More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1268 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1268  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 281 aa  551  1e-156  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.635974 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1426  Polyprenyl synthetase  76.07 
 
 		 280 aa  406  1.0000000000000001e-112  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0241  Polyprenyl synthetase  73.21 
 
 		 280 aa  395  1e-109  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.362047 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1385  Polyprenyl synthetase  74.64 
 
 		 280 aa  367  1e-100  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3335  Polyprenyl synthetase  70 
 
 		 280 aa  354  8.999999999999999e-97  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  37.5 
 
 		 300 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  37.16 
 
 		 300 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  36.15 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  35.47 
 
 		 299 aa  155  6e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  35.79 
 
 		 299 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  35.45 
 
 		 299 aa  152  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  35.66 
 
 		 327 aa  149  4e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  38.28 
 
 		 299 aa  149  5e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  35.93 
 
 		 300 aa  148  8e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  30.8 
 
 		 321 aa  146  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  37.5 
 
 		 334 aa  145  5e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  35 
 
 		 295 aa  144  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  34.29 
 
 		 306 aa  144  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  32.43 
 
 		 307 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  32.63 
 
 		 322 aa  143  3e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  32.96 
 
 		 317 aa  142  4e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  31.21 
 
 		 294 aa  142  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  31.42 
 
 		 294 aa  142  5e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  35.93 
 
 		 306 aa  142  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  37.14 
 
 		 334 aa  142  6e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3068  Polyprenyl synthetase  37.96 
 
 		 325 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1456  farnesyl-diphosphate synthase  36.52 
 
 		 299 aa  141  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292762  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  35.55 
 
 		 294 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  34.23 
 
 		 295 aa  140  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  30.82 
 
 		 327 aa  139  3.9999999999999997e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  32.96 
 
 		 316 aa  139  4.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2823  octaprenyl-diphosphate synthase  36.7 
 
 		 322 aa  139  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000462084  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  36 
 
 		 332 aa  139  6e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  37.06 
 
 		 317 aa  139  7e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  32.45 
 
 		 295 aa  139  7e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2632  farnesyl-diphosphate synthase  33.56 
 
 		 297 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  30.03 
 
 		 327 aa  138  7.999999999999999e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0739  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  37.29 
 
 		 296 aa  138  1e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.396283  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1016  Polyprenyl synthetase  38.14 
 
 		 332 aa  137  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00162211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2658  Polyprenyl synthetase  36.57 
 
 		 325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0590185  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1765  geranyltranstransferase  34.11 
 
 		 297 aa  136  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316781  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  36.36 
 
 		 317 aa  136  4e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  36.57 
 
 		 322 aa  136  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4513  octaprenyl-diphosphate synthase  35.82 
 
 		 327 aa  135  7.000000000000001e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  30.67 
 
 		 297 aa  135  8e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0955  Polyprenyl synthetase  36.61 
 
 		 298 aa  135  9e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1707  polyprenyl synthetase  39.67 
 
 		 303 aa  135  9e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.219541  normal  0.533625 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  34.91 
 
 		 297 aa  135  9e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5487  polyprenyl synthetase  37.11 
 
 		 359 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.057481  normal  0.26211 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1935  farnesyl-diphosphate synthase  33.77 
 
 		 297 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  33.56 
 
 		 294 aa  135  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  36.87 
 
 		 317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  33.44 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  34.34 
 
 		 296 aa  133  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0360  octaprenyl-diphosphate synthase  35.32 
 
 		 323 aa  133  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00089716  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3361  octaprenyl diphosphate synthase  34.55 
 
 		 323 aa  133  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000777945  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  29.53 
 
 		 312 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1926  farnesyl-diphosphate synthase  35.59 
 
 		 296 aa  132  5e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2176  polyprenyl synthetase  33.44 
 
 		 297 aa  132  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000107352  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0416  Polyprenyl synthetase  35.29 
 
 		 297 aa  132  5e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0244  octaprenyl-diphosphate synthase  35.32 
 
 		 326 aa  132  5e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000222684  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  32.68 
 
 		 331 aa  132  5e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03732  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase  34.33 
 
 		 324 aa  132  6e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100816  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1267  farnesyltranstransferase  35.57 
 
 		 327 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000414362  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1446  isoprenyl synthetase  34.25 
 
 		 331 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0472  octaprenyl diphosphate synthase  35.19 
 
 		 323 aa  131  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000437093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  27.15 
 
 		 326 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  30.64 
 
 		 309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  33.66 
 
 		 300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3973  octaprenyl diphosphate synthase  34.4 
 
 		 323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  30.64 
 
 		 309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  33.73 
 
 		 338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  32.64 
 
 		 322 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2852  octaprenyl-diphosphate synthase  33.83 
 
 		 348 aa  130  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000355591  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3613  octaprenyl diphosphate synthase  34.4 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000738852  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0383  Polyprenyl synthetase  30.89 
 
 		 337 aa  130  3e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.955565  normal  0.0650374 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3481  octaprenyl diphosphate synthase  34.09 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3221  farnesyl-diphosphate synthase  31.99 
 
 		 295 aa  130  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3758  octaprenyl diphosphate synthase  34.4 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000253501  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0680  trans-hexaprenyltranstransferase  35.02 
 
 		 322 aa  130  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000360106  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  37 
 
 		 320 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3107  polyprenyl synthetase  37.44 
 
 		 325 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.339313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2027  trans-hexaprenyltranstransferase  36.67 
 
 		 331 aa  129  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3450  Polyprenyl synthetase  38.31 
 
 		 330 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.024256  hitchhiker  0.00543361 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2048  Polyprenyl synthetase  31.16 
 
 		 348 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.225827  normal  0.179552 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  31.85 
 
 		 297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3380  octaprenyl diphosphate synthase  34.7 
 
 		 323 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3954399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1570  Polyprenyl synthetase  37.28 
 
 		 305 aa  129  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0506  octylprenyl-diphosphate synthase  38.31 
 
 		 330 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.282953  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2928  trans-hexaprenyltranstransferase  33.33 
 
 		 323 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000191483  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1668  geranyltranstransferase (farnesyldiphosphate synthase)  33.99 
 
 		 296 aa  129  6e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000016201  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  32.64 
 
 		 322 aa  129  6e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1037  farnesyl-diphosphate synthase  33.67 
 
 		 311 aa  129  6e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.101791 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2959  trans-hexaprenyltranstransferase  37.81 
 
 		 325 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0367555  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0524  octaprenyl-diphosphate synthase  32.84 
 
 		 331 aa  129  7.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03052  octaprenyl diphosphate synthase  34.7 
 
 		 323 aa  128  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0077638  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0520  Polyprenyl synthetase  34.7 
 
 		 323 aa  128  8.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000996752  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4509  octaprenyl diphosphate synthase  34.7 
 
 		 323 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000159787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3673  octaprenyl diphosphate synthase  34.7 
 
 		 323 aa  128  8.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000447788  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0513  octaprenyl diphosphate synthase  34.7 
 
 		 323 aa  128  8.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000265793  normal  0.0203333 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>