More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3345 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3345  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 		 289 aa  588  1e-167  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4128  cytochrome c oxidase subunit II  55.22 
 
 		 269 aa  308  5e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1367  cytochrome c oxidase, subunit II  51.16 
 
 		 311 aa  290  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3300  cytochrome c oxidase, subunit II  56.7 
 
 		 323 aa  288  7e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86185  normal  0.446784 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3532  cytochrome c oxidase subunit II  57.09 
 
 		 323 aa  285  5.999999999999999e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.636307  decreased coverage  0.000170854 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3061  cytochrome c oxidase subunit II  45 
 
 		 398 aa  274  1.0000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.708633  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2949  cytochrome c oxidase, subunit II  45.31 
 
 		 344 aa  265  5.999999999999999e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3309  cytochrome c oxidase, subunit II  46.15 
 
 		 352 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49691  normal  0.220958 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3298  cytochrome c oxidase, subunit II  46.15 
 
 		 352 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3360  cytochrome c oxidase, subunit II  46.15 
 
 		 352 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.773952  normal  0.0585586 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3564  cytochrome c oxidase, subunit II  44.82 
 
 		 344 aa  263  4e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205108  normal  0.039922 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12228  transmembrane cytochrome C oxidase subunit II ctaC  43.9 
 
 		 363 aa  262  6e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3255  cytochrome c oxidase subunit II  48.43 
 
 		 316 aa  259  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000163024  hitchhiker  0.0000318285 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1537  cytochrome c oxidase subunit II  42.34 
 
 		 366 aa  250  2e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162083  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10630  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 2  45.97 
 
 		 315 aa  247  1e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.315267 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3117  cytochrome c oxidase, subunit II  47.77 
 
 		 316 aa  238  8e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.762727  normal  0.80653 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1801  cytochrome c oxidase subunit II  48.98 
 
 		 288 aa  232  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1015  cytochrome c oxidase subunit II  42.48 
 
 		 314 aa  223  4e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0476756  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3078  cytochrome c oxidase, subunit II  42.91 
 
 		 260 aa  210  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1667  cytochrome c oxidase, subunit II  44.91 
 
 		 287 aa  208  7e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23675 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3150  cytochrome c oxidase, subunit II  45.61 
 
 		 340 aa  199  5e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2670  cytochrome c oxidase, subunit II  44.44 
 
 		 265 aa  199  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0983455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16250  cytochrome c oxidase, subunit II  39.92 
 
 		 304 aa  198  7.999999999999999e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.178752  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3259  Cytochrome c oxidase subunit II  39.79 
 
 		 324 aa  195  9e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15630  cytochrome c oxidase, subunit II  39.78 
 
 		 299 aa  193  3e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.806307  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2082  cytochrome c oxidase, subunit II  41.91 
 
 		 289 aa  191  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1289  cytochrome c oxidase, subunit II  42.13 
 
 		 275 aa  189  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0956  cytochrome c oxidase, subunit II  42.11 
 
 		 280 aa  187  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.137087 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1453  cytochrome c oxidase, subunit II  39.46 
 
 		 299 aa  186  3e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0600133  normal  0.252589 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3141  cytochrome c oxidase, subunit II  40.5 
 
 		 324 aa  186  5e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1954  cytochrome c oxidase, subunit II  38.32 
 
 		 290 aa  183  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330547 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2016  cytochrome c oxidase, subunit II  38.91 
 
 		 304 aa  181  9.000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1885  cytochrome c oxidase, subunit II  41.82 
 
 		 288 aa  169  4e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.247552  hitchhiker  0.00527672 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2217  cytochrome c oxidase, subunit II  38.71 
 
 		 290 aa  169  6e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120292  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12220  cytochrome c oxidase, subunit II  37.31 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0561533  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14120  cytochrome c oxidase, subunit II  36.32 
 
 		 312 aa  158  8e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1824  cytochrome c oxidase subunit II  38.16 
 
 		 257 aa  157  3e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3047  cytochrome c oxidase, subunit II  32.69 
 
 		 281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000013174  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2962  cytochrome c oxidase, subunit II  30.6 
 
 		 401 aa  122  5e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2811  cytochrome c oxidase, subunit II  30.6 
 
 		 401 aa  122  5e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0879  cytochrome c oxidase, subunit II  31.06 
 
 		 373 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3818  cytochrome c oxidase, subunit II  32.65 
 
 		 388 aa  120  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198752 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2406  cytochrome c oxidase, subunit II  29.66 
 
 		 377 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4246  cytochrome c oxidase, subunit II  29.96 
 
 		 384 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0079  cytochrome c oxidase, subunit II  29.39 
 
 		 375 aa  116  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0293  cytochrome c oxidase, subunit II  33.1 
 
