More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1405 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1405  Exodeoxyribonuclease V  100 
 
 		 1214 aa  2510    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3707  ATPase  28.46 
 
 		 1277 aa  344  5e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.405586  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1462  helicase RecD/TraA  27.82 
 
 		 739 aa  140  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0989  helicase, RecD/TraA family  26.88 
 
 		 738 aa  132  3e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0667  helicase, RecD/TraA family  29.33 
 
 		 728 aa  130  1.0000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0540027  normal  0.0105669 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2433  RecD/TraA family helicase  26.24 
 
 		 744 aa  126  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0696  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  25.56 
 
 		 795 aa  124  9e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2143  RecD/TraA family helicase  26.24 
 
 		 744 aa  123  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0089  exonuclease V subunit alpha  26.51 
 
 		 813 aa  119  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930068  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2772  Exodeoxyribonuclease V  26.21 
 
 		 653 aa  118  6.9999999999999995e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00547941  hitchhiker  0.000384136 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2841  helicase RecD/TraA  26.68 
 
 		 733 aa  117  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1047  helicase, RecD/TraA family  26.99 
 
 		 711 aa  116  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.604739  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2673  RecD/TraA family helicase  27.38 
 
 		 736 aa  115  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0323  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  26.19 
 
 		 599 aa  115  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0243  helicase RecD/TraA  28.86 
 
 		 749 aa  114  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0357399  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2726  helicase, RecD/TraA family  24.6 
 
 		 741 aa  113  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000501325  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0509  helicase, RecD/TraA family  26.58 
 
 		 728 aa  111  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.156779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3380  RecD/TraA family helicase  23.7 
 
 		 742 aa  110  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586227 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0847  helicase RecD/TraA  27.29 
 
 		 738 aa  110  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1432  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  25.36 
 
 		 576 aa  109  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00407883  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1393  RecD/TraA family helicase  29.54 
 
 		 719 aa  109  4e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0838  RecD/TraA family helicase  26.03 
 
 		 731 aa  108  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4923  RecD/TraA family helicase  28.14 
 
 		 744 aa  108  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478208  normal  0.0184045 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1864  RecD/TraA family helicase  26.74 
 
 		 728 aa  105  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl322  exodeoxyribonuclease V  25.93 
 
 		 743 aa  104  9e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862926  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0993  helicase, RecD/TraA family  33.85 
 
 		 728 aa  104  9e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2249  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  24.83 
 
 		 746 aa  103  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000721338  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5748  helicase, RecD/TraA family  28.01 
 
 		 768 aa  103  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3839  helicase, RecD/TraA family  27.74 
 
 		 750 aa  102  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0839164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0764  helicase, RecD/TraA family  27.59 
 
 		 728 aa  103  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0607896  normal  0.527893 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1056  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  25.83 
 
 		 609 aa  102  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.923429  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6026  helicase, RecD/TraA family  27.76 
 
 		 742 aa  102  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143293  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1724  helicase, putative  24.71 
 
 		 806 aa  102  6e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1852  ATPase  23.66 
 
 		 745 aa  101  8e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1358  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  26.54 
 
 		 588 aa  100  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2965  exonuclease V subunit alpha  27 
 
 		 608 aa  101  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6207  helicase, RecD/TraA family  27.74 
 
 		 725 aa  100  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4241  RecD/TraA family helicase  24.93 
 
 		 778 aa  100  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0578  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  25.68 
 
 		 601 aa  100  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02667  exonuclease V (RecBCD complex), alpha chain  26.81 
 
 		 608 aa  99.8  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.690529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0872  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  26.81 
 
 		 608 aa  99.8  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.938405  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0896  exonuclease V subunit alpha  26.81 
 
 		 608 aa  99.8  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.367719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1903  exodeoxyribonuclease V, 67 kDa subunit  24.74 
 
 		 706 aa  99.4  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5319  helicase, RecD/TraA family  30.77 
 
 		 750 aa  99.4  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02628  hypothetical protein  26.81 
 
 		 608 aa  99.8  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.627808  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3139  exonuclease V subunit alpha  26.81 
 
 		 608 aa  99.8  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3043  exonuclease V subunit alpha  26.81 
 
 		 608 aa  99.8  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.225396  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1903  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  24.66 
 
 		 833 aa  99.8  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1535  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  24.71 
 
 		 595 aa  99  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.559097  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5543  RecD/TraA family helicase  31.36 
 
