More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1917 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1917  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 361 aa  721    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1995  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.99 
 
 		 335 aa  140  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2196  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.05 
 
 		 339 aa  140  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.71701 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1652  DNA polymerase III, delta prime subunit  41.67 
 
 		 331 aa  134  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0007  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.43 
 
 		 351 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0298207  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2042  DNA-directed DNA polymerase  41.84 
 
 		 304 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0609  DNA polymerase III subunit delta'  39.11 
 
 		 319 aa  127  4.0000000000000003e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0255867  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1576  DNA polymerase III subunit delta'  39.11 
 
 		 319 aa  127  4.0000000000000003e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.133264  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2451  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.13 
 
 		 318 aa  123  5e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135157  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2571  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.63 
 
 		 318 aa  123  5e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.196352  normal  0.086607 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1893  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.63 
 
 		 318 aa  123  5e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0485573 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1252  DNA-directed DNA polymerase  40.34 
 
 		 324 aa  123  5e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.83429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2458  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.63 
 
 		 318 aa  122  8e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.022565  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1659  DNA polymerase III subunit delta'  37.43 
 
 		 337 aa  122  8e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0356982  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2050  DNA polymerase III, delta prime subunit  40.22 
 
 		 321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1828  DNA-directed DNA polymerase  32.09 
 
 		 321 aa  120  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1662  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.07 
 
 		 318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1692  DNA polymerase III subunit delta'  29.23 
 
 		 340 aa  119  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0197649  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2612  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.87 
 
 		 318 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1737  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.62 
 
 		 318 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.595933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14980  DNA polymerase III subunit delta'  40.1 
 
 		 328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  42.94 
 
 		 331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1629  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.08 
 
 		 336 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000209012  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1767  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.16 
 
 		 318 aa  116  6e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.358719  normal  0.672365 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1584  DNA polymerase III subunit delta'  28.52 
 
 		 340 aa  116  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000282591  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3492  DNA polymerase III subunit delta'  29.23 
 
 		 335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000181629  normal  0.0164304 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2213  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.33 
 
 		 318 aa  114  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0719  DNA-directed DNA polymerase  39.13 
 
 		 325 aa  113  5e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1580  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.83 
 
 		 304 aa  113  6e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.989268  normal  0.574364 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02329  DNA polymerase III subunit delta  35 
 
 		 295 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2497  DNA polymerase III subunit delta'  28.78 
 
 		 336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0020165  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2801  DNA polymerase III subunit delta'  28.03 
 
 		 336 aa  110  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.162966  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2200  DNA polymerase III subunit delta'  38.98 
 
 		 328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825547  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1634  DNA polymerase III subunit delta'  37.08 
 
 		 330 aa  110  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2502  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.9 
 
 		 347 aa  110  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.477235  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1574  DNA-directed DNA polymerase  39.67 
 
 		 343 aa  109  9.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1499  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.63 
 
 		 334 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.28752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1095  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.84 
 
 		 342 aa  109  9.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.296498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2266  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.96 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal  0.54059 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1924  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.29 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1940  DNA polymerase III subunit delta'  36.41 
 
 		 344 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.990114  normal  0.368252 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1607  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.23 
 
 		 323 aa  108  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1757  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6483  DNA-directed DNA polymerase  42.38 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1415  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.01 
 
 		 337 aa  108  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.100204  normal  0.602163 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25760  DNA polymerase III subunit delta'  38.42 
 
 		 328 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.644565 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0037  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.77 
 
 		 338 aa  107  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.418255  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1391  DNA-directed DNA polymerase  32.72 
 
 		 374 aa  107  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000825197 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02902  DNA polymerase III subunit delta'  33.69 
 
 		 320 aa  107  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1593  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.89 
 
 		 336 aa  107  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.273592  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1801  DNA polymerase III subunit delta'  34.95 
 
 		 342 aa  106  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500907  normal  0.955081 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1382  DNA polymerase III subunit delta'  33.82 
 
 		 342 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4151  DNA polymerase III subunit delta'  37.08 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1859  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.38 
 
