56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1203 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_2031  helicase c2  66.14 
 
 		 640 aa  823    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0201  helicase c2  69 
 
 		 614 aa  831    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1203  helicase c2  100 
 
 		 583 aa  1193    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.281396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1013  helicase c2  74.39 
 
 		 588 aa  823    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2213  helicase c2  69.24 
 
 		 644 aa  781    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.23708 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0888  helicase c2  25.58 
 
 		 466 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0015  helicase c2  26.09 
 
 		 655 aa  93.2  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0747117  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1524  helicase c2  24.71 
 
 		 657 aa  91.7  3e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00208913 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0007  helicase c2  23.85 
 
 		 653 aa  89  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000554419 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  26.48 
 
 		 807 aa  75.1  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  25.86 
 
 		 798 aa  66.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  24.75 
 
 		 798 aa  65.1  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2627  DEAD_2 domain protein  30.88 
 
 		 723 aa  64.3  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  23.82 
 
 		 574 aa  63.2  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  24.3 
 
 		 774 aa  61.6  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  25.57 
 
 		 797 aa  61.6  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  21.79 
 
 		 619 aa  60.8  0.00000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0015  DEAD_2 domain-containing protein  23 
 
 		 750 aa  57.4  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.338089  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  20.49 
 
 		 781 aa  57.4  0.0000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4111  helicase c2  25.18 
 
 		 766 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620969 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  23.43 
 
 		 798 aa  57  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0984  DEAD_2 domain-containing protein  27.54 
 
 		 773 aa  56.6  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1361  helicase c2  21.44 
 
 		 801 aa  55.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  20.67 
 
 		 781 aa  54.7  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01557  ATP-dependent DNA helicase DinG  24.35 
 
 		 691 aa  54.3  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4835  helicase c2  27.73 
 
 		 874 aa  54.3  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0589586 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  25.19 
 
 		 779 aa  53.9  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40695  predicted protein  32.35 
 
 		 749 aa  53.9  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000000149445  normal  0.993011 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1416  DEAD_2 domain protein  27.24 
 
 		 722 aa  53.9  0.000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0909  hypothetical protein  22.98 
 
 		 773 aa  53.5  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.205853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0816  helicase c2  27.07 
 
 		 787 aa  53.1  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.524115 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1918  helicase c2  28.76 
 
 		 790 aa  53.1  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.885633  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  20.58 
 
 		 775 aa  52  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0996428 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1536  DEAD_2 domain protein  22.78 
 
 		 537 aa  51.6  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.849616  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3423  hypothetical protein  21.54 
 
 		 758 aa  52  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02825  ATP-dependent DNA helicase DinG  22.01 
 
 		 710 aa  51.6  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  22.84 
 
 		 753 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5309  DEAD_2 domain-containing protein  23.75 
 
 		 756 aa  51.2  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173286  hitchhiker  0.0033003 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3224  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.99 
 
 		 927 aa  50.8  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00101103  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0823  DEAD_2 domain protein  29.44 
 
 		 739 aa  50.4  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003963  ATP-dependent helicase DinG/Rad3  23.1 
 
 		 691 aa  50.4  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  21.18 
 
 		 753 aa  50.4  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32894  predicted protein  29.41 
 
 		 1067 aa  49.7  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0780237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2510  helicase c2  21.4 
 
 		 788 aa  48.9  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268076 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  27.68 
 
 		 654 aa  48.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0350  ATP-dependent DNA helicase DinG  25.48 
 
 		 711 aa  48.1  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00468076  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  22.79 
 
 		 712 aa  48.1  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3766  helicase c2  28.24 
 
 		 806 aa  48.1  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1467  helicase c2  22.61 
 
 		 690 aa  47.4  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0659778  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2850  DEAD_2 domain-containing protein  25 
 
 		 753 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  25 
 
 		 762 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10282  predicted protein  26.56 
 
 		 614 aa  46.2  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0466  helicase c2  26.85 
 
 		 669 aa  46.2  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3086  ATP-dependent DNA helicase DinG  24.08 
 
 		 692 aa  44.3  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.175143  hitchhiker  0.0000411022 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  28.71 
 
 		 669 aa  44.3  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  22.8 
 
 		 785 aa  44.3  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>