 		 744 aa  98.6  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4514  putative helicase  24.79 
 
 		 778 aa  98.2  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837139  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2085  exodeoxyribonuclease V  28.18 
 
 		 732 aa  98.2  9e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4289  helicase  24.64 
 
 		 778 aa  97.4  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4126  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  24.64 
 
 		 778 aa  97.4  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396274  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4137  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  24.64 
 
 		 778 aa  97.8  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4474  putative helicase  24.64 
 
 		 778 aa  97.8  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000066137 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4622  helicase  24.64 
 
 		 770 aa  97.4  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4627  RecD/TraA family helicase  28.29 
 
 		 871 aa  97.4  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0750551  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4477  helicase, putative  24.64 
 
 		 778 aa  97.1  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.718062  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4084  exonuclease V subunit alpha  27.12 
 
 		 608 aa  96.7  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0722  putative helicase  24.93 
 
 		 778 aa  96.7  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4527  putative helicase  24.79 
 
 		 778 aa  96.3  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0134792  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2495  helicase, RecD/TraA family  23.6 
 
 		 784 aa  96.3  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0455  RecD/TraA family helicase  24.85 
 
 		 731 aa  95.9  4e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.232252  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0186  RecD/TraA family helicase  27.31 
 
 		 728 aa  95.1  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0008  helicase, RecD/TraA family  34.48 
 
 		 727 aa  95.1  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0947  helicase, RecD/TraA family  31.33 
 
 		 740 aa  94.7  9e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4756  helicase, RecD/TraA family  30.99 
 
 		 735 aa  94.7  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00416284  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0010  helicase, RecD/TraA family  32.57 
 
 		 733 aa  94.4  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381195  normal  0.357387 
 
 
-
 
NC_002620  TC0302  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  29.39 
 
 		 744 aa  93.6  2e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0009  RecD/TraA family helicase  32.82 
 
 		 733 aa  93.6  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0549724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3106  RecD/TraA family helicase  24.14 
 
 		 772 aa  93.6  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1400  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  26.33 
 
 		 581 aa  93.6  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3541  RecD/TraA family helicase  32.86 
 
 		 731 aa  92.8  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1269  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  25.33 
 
 		 680 aa  92.8  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2733  helicase, RecD/TraA family  39.72 
 
 		 762 aa  92.8  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135188  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1758  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  24.9 
 
 		 737 aa  92.8  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3273  RecD/TraA family helicase  32.39 
 
 		 731 aa  92.4  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4850  exodeoxyribonuclease V alpha chain  26.09 
 
 		 720 aa  92  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.61173  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4895  exodeoxyribonuclease V  26.72 
 
 		 776 aa  92  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382382  normal  0.0563011 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5408  helicase, RecD/TraA family  41.77 
 
 		 741 aa  92  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.68949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3229  Exodeoxyribonuclease V  31.41 
 
 		 637 aa  92  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.115754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51700  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  26.12 
 
 		 703 aa  91.3  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.851543  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1106  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  28.83 
 
 		 766 aa  90.9  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.710549  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf852  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  34.59 
 
 		 732 aa  90.9  1e-16  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2658  Exodeoxyribonuclease V  35.2 
 
 		 659 aa  90.1  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0285632  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0608  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  28.65 
 
 		 825 aa  90.5  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4247  RecD/TraA family helicase  30.04 
 
 		 736 aa  90.1  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0682  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  26.55 
 
 		 697 aa  89.4  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0995  helicase RecD/TraA  30.56 
 
 		 727 aa  89.4  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0231069  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55660  exodeoxyribonuclease V alpha chain  25.25 
 
 		 721 aa  89.4  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.866156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3230  exonuclease V subunit alpha  27.17 
 
 		 652 aa  88.6  7e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.91996 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0770  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  24.24 
 
 		 579 aa  87.8  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0335755  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3139  exonuclease V subunit alpha  24.86 
 
 		 611 aa  86.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3156  exonuclease V subunit alpha  24.77 
 
 		 611 aa  87.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3319  exonuclease V subunit alpha  24.86 
 
 		 611 aa  86.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.940485 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3205  exonuclease V subunit alpha  24.86 
 
 		 611 aa  86.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1186  exonuclease V subunit alpha  31.56 
 
 		 792 aa  87.4  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000641615  normal  0.675634 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1208  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  24.16 
 
 		 551 aa  87  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3219  exonuclease V subunit alpha  24.86 
 
 		 611 aa  86.7  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>