More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1670 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1670  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
632 aa  1256    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.83 
 
 
657 aa  348  2e-94  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.514383  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0255  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.13 
 
 
525 aa  300  6e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1231  histidine kinase  40.31 
 
 
376 aa  244  3.9999999999999997e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000541094 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.38 
 
 
1045 aa  228  2e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.628916  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1570  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.94 
 
 
383 aa  227  4e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2916  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.14 
 
 
691 aa  223  9.999999999999999e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1512  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  52.19 
 
 
572 aa  222  1.9999999999999999e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.578551  normal  0.8402 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1908  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.88 
 
 
529 aa  217  5e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 
873 aa  214  2.9999999999999995e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2889  histidine kinase  52.45 
 
 
549 aa  209  9e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1646  histidine kinase  47.69 
 
 
446 aa  209  2e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.6 
 
 
921 aa  209  2e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.627886  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1519  histidine kinase  49.07 
 
 
541 aa  206  1e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.781722  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2519  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.9 
 
 
590 aa  206  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0330  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.6 
 
 
758 aa  205  3e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1870  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  48.6 
 
 
346 aa  202  1.9999999999999998e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.181656  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0469  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.78 
 
 
378 aa  200  6e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.235953  normal  0.329223 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3657  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.13 
 
 
478 aa  200  7.999999999999999e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3488  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.22 
 
 
362 aa  198  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1511  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.13 
 
 
468 aa  196  1e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3311  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.23 
 
 
1300 aa  195  2e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.703453  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2813  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.39 
 
 
590 aa  196  2e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.218828  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2066  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.11 
 
 
370 aa  192  1e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321143  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3606  histidine kinase  43.46 
 
 
573 aa  192  2e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3658  histidine kinase  42.26 
 
 
483 aa  191  2.9999999999999997e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3302  histidine kinase  43.08 
 
 
573 aa  190  5e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0920  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.72 
 
 
655 aa  187  4e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.301008  decreased coverage  0.000022653 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0999  histidine kinase  44.21 
 
 
326 aa  185  2.0000000000000003e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2881  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.49 
 
 
570 aa  184  6e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1749  histidine kinase  45.41 
 
 
331 aa  180  8e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0209  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.4 
 
 
546 aa  178  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1263  histidine kinase  50.75 
 
 
392 aa  177  5e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3297  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 
700 aa  177  5e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2204  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.59 
 
 
475 aa  176  8e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2042  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.4 
 
 
477 aa  176  9.999999999999999e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.562637  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0718  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.66 
 
 
649 aa  176  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.746522 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1026  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.31 
 
 
599 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0934785  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.96 
 
 
875 aa  174  3.9999999999999995e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2266  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.63 
 
 
379 aa  174  5.999999999999999e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.205435  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1762  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.26 
 
 
830 aa  171  4e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2509  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.84 
 
 
627 aa  170  6e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3216  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.7 
 
 
568 aa  169  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0600543  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2409  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.86 
 
 
759 aa  167  4e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.456195  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0313  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.43 
 
 
580 aa  167  4e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1809  histidine kinase  40.96 
 
 
373 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1771  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.55 
 
 
669 aa  162  1e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2684  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.47 
 
 
516 aa  162  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.989107 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2911  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 
642 aa  162  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0502  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.09 
 
 
619 aa  156  9e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00154856  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1519  histidine kinase  34.41 
 
 
505 aa  156  1e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0112832 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.47 
 
 
603 aa  155  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.7 
 
 
671 aa  155  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.202041  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2699  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.08 
 
 
446 aa  154  4e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.112792  normal  0.0892885 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0184  histidine kinase  40.79 
 
 
511 aa  153  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.31584  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3337  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.78 
 
 
685 aa  150  9e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0168  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.93 
 
 
352 aa  145  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2229  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.78 
 
 
659 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.167752  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 
778 aa  141  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.260825 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3270  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.73 
 
 
796 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.498059 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3188  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 
810 aa  139  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0496  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.06 
 
 
896 aa  137  5e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  27.01 
 
 
1427 aa  137  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.46 
 
 
669 aa  134  5e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.142173  normal  0.0665505 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.89 
 
 
1415 aa  134  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2827  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 
1064 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4276  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.13 
 
 
779 aa  132  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2126  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.73 
 
 
559 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.386093  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.43 
 
 
1426 aa  131  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0501  histidine kinase  36.11 
 
 
945 aa  127  5e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0931305  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2596  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.64 
 
 
358 aa  126  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.834028  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2062  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.26 
 
 
951 aa  125  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.275424  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1083  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 
973 aa  124  6e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1591  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.76 
 
 
666 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0120  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 
1568 aa  119  1.9999999999999998e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 
1383 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1802  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.19 
 
 
456 aa  118  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.56 
 
 
1359 aa  118  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3106  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.36 
 
 
905 aa  117  3.9999999999999997e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1537  putative PAS/PAC sensor protein  42.68 
 
 
636 aa  118  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4616  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.08 
 
 
701 aa  114  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4345  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  40.14 
 
 
890 aa  114  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5665  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1080  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.34 
 
 
1128 aa  114  7.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1043  sensory box histidine kinase  47.69 
 
 
767 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.382651  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3535  putative PAS/PAC sensor protein  37.63 
 
 
684 aa  111  5e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.31 
 
 
1965 aa  110  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0906  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 
1195 aa  110  7.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2922  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.23 
 
 
415 aa  109  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2128  putative PAS/PAC sensor protein  41.98 
 
 
1059 aa  109  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1974  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.61 
 
 
642 aa  108  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0659  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 
525 aa  107  8e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0919  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.84 
 
 
404 aa  106  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000529164 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0943  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.66 
 
 
1384 aa  106  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.292303  normal  0.468485 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 
525 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0043  putative PAS/PAC sensor protein  47.11 
 
 
1216 aa  105  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2025  putative PAS/PAC sensor protein  40.12 
 
 
930 aa  105  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.76545  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0402  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.91 
 
 
469 aa  104  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00245745  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5242  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  25.32 
 
 
1682 aa  104  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59114  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2209  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.55 
 
 
399 aa  104  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0128  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 
780 aa  103  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000607213  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>