239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2803 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2803  ABC-2 type transporter  100 
 
 
252 aa  481  1e-135  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363524  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2484  ABC-2 type transporter  67.29 
 
 
263 aa  310  2e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0327  ABC-2 type transporter  66.93 
 
 
251 aa  290  2e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.461338  normal  0.0259517 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3298  ABC-2 type transporter  62.45 
 
 
257 aa  287  1e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1192  ABC-2 type transporter  63.22 
 
 
257 aa  286  2.9999999999999996e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  32.23 
 
 
250 aa  77  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4202  ABC-2 type transporter  30.33 
 
 
258 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  32.27 
 
 
280 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  29.36 
 
 
276 aa  68.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  30.85 
 
 
293 aa  67  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3044  ABC-2 type transporter  27.32 
 
 
269 aa  67.8  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.375207 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  30.49 
 
 
256 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  34.21 
 
 
261 aa  65.9  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  27.67 
 
 
261 aa  63.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2769  ABC-2 type transporter  28.05 
 
 
413 aa  63.2  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.160651  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  27.39 
 
 
285 aa  62.4  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  28.51 
 
 
251 aa  62  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1448  ABC-2 type transporter  30 
 
 
251 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0318973  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.96 
 
 
249 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  24.1 
 
 
360 aa  61.2  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  23.49 
 
 
360 aa  60.1  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3103  ABC transporter protein  29.86 
 
 
280 aa  59.3  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  24.1 
 
 
339 aa  59.3  0.00000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 
249 aa  59.3  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.17 
 
 
254 aa  59.3  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  23.97 
 
 
250 aa  58.9  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  29.9 
 
 
241 aa  58.5  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  27.65 
 
 
254 aa  58.5  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  30.17 
 
 
281 aa  57.8  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  25.51 
 
 
251 aa  58.5  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  28.02 
 
 
266 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  26.83 
 
 
251 aa  57.4  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3106  ABC-2 type transporter  30.2 
 
 
278 aa  57  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708923  hitchhiker  0.000220198 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  29.06 
 
 
367 aa  56.2  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  30.21 
 
 
278 aa  56.2  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  27.15 
 
 
280 aa  55.5  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  28 
 
 
376 aa  55.5  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1576  hypothetical protein  33.54 
 
 
256 aa  55.5  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  25.97 
 
 
285 aa  55.5  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.32 
 
 
249 aa  55.5  0.0000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  20.83 
 
 
254 aa  55.5  0.0000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  33.11 
 
 
304 aa  54.7  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4936  ABC-2 type transporter  28.19 
 
 
280 aa  54.7  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707728  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  27.84 
 
 
256 aa  55.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 
378 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2221  ABC-2 type transporter  27.98 
 
 
241 aa  53.9  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0188043 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  25.84 
 
 
376 aa  54.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6787  ABC-2 type transporter  27.06 
 
 
268 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000212784  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  25.89 
 
 
278 aa  54.3  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  27.5 
 
 
261 aa  53.9  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0096  ABC-2 type transporter  27.07 
 
 
247 aa  53.9  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  28.81 
 
 
371 aa  53.5  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4310  ABC-2 type transporter  28.73 
 
 
390 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  24.77 
 
 
242 aa  53.1  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4656  ABC-2 type transporter  27.24 
 
 
285 aa  53.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  31.02 
 
 
290 aa  52.8  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6131  ABC-2 type transporter  26.74 
 
 
358 aa  52.8  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862302  normal  0.0100987 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3224  ABC-2 type transporter  29.61 
 
 
383 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13853  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  25 
 
 
363 aa  52.8  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3309  ABC-2 type transporter  29.13 
 
 
383 aa  52.4  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6512  ABC-2 type transporter  26.34 
 
 
359 aa  52.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102415  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2021  hypothetical protein  27 
 
 
289 aa  52.8  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.290119  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3881  ABC-2 type transporter  28.34 
 
 
263 aa  52.8  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.574088  normal  0.697417 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  27.06 
 
 
280 aa  52.4  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  27.44 
 
 
272 aa  52  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 
367 aa  52.4  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5259  ABC-2 type transporter  26.03 
 
 
277 aa  52  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6250  ABC-2 type transporter  26.96 
 
 
285 aa  52  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243116  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  28.04 
 
 
366 aa  52  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7430  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.49 
 
 
359 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104702  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  27.5 
 
 
370 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3172  ABC-2 type transporter  28.81 
 
 
279 aa  52  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  27.23 
 
 
285 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5656  ABC-2 type transporter  26.34 
 
 
359 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78729  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6021  ABC-2 type transporter  26.34 
 
 
359 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.679719  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  24.41 
 
 
376 aa  52  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2485  hypothetical protein  25.57 
 
 
255 aa  50.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.410986  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1781  ABC transporter, inner membrane subunit  26.97 
 
 
365 aa  50.8  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  25.41 
 
 
376 aa  50.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  26.13 
 
 
281 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  26.32 
 
 
249 aa  51.2  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2615  ABC-2 type transporter  30.04 
 
 
267 aa  51.2  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.747872  hitchhiker  0.00151672 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  28.95 
 
 
369 aa  50.8  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35420  ABC-type multidrug transport system, permease component  29.45 
 
 
257 aa  51.2  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  26.7 
 
 
375 aa  50.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0633  ABC-2 type transporter  26.27 
 
 
259 aa  50.8  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  27.75 
 
 
373 aa  50.1  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  29.12 
 
 
376 aa  50.1  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2056  ABC-2 type transporter  28.33 
 
 
241 aa  50.1  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.794734  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  25.48 
 
 
377 aa  50.4  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1407  ABC-2 type transporter  31.49 
 
 
390 aa  50.4  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0722893 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1790  ABC-2 transporter component  27.39 
 
 
371 aa  50.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3115  ABC transporter, inner membrane subunit  28.64 
 
 
383 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0243  hypothetical protein  29.7 
 
 
251 aa  49.7  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.021198  normal  0.905832 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.27 
 
 
249 aa  49.7  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  26.74 
 
 
384 aa  50.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0176  hypothetical protein  26.98 
 
 
241 aa  49.7  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.67071  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0663  ABC-2 type transporter  29.44 
 
 
274 aa  49.7  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  29.02 
 
 
378 aa  49.7  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  25.86 
 
 
257 aa  49.3  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>