More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4597 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4597  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 727 aa  1397    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0740  major facilitator superfamily MFS_1  50.08 
 
 		 725 aa  522  1e-146  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  39.58 
 
 		 688 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  40.18 
 
 		 686 aa  415  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  39.35 
 
 		 688 aa  416  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  41.41 
 
 		 730 aa  400  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0308  dTMP kinase  41.3 
 
 		 709 aa  391  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.233817 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  39.68 
 
 		 686 aa  370  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  37.15 
 
 		 901 aa  370  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  39.77 
 
 		 662 aa  340  5e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  35.56 
 
 		 707 aa  333  7.000000000000001e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  36.04 
 
 		 705 aa  304  4.0000000000000003e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  35.55 
 
 		 703 aa  300  7e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4954  thymidylate kinase  36.51 
 
 		 707 aa  270  7e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0293  major facilitator superfamily MFS_1  32.44 
 
 		 710 aa  254  3e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.189593  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35790  thymidylate kinase  30.71 
 
 		 642 aa  215  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  33.98 
 
 		 671 aa  200  6e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  40.1 
 
 		 213 aa  109  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  36.27 
 
 		 232 aa  103  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  37.67 
 
 		 224 aa  101  6e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  38.12 
 
 		 210 aa  97.8  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  37.62 
 
 		 210 aa  97.4  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  38.58 
 
 		 206 aa  97.4  9e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0386  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 222 aa  97.4  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203543  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  36.14 
 
 		 234 aa  97.1  1e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  35.68 
 
 		 221 aa  97.1  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  36.45 
 
 		 210 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  35.41 
 
 		 243 aa  96.3  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  36.45 
 
 		 210 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03690  thymidylate kinase  38.99 
 
 		 219 aa  95.5  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0193896  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  37.09 
 
 		 207 aa  95.5  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  38.12 
 
 		 210 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  34.5 
 
 		 221 aa  94.7  5e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  35.64 
 
 		 210 aa  94.7  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 210 aa  93.2  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  34.8 
 
 		 226 aa  93.2  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  36.69 
 
 		 281 aa  90.1  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  36.45 
 
 		 210 aa  89  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  36.36 
 
 		 207 aa  88.2  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  35.96 
 
 		 210 aa  87.4  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  39.22 
 
 		 225 aa  87.4  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  33.62 
 
 		 215 aa  85.5  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  36.63 
 
 		 211 aa  85.1  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  34.3 
 
 		 215 aa  85.1  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  34.44 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16190  thymidylate kinase  32.28 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000139363 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0985  hypothetical protein  25.7 
 
 		 460 aa  82.4  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.309761  normal  0.0823053 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 213 aa  82.8  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  31.47 
 
 		 205 aa  82.4  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  35.53 
 
 		 215 aa  82.4  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  31.31 
 
 		 207 aa  81.6  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  33.52 
 
 		 225 aa  81.6  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  28.26 
 
 		 219 aa  82  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  29.82 
 
 		 204 aa  81.6  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  31.37 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  29.5 
 
 		 450 aa  80.5  0.00000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2120  thymidylate kinase  34.13 
 
 		 202 aa  80.1  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000730162  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  28.37 
 
 		 215 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  32.02 
 
 		 206 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  32.02 
 
 		 212 aa  79.7  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  30.27 
 
 		 426 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2443  thymidylate kinase  31.3 
 
 		 206 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2320  thymidylate kinase  31.3 
 
 		 206 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  29.33 
 
 		 216 aa  79  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  31.03 
 
 		 206 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  31.25 
 
 		 213 aa  78.6  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  31.03 
 
 		 206 aa  78.2  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  31.4 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1189  thymidylate kinase  30.87 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1425  thymidylate kinase  30.87 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2281  thymidylate kinase  30.87 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3388  thymidylate kinase  30.87 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.830309  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  31.4 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  30.85 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1916  thymidylate kinase  30.87 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  38.41 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  31.39 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  31.03 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  31.03 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  31.03 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  32.29 
 
 		 217 aa  77  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  28.91 
 
 		 219 aa  76.3  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  29.35 
 
 		 203 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  31.16 
 
 		 200 aa  75.9  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26491  thymidylate kinase  37.14 
 
 		 216 aa  76.6  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  30.13 
 
 		 205 aa  75.1  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  35.18 
 
 		 210 aa  75.5  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  34 
 
 		 224 aa  75.5  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0992  dTMP kinase  29.68 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241763  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  29.87 
 
 		 206 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44950  predicted protein  24.89 
 
 		 567 aa  74.7  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0434742  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1466  thymidylate kinase  30.13 
 
 		 205 aa  74.7  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  30.3 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  27.95 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02021  thymidylate kinase  30.86 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.409154  normal  0.831835 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  33.53 
 
 		 233 aa  73.6  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  31.88 
 
 		 218 aa  73.6  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1407  thymidylate kinase  29.7 
 
 		 213 aa  73.6  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255239  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  33.33 
 
 		 217 aa  73.2  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>