 		 357 aa  105  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.276921 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2116  DNA-directed DNA polymerase  29.17 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.113627  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1829  DNA polymerase III subunit delta'  33.98 
 
 		 342 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003002  DNA polymerase III delta prime subunit  34.24 
 
 		 320 aa  104  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1601  DNA polymerase III subunit delta'  34.76 
 
 		 324 aa  105  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.482029  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6187  DNA polymerase III subunit delta'  35.05 
 
 		 342 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.557746  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1892  DNA polymerase III subunit delta'  35.05 
 
 		 342 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700458  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1915  DNA polymerase III subunit delta'  35.05 
 
 		 342 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0504294 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1653  DNA polymerase III subunit delta'  35.59 
 
 		 328 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0730579  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26180  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  40.24 
 
 		 394 aa  103  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0366865  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1360  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.44 
 
 		 345 aa  103  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3826  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.03 
 
 		 328 aa  103  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.070255  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03680  DNA polymerase III, delta' subunit  43.1 
 
 		 396 aa  103  6e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0117112  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5192  DNA polymerase III subunit delta'  34.54 
 
 		 342 aa  102  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1065  DNA-directed DNA polymerase  33.8 
 
 		 372 aa  102  9e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.910858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.63 
 
 		 358 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0515  DNA-directed DNA polymerase  36.42 
 
 		 320 aa  102  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0983279  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1827  DNA polymerase III subunit delta'  35.85 
 
 		 337 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.0140286 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1486  DNA polymerase III subunit delta'  36.11 
 
 		 352 aa  102  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.585523  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0965  DNA-directed DNA polymerase  32.86 
 
 		 377 aa  101  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.824295  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2246  putative DNA polymerase III, delta' subunit  33.51 
 
 		 323 aa  102  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1531  DNA polymerase III subunit delta'  35.82 
 
 		 328 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.388173 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1465  DNA polymerase III subunit delta'  35.03 
 
 		 336 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.186588  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0878  DNA polymerase III subunit delta'  35.75 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1879  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.16 
 
 		 360 aa  100  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0526572 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1614  DNA polymerase III subunit delta'  28.78 
 
 		 334 aa  100  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000870759  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2303  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.38 
 
 		 331 aa  100  6e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1640  DNA polymerase III subunit delta'  36.11 
 
 		 330 aa  99.4  9e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1912  DNA polymerase III subunit delta'  34.48 
 
 		 335 aa  99.4  9e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735581  hitchhiker  0.00000697955 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1966  DNA polymerase III subunit delta'  35.59 
 
 		 328 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.63902  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1496  DNA polymerase III subunit delta'  36.16 
 
 		 328 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1313  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.95 
 
 		 366 aa  99  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1435  DNA polymerase III subunit delta'  33.78 
 
 		 337 aa  99  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3794  DNA polymerase III subunit delta'  35.59 
 
 		 328 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425215  normal  0.36128 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0884  DNA-directed DNA polymerase  31.58 
 
 		 373 aa  99  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.772568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1424  DNA polymerase III subunit delta'  34.12 
 
 		 336 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1664  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.38 
 
 		 327 aa  99  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.988179  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2647  DNA-directed DNA polymerase  35.29 
 
 		 304 aa  97.8  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.11798 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0430  DNA polymerase III, delta' subunit  25.94 
 
 		 332 aa  98.2  2e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1315  DNA polymerase III subunit delta'  32.35 
 
 		 334 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000035358 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02714  DNA polymerase III subunit delta'  34.34 
 
 		 319 aa  97.1  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.577208  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1300  DNA polymerase III subunit delta'  31.86 
 
 		 334 aa  97.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0293645  hitchhiker  0.00000000000521382 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1985  DNA polymerase III subunit delta'  31.86 
 
 		 334 aa  97.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000277224  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1014  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.03 
 
 		 398 aa  97.1  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.561354 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2698  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.87 
 
 		 334 aa  96.7  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20360  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.39 
 
 		 326 aa  96.7  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1277  DNA polymerase III subunit delta'  31.86 
 
 		 334 aa  96.3  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.867386 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2168  DNA polymerase III subunit delta'  31.86 
 
 		 334 aa  96.3  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000087583 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>