149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1226 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1226  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 337 aa  678    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1756  polysaccharide deacetylase  41.07 
 
 		 351 aa  237  3e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1658  polysaccharide deacetylase family protein  26.44 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0732576  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1287  polysaccharide deacetylase  24.84 
 
 		 366 aa  97.4  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.374689  normal  0.442268 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0570  polysaccharide deacetylase  26.06 
 
 		 383 aa  93.2  6e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0342536 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2204  polysaccharide deacetylase  26.97 
 
 		 402 aa  82  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1402  xylanase/chitin deacetylase  32.72 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0167631  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3300  polysaccharide deacetylase  23.95 
 
 		 327 aa  73.2  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.821044  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0156  polysaccharide deacetylase  31.61 
 
 		 276 aa  70.1  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4976  deacetylase  34.69 
 
 		 373 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.765353  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2241  polysaccharide deacetylase  33.61 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0722  polysaccharide deacetylase  28.24 
 
 		 284 aa  67.4  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0811  Shf protein  28.24 
 
 		 284 aa  67.4  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3402  hypothetical protein  22.55 
 
 		 393 aa  66.2  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.377712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0476  NhaD  30.51 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.336062  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2375  polysaccharide deacetylase  24.28 
 
 		 344 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0290  polysaccharide deacetylase  22.19 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2837  polysaccharide deacetylase  28.28 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0138  polysaccharide deacetylase domain protein  30.56 
 
 		 409 aa  63.2  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00129  predicted polysaccharide deacetylase lipoprotein  30 
 
 		 409 aa  62  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.530219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3472  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 409 aa  62  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0678  polysaccharide deacetylase  28.95 
 
 		 415 aa  62  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.945313  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0134  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  30 
 
 		 409 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3529  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 409 aa  62  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0140  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  30.56 
 
 		 409 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00128  hypothetical protein  30 
 
 		 409 aa  62  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411127  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0204  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  28.88 
 
 		 409 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0213  polysaccharide deacetylase  28.88 
 
 		 407 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.268611  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3056  polysaccharide deacetylase  32.73 
 
 		 401 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3994  polysaccharide deacetylase  30.34 
 
 		 426 aa  61.2  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2104  polysaccharide deacetylase  26.95 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04327  biofilm PGA synthesis lipoprotein PgaB  23.15 
 
 		 624 aa  61.6  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.215859  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0196  polysaccharide deacetylase domain protein  28.88 
 
 		 409 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0199  polysaccharide deacetylase domain protein  28.88 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.37766  normal  0.364365 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2153  xylanase/chitin deacetylase  26.24 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0132  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  29.44 
 
 		 409 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0195  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  28.88 
 
 		 407 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2717  polysaccharide deacetylase  22.44 
 
 		 628 aa  59.7  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  40.86 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5301  polysaccharide deacetylase  33.72 
 
 		 272 aa  58.9  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0260  polysaccharide deacetylase family protein  30.82 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2013  polysaccharide deacetylase  25.32 
 
 		 386 aa  58.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0046  polysaccharide deacetylase family protein  30.82 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0060  polysaccharide deacetylase family protein  30.82 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4855  polysaccharide deacetylase family protein  30.82 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  31.15 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0273  polysaccharide deacetylase  38.18 
 
 		 627 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  28.74 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  33.7 
 
 		 373 aa  57.4  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2459  polysaccharide deacetylase  36.9 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0185568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  28.48 
 
 		 645 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0111  polysaccharide deacetylase family protein  27.66 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  39.81 
 
 		 282 aa  55.8  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0475  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing] (glutamineamidotransferase; GMP synthetase)  31.51 
 
 		 265 aa  55.5  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  24.28 
 
 		 273 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.568999  normal  0.212352 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3765  polysaccharide deacetylase  24.21 
 
 		 712 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0603  polysaccharide deacetylase  23.36 
 
 		 371 aa  55.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  36.27 
 
 		 306 aa  55.1  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  36.27 
 
 		 306 aa  55.1  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3346  polysaccharide deacetylase family protein  31.03 
 
 		 417 aa  54.7  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000257148  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1014  polysaccharide deacetylase family protein  31.03 
 
 		 417 aa  54.7  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.763389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3475  polysaccharide deacetylase  31.03 
 
 		 437 aa  54.7  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4842  polysaccharide deacetylase  24.21 
 
 		 712 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  24.56 
 
 		 273 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.059566 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0332  polysaccharide deacetylase family protein  26.16 
 
 		 273 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.529836 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0187  hypothetical protein  26.94 
 
 		 314 aa  54.7  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0333  polysaccharide deacetylase family protein  25.43 
 
 		 273 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0412  polysaccharide deacetylase  21.71 
 
 		 324 aa  53.5  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05320  Polysaccharide deacetylase  36.49 
 
 		 351 aa  52.8  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.354337  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0455  polysaccharide deacetylase  23.49 
 
 		 339 aa  53.1  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0133488 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0895  polysaccharide deacetylase  35.45 
 
 		 615 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0313662  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0869  polysaccharide deacetylase  35.45 
 
 		 615 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  27.49 
 
 		 336 aa  52.8  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0287  putative hemin storage signal peptide protein  22.53 
 
 		 724 aa  52  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.111967  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1640  polysaccharide deacetylase  23.01 
 
 		 337 aa  52.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0677  polysaccharide deacetylase  29.03 
 
 		 337 aa  52  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0287  polysaccharide deacetylase  37.11 
 
 		 319 aa  52.4  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.316315  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0110  polysaccharide deacetylase  23.69 
 
 		 316 aa  52  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  35.42 
 
 		 279 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  44.64 
 
 		 255 aa  51.6  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1858  polysaccharide deacetylase  34.23 
 
 		 347 aa  50.8  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000052436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2130  outer membrane N-deacetylase  34.07 
 
 		 673 aa  50.8  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2142  outer membrane N-deacetylase  34.07 
 
 		 673 aa  50.8  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0474034 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2240  outer membrane N-deacetylase  34.07 
 
 		 673 aa  50.8  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  29.83 
 
 		 234 aa  51.2  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1729  polysaccharide deacetylase  24.43 
 
 		 316 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2336  polysaccharide deacetylase  32.26 
 
 		 339 aa  50.1  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2105  polysaccharide deacetylase  41.82 
 
 		 296 aa  50.1  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0828766  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  45.45 
 
 		 319 aa  49.7  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1105  polysaccharide deacetylase  34.72 
 
 		 270 aa  49.3  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3105  polysaccharide deacetylase  38.37 
 
 		 336 aa  49.7  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000266277  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0301  polysaccharide deacetylase  35.37 
 
 		 353 aa  49.3  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351436  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2127  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 256 aa  49.3  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  33.64 
 
 		 271 aa  48.5  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3306  polysaccharide deacetylase  22.73 
 
 		 333 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.582105 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0883  polysaccharide deacetylase  25.31 
 
 		 298 aa  48.5  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000351632  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0504  hypothetical protein  39.77 
 
 		 277 aa  48.5  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  31.45 
 
 		 322 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3249  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 266 aa  48.5  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  40 
 
 		 224 aa  48.1  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>