More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3992 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3992  Peptidase M23  100 
 
 		 175 aa  326  1.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1314  peptidase M23B  62.6 
 
 		 164 aa  149  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1203  peptidase M23B  60.31 
 
 		 214 aa  147  5e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.609657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2103  Peptidase M23  51.79 
 
 		 174 aa  135  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29214  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12905  hypothetical protein  47.73 
 
 		 249 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00765288  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2508  Peptidase M23  62.1 
 
 		 191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.744479  normal  0.326949 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09880  metalloendopeptidase-like membrane protein  57.98 
 
 		 219 aa  127  6e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1973  peptidase M23B  50.31 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.537655 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1992  peptidase M23B  50.31 
 
 		 161 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2038  peptidase M23B  50.31 
 
 		 161 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.101119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3582  peptidase M23B  57.5 
 
 		 291 aa  121  5e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1657  Peptidase M23  52.03 
 
 		 169 aa  120  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4134  peptidase M23B  53.12 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.300034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3114  Peptidase M23  61.29 
 
 		 170 aa  116  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00153698  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2208  peptidase M23B  52.76 
 
 		 162 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1366  peptidase M23B  45.24 
 
 		 173 aa  116  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0643294  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1160  peptidase M23B  54.2 
 
 		 269 aa  114  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.37426 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1528  Peptidase M23  50 
 
 		 139 aa  110  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0244521 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1383  Peptidase M23  49.57 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000013113 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3244  peptidase M23B  54.62 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.6882  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1179  Peptidase M23  44.17 
 
 		 193 aa  106  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.949137  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5912  Peptidase M23  51.96 
 
 		 331 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00345275  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0988  Peptidase M23  47.37 
 
 		 174 aa  102  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  0.110335 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10110  metalloendopeptidase-like membrane protein  51.61 
 
 		 238 aa  99.4  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1003  Peptidase M23  39.29 
 
 		 170 aa  97.4  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.760596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1543  peptidase M23B  45.95 
 
 		 254 aa  96.3  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1412  peptidase M23B  55.65 
 
 		 177 aa  95.1  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.21699 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1483  Peptidase M23  48.18 
 
 		 203 aa  94.4  7e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.22964  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0675  hypothetical protein  51.82 
 
 		 362 aa  94  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0396  M23/M37 family membrane peptidase  40.31 
 
 		 195 aa  89  3e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00347919  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0950  peptidase, M23 family  39.42 
 
 		 205 aa  89  3e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1859  peptidase, M23/M37 family  50.38 
 
 		 223 aa  87  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.986198  hitchhiker  0.00477913 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11180  metalloendopeptidase-like membrane protein  43.24 
 
 		 271 aa  82  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00950153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  26.63 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0015  Peptidase M23  36.11 
 
 		 395 aa  68.6  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136901  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  31.82 
 
 		 491 aa  66.6  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  24.54 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  30.22 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  29.69 
 
 		 308 aa  62.4  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  36.54 
 
 		 471 aa  62.4  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0535  peptidase M23B  27.98 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  32.86 
 
 		 286 aa  61.2  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  34.11 
 
 		 445 aa  60.8  0.000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0688  Peptidase M23  36.73 
 
 		 383 aa  60.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.50956  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  35.58 
 
 		 471 aa  60.8  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  31.54 
 
 		 464 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  33.33 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  31.62 
 
 		 446 aa  59.7  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  32.21 
 
 		 464 aa  59.7  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1646  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  29.92 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.570168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  36.67 
 
 		 445 aa  59.3  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  32 
 
 		 402 aa  58.9  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  33.33 
 
 		 468 aa  58.2  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  32.14 
 
 		 464 aa  58.2  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  32.31 
 
 		 304 aa  58.2  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  32.5 
 
 		 447 aa  57.8  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  32.5 
 
 		 447 aa  57.8  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  32.03 
 
 		 452 aa  57.8  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  37.5 
 
 		 490 aa  58.2  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0177  peptidase M23  33.57 
 
 		 298 aa  57.8  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  35.58 
 
 		 472 aa  57.4  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1354  peptidase M23B  32.85 
 
 		 424 aa  56.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000810467  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23480  peptidase M23B  31.69 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  31.3 
 
 		 470 aa  56.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1065  peptidase M23B  33.86 
 
 		 373 aa  56.2  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0161444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  31.29 
 
 		 402 aa  56.6  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2192  Peptidase M23  32.87 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0192897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0376  peptidase M23B  36.15 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  31.06 
 
 		 385 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  35.61 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  31.01 
 
 		 527 aa  55.8  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  35.23 
 
 		 443 aa  55.8  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2121  Peptidase M23  30.08 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1590  Peptidase M23  33.01 
 
 		 390 aa  55.8  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  28.15 
 
 		 417 aa  55.1  0.0000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0178  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  32.52 
 
 		 321 aa  55.5  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  29.25 
 
 		 283 aa  55.5  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0795  peptidase M23B  35.22 
 
 		 253 aa  55.1  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  28.57 
 
 		 273 aa  55.1  0.0000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  32.41 
 
 		 429 aa  55.1  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  28.57 
 
 		 244 aa  55.1  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  33.02 
 
 		 465 aa  55.1  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0038  peptidase M23B  40.66 
 
 		 597 aa  54.7  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0526  M24/M37 family peptidase  27.52 
 
 		 255 aa  54.7  0.0000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4626  peptidase M23B  43.48 
 
 		 592 aa  54.7  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0163104 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  31.3 
 
 		 442 aa  54.7  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  34.65 
 
 		 524 aa  54.3  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  38.6 
 
 		 425 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1339  M24/M37 family peptidase  32.85 
 
 		 417 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000501622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1314  cell wall endopeptidase  32.85 
 
 		 423 aa  53.9  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000373067  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1313  cell wall endopeptidase  32.85 
 
 		 423 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000309784  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  37.72 
 
 		 420 aa  53.9  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0304  hypothetical protein  36.79 
 
 		 272 aa  53.9  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1449  M23/37 family peptidase  32.85 
 
 		 417 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000128519  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  39.64 
 
 		 291 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  29.55 
 
 		 268 aa  53.9  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0676  peptidase M23B  31.41 
 
 		 482 aa  53.9  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0280  peptidase M23  31.2 
 
 		 656 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.076484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  31.97 
 
 		 399 aa  53.9  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1331  M23 peptidase domain-containing protein  33.91 
 
 		 389 aa  53.5  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>