More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0335 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0335  BCCT transporter  100 
 
 		 534 aa  1056    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.568613  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3860  BCCT family transporter  58.88 
 
 		 519 aa  621  1e-176  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.99321  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0815  BCCT transporter  54.98 
 
 		 530 aa  585  1e-166  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.820785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2126  BCCT transporter  53.19 
 
 		 533 aa  580  1e-164  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00109884  hitchhiker  0.00218719 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1238  BCCT transporter  52.2 
 
 		 554 aa  575  1.0000000000000001e-163  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.332872 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000659  putative glycine betaine transporter  56.82 
 
 		 528 aa  568  1e-161  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06536  choline/carnitine/betaine transporter  55.6 
 
 		 539 aa  564  1.0000000000000001e-159  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0875  glycine betaine transporter OpuD  54.98 
 
 		 524 aa  561  1.0000000000000001e-159  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0576373  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3674  BCCT transporter  52.26 
 
 		 549 aa  560  1e-158  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1813  BCCT transporter  54.79 
 
 		 561 aa  560  1e-158  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.566263 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5577  BCCT family osmoprotectant transporter  51.51 
 
 		 522 aa  542  1e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5237  BCCT transporter  51.91 
 
 		 522 aa  542  1e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0579  choline-glycine betaine transporter  55.9 
 
 		 519 aa  543  1e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5298  BCCT family osmoprotectant transporter  51.51 
 
 		 522 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5140  BCCT family osmoprotectant transporter  51.51 
 
 		 522 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5625  osmoprotectant transporter, BCCT family  51.51 
 
 		 522 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5694  BCCT family osmoprotectant transporter  51.51 
 
 		 522 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5539  osmoprotectant transporter, BCCT family  51.51 
 
 		 522 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5125  BCCT family osmoprotectant transporter  51.31 
 
 		 522 aa  536  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3383  BCCT transporter  58.52 
 
 		 514 aa  537  1e-151  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.198067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5380  osmoprotectant transporter, BCCT family  52.52 
 
 		 522 aa  533  1e-150  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.274616  normal  0.0982886 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5569  osmoprotectant transporter, BCCT family  52.31 
 
 		 522 aa  531  1e-149  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2888  BCCT transporter  51.15 
 
 		 555 aa  490  1e-137  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.696836  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3060  BCCT transporter  48.85 
 
 		 516 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.892998  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2692  BCCT family transporter  48.65 
 
 		 516 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.315858 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2887  BCCT transporter  50.39 
 
 		 529 aa  459  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2920  BCCT transporter  49.7 
 
 		 518 aa  454  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00190717  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2467  BCCT transporter  48.22 
 
 		 537 aa  423  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16031  hypothetical protein  36.14 
 
 		 519 aa  359  6e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.034717  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0251  BCCT family glycine betaine transporter  40.9 
 
 		 516 aa  338  9.999999999999999e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0223  BCCT family glycine betaine transporter  42.51 
 
 		 518 aa  329  9e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05503  choline/carnitine/betaine transporter  50.8 
 
 		 341 aa  288  1e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1219  choline/carnitine/betaine transporter  34.38 
 
 		 503 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1282  transporter, BCCT family  33.06 
 
 		 534 aa  252  1e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2215  choline/carnitine/betaine transporter  30.71 
 
 		 523 aa  251  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0845  choline/carnitine/betaine transport  32.39 
 
 		 551 aa  248  2e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.626779  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0614  glycine betaine transporter  33.87 
 
 		 516 aa  247  3e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000015754  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0465  glycine betaine transporter  34.74 
 
 		 516 aa  248  3e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00194055  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0465  glycine betaine transporter  34.74 
 
 		 516 aa  248  3e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000010169  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0610  glycine betaine transporter  34.74 
 
 		 516 aa  248  3e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0022  choline/carnitine/betaine transporter  33.41 
 
 		 580 aa  247  3e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.499144 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0608  choline/carnitine/betaine transporter  31.76 
 
 		 490 aa  247  4e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0522  glycine betaine transporter  34.53 
 
 		 516 aa  246  6e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0554  glycine betaine transporter  34.53 
 
 		 516 aa  246  6e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0683  glycine betaine transporter  34.32 
 
 		 516 aa  246  6e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000113352  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0590  glycine betaine transporter  34.32 
 
 		 516 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000851893  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4749  glycine betaine transporter  34.11 
 
 		 516 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0790865 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4403  choline/carnitine/betaine transporter  32.51 
 
 		 659 aa  244  3e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1610  hypothetical protein  32.97 
 
 		 646 aa  243  3.9999999999999997e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00096761  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4866  choline/carnitine/betaine transporter  32.51 
 
 		 659 aa  243  9e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3426  choline/carnitine/betaine transporter  33.53 
 
