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0627  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.07 
 
 		 361 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0218  Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  32.39 
 
 		 444 aa  49.3  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.163513  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0132  Rieske (2Fe-2S) protein  27.81 
 
 		 343 aa  49.3  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07721  Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  29.07 
 
 		 439 aa  49.3  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.725202  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08501  Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  32.39 
 
 		 444 aa  49.7  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185666 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0436  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.98 
 
 		 326 aa  49.7  0.00008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0659  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.07 
 
 		 361 aa  49.3  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.210033 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3509  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.67 
 
 		 386 aa  49.3  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119894  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  28.57 
 
 		 345 aa  48.9  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.71 
 
 		 347 aa  49.3  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0195459 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1185  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.17 
 
 		 364 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2502  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.54 
 
 		 332 aa  48.9  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1485  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.84 
 
 		 343 aa  48.9  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0648  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.16 
 
 		 361 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.149026 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5949  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.62 
 
 		 342 aa  49.3  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.193657 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.29 
 
 		 358 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4244  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.23 
 
 		 352 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2518  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.67 
 
 		 398 aa  48.5  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4325  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  33.61 
 
 		 369 aa  48.1  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4516  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.88 
 
 		 373 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4116  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.56 
 
 		 335 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.275911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4278  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  22.87 
 
 		 362 aa  48.5  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.844018 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1335  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.31 
 
 		 351 aa  47.8  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.819447 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>