 		 311 aa  116  5e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.142345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0036  cytochrome c oxidase, subunit II  30.47 
 
 		 378 aa  115  6.9999999999999995e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0180  cytochrome c oxidase subunit II  28.2 
 
 		 366 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01290  cytochrome c oxidase, subunit II  28.95 
 
 		 374 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.46157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0033  cytochrome c oxidase, subunit II  31.05 
 
 		 279 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.511366 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0119  cytochrome c oxidase, subunit II  31.65 
 
 		 375 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2717  cytochrome c oxidase, subunit II  31.56 
 
 		 523 aa  112  5e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.977219  normal  0.293993 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04013  Cytochrome c oxidase, subunit II  32.05 
 
 		 387 aa  113  5e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.94805  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3155  cytochrome c oxidase, subunit II  30.34 
 
 		 320 aa  112  7.000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0183  cytochrome c oxidase, subunit II  31.78 
 
 		 377 aa  112  8.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000324421  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0621  cytochrome c oxidase, subunit II  33.49 
 
 		 255 aa  112  9e-24  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345466  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1405  cytochrome-c oxidase  30.13 
 
 		 343 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0686645  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2349  cytochrome c oxidase, subunit II  32.49 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.911923 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1777  cytochrome c oxidase, subunit II  31.36 
 
 		 377 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.302976  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0117  cytochrome c oxidase, subunit II  31.22 
 
 		 375 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0102376 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3181  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor  28.37 
 
 		 398 aa  110  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0258  cytochrome c oxidase, subunit II  30.21 
 
 		 528 aa  110  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0103  cytochrome c oxidase, subunit II  30.8 
 
 		 375 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0122  cytochrome c oxidase, subunit II  30.8 
 
 		 375 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  28.63 
 
 		 405 aa  109  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0544  cytochrome c oxidase, subunit II  30.64 
 
 		 544 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214831  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0300  cytochrome c oxidase, subunit II  28.33 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4321  cytochrome-c oxidase  32.16 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.018888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3459  cytochrome c oxidase, subunit II  31.63 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.927042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0913  cytochrome-c oxidase  29.23 
 
 		 349 aa  107  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0214333  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4506  cytochrome c oxidase, subunit II  28.37 
 
 		 304 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0814  cytochrome-c oxidase  28.82 
 
 		 284 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.278116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0260  cytochrome c oxidase, subunit II  31.63 
 
 		 288 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.150091  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01020  cytochrome c oxidase, subunit II  29.76 
 
 		 385 aa  106  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24737  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0236  cytochrome c oxidase, subunit II  29.48 
 
 		 519 aa  106  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.717105  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3782  cytochrome c oxidase, subunit II  28.39 
 
 		 512 aa  105  7e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3517  cytochrome c oxidase, subunit II  28.57 
 
 		 511 aa  105  8e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2234  cytochrome-c oxidase  31.22 
 
 		 292 aa  105  9e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00748725 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0362  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor (cytochrome AA3 subunit 2) transmembrane protein  29.24 
 
 		 390 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.934147 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0314  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  32.03 
 
 		 421 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0178  cytochrome c oxidase, subunit II  31.03 
 
 		 513 aa  104  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3907  cytochrome c oxidase, subunit II  32.73 
 
 		 390 aa  105  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0062  cytochrome c oxidase, subunit II  29.89 
 
 		 374 aa  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0885746  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0878  cytochrome c oxidase, subunit II  31.53 
 
 		 401 aa  103  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3587  cytochrome c oxidase, subunit II  31.22 
 
 		 279 aa  103  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3263  cytochrome c oxidase, subunit II  31.22 
 
 		 279 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.571759  normal  0.256995 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  28.81 
 
 		 388 aa  103  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4171  putative cytochrome c oxidase  29.36 
 
 		 538 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.82291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1940  cytochrome c oxidase, subunit II  31.14 
 
 		 385 aa  103  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0684443  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1245  cytochrome c oxidase, subunit II  30.9 
 
 		 400 aa  102  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.731852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0261  cytochrome c oxidase subunit II  30.91 
 
 		 422 aa  102  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.814908 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4392  cytochrome c oxidase, subunit II  29.29 
 
 		 392 aa  102  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3999  cytochrome c oxidase subunit II  27.8 
 
 		 524 aa  101  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0456  cytochrome c oxidase, subunit II  28.81 
 
 		 532 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2858  cytochrome c oxidase, subunit II  28.69 
 
 		 532 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760436 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0079  putative cytochrome c oxidase subunit II  29.82 
 
 		 342 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.917681  hitchhiker  0.00234837 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1674  cytochrome c oxidase, subunit II  30.74 
 
 		 380 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0741  cytochrome c oxidase, subunit II  28.21 
 
 		 287 aa  101  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2847  cytochrome c oxidase, subunit II  28.69 
 
 		 532 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>