More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2389 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2389  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 260 aa  527  1e-149  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.68817  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2649  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.6 
 
 		 269 aa  120  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2490  extracellular solute-binding protein family 3  33.77 
 
 		 273 aa  115  5e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0489  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  27.03 
 
 		 490 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3696  extracellular solute-binding protein  30.38 
 
 		 268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589095  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5815  putative ABC transporter binding protein subunit  32.02 
 
 		 266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.387818  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2022  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.93 
 
 		 748 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  32.42 
 
 		 250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  31.27 
 
 		 257 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1818  extracellular solute-binding protein family 3  31.28 
 
 		 273 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0079129  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0441  extracellular solute-binding protein  31.28 
 
 		 266 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1658  extracellular solute-binding protein  28.19 
 
 		 243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000026827  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67050  putative binding protein component of ABC transporter  31.9 
 
 		 266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18770  extracellular solute-binding protein family 3  26.91 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3760  extracellular solute-binding protein  32.54 
 
 		 245 aa  110  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000882813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1385  extracellular solute-binding protein  29.92 
 
 		 271 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00529871  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1344  extracellular solute-binding protein family 3  30.84 
 
 		 272 aa  108  6e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.752805 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3166  extracellular solute-binding protein  31.75 
 
 		 242 aa  109  6e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.190587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0375  extracellular solute-binding protein  30.09 
 
 		 265 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2022  extracellular solute-binding protein  30.53 
 
 		 272 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.167722  normal  0.899953 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0124  extracellular solute-binding protein family 3  32 
 
 		 266 aa  108  9.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5024  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.69 
 
 		 266 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.258075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4898  extracellular solute-binding protein  29.69 
 
 		 266 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.733781 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5074  extracellular solute-binding protein  29.69 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.599311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3886  amino acid ABC transporter permease  30 
 
 		 501 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2277  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  30.83 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1377  extracellular solute-binding protein  28.7 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000115158  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1692  extracellular solute-binding protein family 3  30.58 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1196  amino acid-binding protein  31.3 
 
 		 256 aa  106  3e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.166337  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1041  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtJ  31.47 
 
 		 243 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.385191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0959  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtJ  31.47 
 
 		 243 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1022  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtJ  31.47 
 
 		 243 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0924  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  31.47 
 
 		 243 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0338236  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0991  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtJ  31.47 
 
 		 243 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0955  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.95 
 
 		 268 aa  105  7e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0776363  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1361  extracellular solute-binding protein  27.89 
 
 		 257 aa  105  8e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3397  extracellular solute-binding protein  30.68 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0859  amino acid ABC transporter permease  31.3 
 
 		 990 aa  103  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0204986  normal  0.722319 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1036  amino acid ABC transporter permease  31.3 
 
 		 990 aa  103  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.328178 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0888  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  29.88 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.214233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0360  extracellular solute-binding protein  29.11 
 
 		 276 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.974296  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00865  arginine transporter subunit  30.68 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2782  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  30.68 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0257892  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0964  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  30.68 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0906  amino acid-binding protein  29.27 
 
 		 256 aa  103  3e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2471  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  30.68 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.198291  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00871  hypothetical protein  30.68 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0932  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  30.68 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2736  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  30.68 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0318086  normal  0.950747 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0986  extracellular solute-binding protein  30.04 
 
 		 244 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3277  extracellular solute-binding protein family 3  29.41 
 
 		 264 aa  103  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0951  extracellular solute-binding protein  30.04 
 
 		 244 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3392  extracellular solute-binding protein  30.04 
 
 		 244 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0624048  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3053  extracellular solute-binding protein  29.36 
 
 		 244 aa  102  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000807518  normal  0.0316275 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0919  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 		 244 aa  103  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.55 
 
 		 513 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3796  extracellular solute-binding protein family 3  28.63 
 
 		 281 aa  102  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0150584  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1019  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  29.48 
 
 		 243 aa  102  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.211484 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  28.99 
 
 		 246 aa  102  5e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0836  amino acid-binding protein  29.27 
 
 		 256 aa  102  5e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.462057  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1044  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.77 
 
 		 244 aa  102  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  28.99 
 
 		 246 aa  102  6e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3027  extracellular solute-binding protein  30.04 
 
 		 244 aa  102  7e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2377  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  29.53 
 
 		 243 aa  102  8e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.730778  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  29.81 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0928  extracellular solute-binding protein family 3  29.46 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  28.63 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0714  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.15 
 
 		 755 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  26.46 
 
 		 271 aa  100  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0882  extracellular solute-binding protein  28.94 
 
 		 244 aa  101  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00121366  normal  0.225798 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1964  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  30.31 
 
 		 243 aa  100  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.822983  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0972  extracellular solute-binding protein family 3  28.81 
 
 		 250 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.801508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  27.51 
 
 		 264 aa  99.8  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1698  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  29.92 
 
 		 243 aa  99.4  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.176126  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2235  extracellular solute-binding protein  30.13 
 
 		 268 aa  99.4  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1446  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.68 
 
 		 494 aa  99  7e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.233096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1525  extracellular solute-binding protein  31.13 
 
 		 255 aa  97.8  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.490796  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1804  extracellular solute-binding protein family 3  29.27 
 
 		 267 aa  97.8  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1566  extracellular solute-binding protein family 3  26.87 
 
 		 253 aa  97.4  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2280  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  29.96 
 
 		 244 aa  97.4  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0814  extracellular solute-binding protein  30.26 
 
 		 268 aa  97.4  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00687374  normal  0.141124 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1967  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  27.07 
 
 		 243 aa  97.4  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.471515  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1594  extracellular solute-binding protein  27.42 
 
 		 252 aa  97.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854968  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1475  extracellular solute-binding protein  30.7 
 
 		 260 aa  97.1  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0984243  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  28.17 
 
 		 264 aa  97.1  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4410  extracellular solute-binding protein family 3  28 
 
 		 251 aa  96.7  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0125  extracellular solute-binding protein family 3  26.96 
 
 		 270 aa  96.3  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0592  amino acid ABC transporter, permease/substrate-binding lipoprotein  27.84 
 
 		 252 aa  96.3  5e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000143889  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1376  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  29.39 
 
 		 243 aa  95.9  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2456  extracellular solute-binding protein  27.49 
 
 		 265 aa  95.9  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68791  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1775  extracellular solute-binding protein  25.95 
 
 		 251 aa  95.9  6e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.742308  hitchhiker  0.000324527 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2724  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  29.53 
 
 		 243 aa  95.9  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00108182  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0904  glutamine-binding periplasmic protein  27.27 
 
 		 254 aa  95.5  7e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.207514  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2141  extracellular solute-binding protein  28.05 
 
 		 247 aa  95.5  7e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0343212 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0131  glutamine transport system substrate-binding protein  26.99 
 
 		 285 aa  95.5  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.210199  normal  0.0525108 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0208  basic amino acid ABC transporter periplasmic protein  29.49 
 
 		 255 aa  95.5  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1395  amino acid ABC transporter, permease/amino acid-binding protein, putative  25.99 
 
 		 485 aa  95.1  9e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2639  arginine ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein ArtJ  29.53 
 
 		 243 aa  95.1  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000964568  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1569  arginine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein ArtJ  29.53 
 
 		 243 aa  95.1  9e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2725  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 		 255 aa  94.7  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.377172 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>