 		 531 aa  242  1e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0758867  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4042  choline/carnitine/betaine transporter  32.41 
 
 		 526 aa  241  2e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0046  glycine betaine transporter  33.68 
 
 		 532 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.275522  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0826  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  33.62 
 
 		 550 aa  240  5.999999999999999e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1904  choline/carnitine/betaine transporter  31.68 
 
 		 678 aa  239  8e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.674112 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2648  choline/carnitine/betaine transporter  32.72 
 
 		 534 aa  239  1e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0485  choline/carnitine/betaine transporter  32.78 
 
 		 516 aa  238  2e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000502789  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69850  putative choline transporter  33.2 
 
 		 661 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0600  choline/carnitine/betaine transporter  31.35 
 
 		 584 aa  237  3e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000857259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0160  choline/carnitine/betaine transporter  31.98 
 
 		 497 aa  237  3e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1736  choline/carnitine/betaine transporter  32 
 
 		 506 aa  238  3e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00814809  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22610  choline/carnitine/betaine transport  30.88 
 
 		 663 aa  236  5.0000000000000005e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.524203  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2475  choline/carnitine/betaine transporter  31.36 
 
 		 538 aa  237  5.0000000000000005e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.172611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0875  choline/carnitine/betaine transport  32.37 
 
 		 681 aa  236  6e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0293  choline/carnitine/betaine transporter  33.26 
 
 		 637 aa  236  7e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0308209  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2376  choline/carnitine/betaine transporter  32.53 
 
 		 508 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1888  choline/carnitine/betaine transporter  33.48 
 
 		 606 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.541906  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0190  BCCT transporter  31.62 
 
 		 525 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3576  choline/carnitine/betaine transporter  31.19 
 
 		 567 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.440158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01010  choline/carnitine/betaine transport  32.78 
 
 		 573 aa  235  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.883034  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3957  choline/carnitine/betaine transporter family protein  32.89 
 
 		 657 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0148602  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0877  choline/carnitine/betaine transporter  33.99 
 
 		 542 aa  234  3e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.359976  hitchhiker  0.00000108541 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18950  choline/carnitine/betaine transport  32.45 
 
 		 606 aa  234  3e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.318822  normal  0.131435 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4324  choline/carnitine/betaine transporter  31.49 
 
 		 494 aa  234  4.0000000000000004e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2255  choline/carnitine/betaine transporter  30.48 
 
 		 520 aa  233  7.000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2216  choline/carnitine/betaine transporter  30.48 
 
 		 520 aa  233  7.000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01813  Choline-glycine betaine transporter  34.45 
 
 		 656 aa  233  9e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000594064  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2645  choline transport protein BetT  31.92 
 
 		 684 aa  232  1e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00290709  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6064  putative choline transporter  33 
 
 		 661 aa  232  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003606  High-affinity choline uptake protein BetT  34.31 
 
 		 553 aa  231  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3532  choline/carnitine/betaine transporter  31.39 
 
 		 556 aa  231  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2098  choline/carnitine/betaine transporter  33.97 
 
 		 498 aa  231  3e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3305  choline/carnitine/betaine transport  29.37 
 
 		 545 aa  230  6e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0654  choline/carnitine/betaine transport  29.6 
 
 		 544 aa  230  6e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1003  choline/carnitine/betaine transporter  28.98 
 
 		 553 aa  229  7e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.399191 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0835  choline/carnitine/betaine transporter  33.18 
 
 		 574 aa  229  7e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.475223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0079  choline/carnitine/betaine transporter  28.63 
 
 		 558 aa  228  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5310  choline/carnitine/betaine transporter  34.62 
 
 		 698 aa  227  4e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.910175  normal  0.618905 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000396  choline-glycine betaine transporter  30.83 
 
 		 593 aa  227  5.0000000000000005e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5089  glycine betaine transporter  33.11 
 
 		 505 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5479  glycine betaine transporter  33.11 
 
 		 505 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.231091  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2472  choline/carnitine/betaine transporter  34.44 
 
 		 667 aa  227  5.0000000000000005e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5358  glycine betaine transporter  32.89 
 
 		 505 aa  226  6e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0023  choline/carnitine/betaine transporter  32.83 
 
 		 539 aa  226  7e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.16107 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4919  glycine betaine transporter  33.11 
 
 		 505 aa  226  8e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4934  glycine betaine transporter  33.11 
 
 		 505 aa  226  8e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5329  glycine betaine transporter  33.11 
 
 		 505 aa  226  8e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.52581e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5411  glycine betaine transporter  33.11 
 
 		 505 aa  226  8e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5593  glycine betaine transporter  33.11 
 
 		 504 aa  225  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000183656 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0223  choline transport protein BetT  32.78 
 
 		 686 aa  226  1e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>