216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1269 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  100 
 
 		 414 aa  822    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  68.78 
 
 		 388 aa  491  9.999999999999999e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  55.39 
 
 		 397 aa  415  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  47.49 
 
 		 382 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  46.98 
 
 		 382 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  50 
 
 		 375 aa  361  1e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  49.49 
 
 		 383 aa  360  3e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  50.92 
 
 		 387 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  52.08 
 
 		 354 aa  357  1.9999999999999998e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  46.58 
 
 		 392 aa  356  3.9999999999999996e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  46.12 
 
 		 380 aa  355  6.999999999999999e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  48.98 
 
 		 387 aa  355  1e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  50.39 
 
 		 384 aa  354  1e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  50.7 
 
 		 346 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  51.55 
 
 		 346 aa  352  8e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  47.07 
 
 		 387 aa  352  8.999999999999999e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  45.89 
 
 		 382 aa  352  8.999999999999999e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  50 
 
 		 384 aa  349  5e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  49.58 
 
 		 402 aa  349  5e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  50.27 
 
 		 361 aa  348  1e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1457  aldose 1-epimerase  47.62 
 
 		 387 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808924  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6371  aldose 1-epimerase  47.62 
 
 		 387 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  50.42 
 
 		 346 aa  347  3e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  50.7 
 
 		 346 aa  342  9e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5727  aldose 1-epimerase  50.42 
 
 		 390 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6480  aldose 1-epimerase  49.86 
 
 		 390 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0142424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7038  aldose 1-epimerase  49.03 
 
 		 387 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.754242  normal  0.230743 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  50.84 
 
 		 357 aa  334  2e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  46.74 
 
 		 393 aa  332  8e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4369  Aldose 1-epimerase  49.34 
 
 		 372 aa  328  8e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.0127022 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  51.06 
 
 		 321 aa  326  5e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  50.55 
 
 		 355 aa  326  5e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  47.61 
 
 		 390 aa  325  9e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  47.79 
 
 		 347 aa  318  1e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  47.91 
 
 		 356 aa  317  2e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  47.91 
 
 		 356 aa  317  2e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0788  aldose 1-epimerase  49.16 
 
 		 357 aa  317  3e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000118587  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1611  aldose 1-epimerase  43.76 
 
 		 438 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0628258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  45.88 
 
 		 362 aa  313  2.9999999999999996e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  51.14 
 
 		 317 aa  313  4.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  45.19 
 
 		 400 aa  310  4e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  45.79 
 
 		 397 aa  309  5.9999999999999995e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  43.7 
 
 		 356 aa  309  5.9999999999999995e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  43.66 
 
 		 392 aa  308  1.0000000000000001e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  45.53 
 
 		 434 aa  306  6e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  46.58 
 
 		 359 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1805  aldose 1-epimerase  46.33 
 
 		 385 aa  304  2.0000000000000002e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.122387 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1147  aldose 1-epimerase  44.6 
 
 		 368 aa  304  2.0000000000000002e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.934595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  46.05 
 
 		 372 aa  300  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  42.54 
 
 		 354 aa  298  1e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3154  aldose 1-epimerase  48.75 
 
 		 350 aa  297  2e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  47.11 
 
 		 356 aa  293  3e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  41.93 
 
 		 355 aa  288  1e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  44.54 
 
 		 359 aa  282  7.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0282  Aldose 1-epimerase  47.18 
 
 		 357 aa  281  1e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22783  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3534  aldose 1-epimerase  42.11 
 
 		 360 aa  281  2e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1020  aldose 1-epimerase  43.45 
 
 		 355 aa  269  8e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  40.58 
 
 		 355 aa  263  3e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0819  aldose 1-epimerase  43.34 
 
 		 351 aa  262  1e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2682  aldose 1-epimerase  36.97 
 
 		 406 aa  260  4e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1033  aldose 1-epimerase  43.09 
 
 		 341 aa  253  6e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  42.98 
 
 		 363 aa  252  7e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0556  aldose 1-epimerase  36.39 
 
 		 353 aa  249  5e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000526339  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2369  aldose 1-epimerase  40.73 
 
 		 339 aa  248  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  41.18 
 
 		 361 aa  247  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0535  aldose 1-epimerase  40.23 
 
 		 341 aa  244  3e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0136204 
 
 
-
 
NC_004310  BR0857  aldose 1-epimerase  39.33 
 
 		 340 aa  242  7.999999999999999e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1344  aldose 1-epimerase  36.44 
 
 		 343 aa  242  7.999999999999999e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  40.56 
 
 		 362 aa  242  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0850  aldose 1-epimerase  39.33 
 
 		 340 aa  241  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  40.5 
 
 		 371 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2072  aldose 1-epimerase  40.35 
 
 		 351 aa  240  4e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0156594  hitchhiker  0.00000257166 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  41.03 
 
 		 354 aa  239  6.999999999999999e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  40.9 
 
 		 362 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1985  aldose 1-epimerase  39.77 
 
 		 351 aa  236  4e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0318773  normal  0.0314397 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  39.89 
 
 		 362 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  41.29 
 
 		 376 aa  235  8e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1989  aldose 1-epimerase  39.77 
 
 		 351 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0839729  unclonable  0.000022242 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  38.61 
 
 		 360 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3250  aldose 1-epimerase  37.25 
 
 		 344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  38.61 
 
 		 360 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2713  Aldose 1-epimerase  41.77 
 
 		 348 aa  232  8.000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4249  aldose 1-epimerase  42.42 
 
 		 353 aa  231  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2946  aldose 1-epimerase  40 
 
 		 356 aa  231  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2135  Aldose 1-epimerase  37.74 
 
 		 345 aa  231  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0437156 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1551  aldose 1-epimerase  35.07 
 
 		 340 aa  231  2e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2723  Aldose 1-epimerase  39.15 
 
 		 350 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2858  aldose 1-epimerase  40 
 
 		 356 aa  231  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.852671  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0923  aldose 1-epimerase  40.17 
 
 		 346 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.285804 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0837  aldose 1-epimerase  40.17 
 
 		 346 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  40.93 
 
 		 362 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0809  aldose 1-epimerase  40.17 
 
 		 346 aa  230  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0868  aldose 1-epimerase  40.17 
 
 		 346 aa  229  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.558575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0900  aldose 1-epimerase  39.89 
 
 		 346 aa  229  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  40.66 
 
 		 362 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2906  aldose 1-epimerase  40.23 
 
 		 346 aa  228  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.336239 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0779  aldose 1-epimerase  40.23 
 
 		 346 aa  228  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.184805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  40.66 
 
 		 362 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0810  aldose 1-epimerase  40.23 
 
 		 346 aa  228  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0677  aldose 1-epimerase  40.23 
 
 		 346 aa  228  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.569185  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>