80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3995 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3995  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 658 aa  1339    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.480395  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.04 
 
 		 991 aa  68.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  24.47 
 
 		 1266 aa  68.2  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  22.94 
 
 		 1060 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  24.91 
 
 		 782 aa  64.3  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  22.73 
 
 		 957 aa  62  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1249  putative transcriptional regulator  42.03 
 
 		 189 aa  61.2  0.00000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.629566  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  45.45 
 
 		 433 aa  59.3  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3386  NB-ARC domain-containing protein  25.56 
 
 		 834 aa  59.3  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.167354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  26.02 
 
 		 985 aa  58.9  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  24.53 
 
 		 828 aa  58.9  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  51.67 
 
 		 448 aa  58.9  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  24 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  21 
 
 		 1238 aa  57.4  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  41.79 
 
 		 455 aa  57.4  0.0000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.5 
 
 		 1162 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  24 
 
 		 1550 aa  56.6  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3130  TPR repeat-containing protein  28.78 
 
 		 408 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180384 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  35.09 
 
 		 456 aa  55.5  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3729  TPR-related region  25.76 
 
 		 340 aa  55.8  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0045227  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0697  response regulator receiver domain-containing protein  45.16 
 
 		 852 aa  54.7  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.43 
 
 		 636 aa  54.3  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  24.83 
 
 		 1162 aa  53.9  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  22.5 
 
 		 809 aa  53.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  46.67 
 
 		 448 aa  52.4  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  50.82 
 
 		 468 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  28.3 
 
 		 775 aa  53.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  49.18 
 
 		 479 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3067  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.13 
 
 		 374 aa  52.4  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2406  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.79 
 
 		 852 aa  51.6  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  normal  0.385932 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2417  TPR domain-containing protein  25.83 
 
 		 716 aa  52  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.614244  normal  0.451295 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  29.13 
 
 		 1212 aa  51.6  0.00005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  26.47 
 
 		 1404 aa  51.2  0.00006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0229  tetratricopeptide TPR_3  22.58 
 
 		 689 aa  51.2  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  44.26 
 
 		 459 aa  50.8  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  24.11 
 
 		 1093 aa  50.4  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0853  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 502 aa  50.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 		 1526 aa  50.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  23.11 
 
 		 1298 aa  49.3  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0894  TPR-related region  21.91 
 
 		 364 aa  49.3  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179778 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  26 
 
 		 923 aa  49.3  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1441  hypothetical protein  34.62 
 
 		 367 aa  49.3  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2039  Sigma 54 interacting domain protein  38.75 
 
 		 840 aa  48.9  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6020  multi-sensor signal transduction multi-kinase  22.7 
 
 		 1666 aa  48.9  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  23.21 
 
 		 2145 aa  48.9  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  22.03 
 
 		 725 aa  48.5  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1382  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  24.29 
 
 		 868 aa  48.5  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0126588  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.7 
 
 		 1279 aa  48.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3544  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  27.78 
 
 		 945 aa  47.8  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0810782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6439  histidine kinase  22.78 
 
 		 657 aa  47.4  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  24.86 
 
 		 908 aa  47.4  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  27.83 
 
 		 1025 aa  47.4  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  26 
 
 		 1048 aa  47.4  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0414  hypothetical protein  21.67 
 
 		 490 aa  46.6  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0243225  normal  0.732046 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1290  TPR repeat-containing protein  23.84 
 
 		 343 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  26.34 
 
 		 888 aa  47  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1182  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.91 
 
 		 374 aa  46.6  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2835  TPR repeat-containing protein  25.85 
 
 		 287 aa  46.6  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.356723  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0980  hypothetical protein  35.38 
 
 		 367 aa  46.2  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0812833  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3715  histidine kinase  22.7 
 
 		 695 aa  46.2  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223291 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34600  putative transcriptional regulator  26.73 
 
 		 896 aa  46.6  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.240739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1740  putative transcriptional regulator  33.82 
 
 		 230 aa  46.2  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.952214  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1770  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.68 
 
 		 370 aa  45.4  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.385293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  24.14 
 
 		 1009 aa  45.4  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  19.03 
 
 		 1313 aa  45.8  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  24.85 
 
 		 1088 aa  45.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4309  hypothetical protein  30.43 
 
 		 645 aa  45.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6437  NB-ARC domain protein  30 
 
 		 715 aa  45.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2616  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.71 
 
 		 368 aa  44.7  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1149  TPR repeat-containing protein  25.56 
 
 		 613 aa  45.1  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.204907  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0305  Tetratricopeptide domain protein  25.79 
 
 		 603 aa  44.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0415  histidine kinase  21.74 
 
 		 600 aa  44.3  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0044  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  27.49 
 
 		 1360 aa  44.3  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0143745  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0148  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.32 
 
 		 560 aa  44.3  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.189493 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1095  filamentation induced by cAMP protein (Fic) family protein  38.1 
 
 		 374 aa  43.9  0.009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.298399  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  25.12 
 
 		 850 aa  43.9  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0591  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.07 
 
 		 373 aa  43.9  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6624  signal transduction histidine kinase, LytS  21.09 
 
 		 650 aa  43.9  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.11241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0901  TPR repeat-containing protein  25.56 
 
 		 613 aa  43.9  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0436049 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  23.47 
 
 		 981 aa  43.9  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>