273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_3077 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_3077  putative methylesterase  100 
 
 
334 aa  655    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0868692  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3571  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  74.29 
 
 
336 aa  464  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3812  Rieske (2Fe-2S) domain protein  67.69 
 
 
325 aa  441  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26470  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  65.83 
 
 
335 aa  406  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.241643  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5460  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  60 
 
 
338 aa  360  2e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1843  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  58.31 
 
 
367 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5081  Rieske (2Fe-2S) region  60 
 
 
338 aa  354  1e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.040812  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5169  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  60 
 
 
338 aa  354  1e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.787894  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1581  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  58.07 
 
 
335 aa  348  8e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812557  normal  0.120024 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2162  amine oxidase  47.56 
 
 
811 aa  257  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.352891  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4278  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.57 
 
 
362 aa  74.7  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.844018 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5124  vanillate monooxygenase  29.79 
 
 
359 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14115  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0280  Rieske (2Fe-2S) protein  28.42 
 
 
351 aa  72.8  0.000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0420  Rieske (2Fe-2S) protein  29.47 
 
 
373 aa  72  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5029  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.26 
 
 
359 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1296  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.34 
 
 
367 aa  72.4  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2045  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.02 
 
 
355 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3124  Rieske (2Fe-2S) region  29.26 
 
 
359 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439622  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4591  vanillate monooxygenase  28.71 
 
 
373 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.672566 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5243  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.26 
 
 
359 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2725  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.8 
 
 
354 aa  70.5  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0149406 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0132  Rieske (2Fe-2S) protein  29 
 
 
343 aa  70.5  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0344  Rieske (2Fe-2S) protein  27.13 
 
 
353 aa  69.7  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64800  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  30.51 
 
 
351 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0565633  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2027  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.32 
 
 
355 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3736  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.94 
 
 
355 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.554225  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1103  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.76 
 
 
362 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5693  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.92 
 
 
352 aa  67.4  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3967  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26 
 
 
347 aa  66.2  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2170  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.32 
 
 
355 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.461217  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2904  vanillate O-demethylase, oxygenase subunit  28.09 
 
 
354 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0844  Rieske (2Fe-2S) region  26.8 
 
 
349 aa  65.5  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1687  vanillate monooxygenase  33.54 
 
 
338 aa  65.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4257  Rieske (2Fe-2S) domain protein  23.53 
 
 
349 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1352  vanillate monooxygenase  29.38 
 
 
363 aa  64.7  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1827  Rieske (2Fe-2S) region  23.81 
 
 
347 aa  63.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1130  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.29 
 
 
362 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0812255  normal  0.937672 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0222  vanillate O-demethylase oxygenase subunit oxidoreductase protein  30.21 
 
 
342 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000016692  normal  0.0221534 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5949  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45.12 
 
 
342 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.193657 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0336  Rieske (2Fe-2S) protein  28.93 
 
 
370 aa  63.9  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1336  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.66 
 
 
355 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2494  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.66 
 
 
355 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0595  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.66 
 
 
355 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0958903  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1234  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.66 
 
 
355 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0319  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.66 
 
 
355 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.456896  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0972  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.66 
 
 
355 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1307  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.66 
 
 
355 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.992701  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3160  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.53 
 
 
347 aa  62.4  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2708  Rieske [2Fe-2S] region  27.12 
 
 
354 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.104354  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5946  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.78 
 
 
341 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.930147 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5628  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  27.72 
 
 
351 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.834519  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26080  vanillate demethylase subunit A  24.52 
 
 
377 aa  62.4  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.819244  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4233  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.84 
 
 
362 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0964  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.44 
 
 
341 aa  60.5  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1335  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.44 
 
 
351 aa  60.5  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.819447 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1389  putative oxygenase  29.84 
 
 
359 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1575  Rieske (2Fe-2S) protein  27.11 
 
 
346 aa  59.7  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.869006  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2239  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.48 
 
 
350 aa  59.7  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1542  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.25 
 
 
366 aa  59.7  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0106115  decreased coverage  0.000412121 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3246  vanillate monooxygenase  27.93 
 
 
347 aa  59.7  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546586  normal  0.604076 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1501  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.05 
 
 
355 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0648  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.59 
 
 
361 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.149026 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4139  Vanillate monooxygenase  28.93 
 
 
347 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105569  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1908  Rieske (2Fe-2S) protein  26.45 
 
 
347 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.127579  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0659  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.42 
 
 
361 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.210033 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5591  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.83 
 
 
356 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00790855 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1321  Rieske (2Fe-2S) region  39.73 
 
 
351 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5422  oxidoreductase protein  36.9 
 
 
230 aa  58.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2184  vanillate O-demethylase oxygenase, iron-sulfur subunit  23.6 
 
 
347 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3024  vanillate monooxygenase  26.25 
 
 
361 aa  57.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6508  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.73 
 
 
351 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1235  Rieske (2Fe-2S) domain protein  23.75 
 
 
349 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0627  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.59 
 
 
361 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.37 
 
 
347 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0195459 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1105  Rieske (2Fe-2S) protein  26.83 
 
 
358 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.080608  normal  0.368914 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6099  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.73 
 
 
351 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3658  Rieske (2Fe-2S) region  26.83 
 
 
356 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4709  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.83 
 
 
356 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700082  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1485  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.51 
 
 
343 aa  57.4  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3266  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.47 
 
 
353 aa  57  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2521  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.09 
 
 
343 aa  57  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171957  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4568  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.22 
 
 
356 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.380862  hitchhiker  0.000303241 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.22 
 
 
356 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3984  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.22 
 
 
356 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.643695  normal  0.0193847 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0175  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  26.67 
 
 
363 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  25.24 
 
 
367 aa  55.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4340  Rieske (2Fe-2S) region  33.78 
 
 
350 aa  55.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3952  Rieske (2Fe-2S) protein  29.52 
 
 
340 aa  55.8  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.112958 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2074  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.84 
 
 
217 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.12491  normal  0.0463704 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7059  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.11 
 
 
364 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2387  normal  0.465604 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1535  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.1 
 
 
331 aa  55.1  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3681  Rieske (2Fe-2S) region  26.82 
 
 
346 aa  54.7  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.2267  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7105  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.46 
 
 
361 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.811582  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0436  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.85 
 
 
326 aa  53.9  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1576  Rieske (2Fe-2S) region  33.33 
 
 
358 aa  54.3  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.221742  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3569  Rieske (2Fe-2S) region  25.73 
 
 
341 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3642  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.73 
 
 
341 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.55041  normal  0.365786 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4269  vanillate monooxygenase  29.52 
 
 
351 aa  53.9  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1241  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.53 
 
 
217 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.635525  normal  0.124818 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4419  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  26.11 
 
 
367 aa  53.9  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>