178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2779 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2779  hypothetical protein  100 
 
 
406 aa  811    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0540  hypothetical protein  89.9 
 
 
406 aa  744    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4815  hypothetical protein  83.95 
 
 
406 aa  704    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604188  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5329  hypothetical protein  59.71 
 
 
407 aa  502  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.54087 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5079  hypothetical protein  55.39 
 
 
417 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0783  AAA family ATPase  52.84 
 
 
412 aa  434  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0127  ATPase (AAA+ superfamily)  52.59 
 
 
412 aa  431  1e-119  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.803222  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3974  AAA family ATPase  46.12 
 
 
412 aa  387  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2317  AAA family ATPase  45.74 
 
 
418 aa  360  3e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1213  AAA family ATPase  44.61 
 
 
415 aa  353  4e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3861  AAA family ATPase  45.83 
 
 
415 aa  346  4e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0363925 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2955  AAA family ATPase  44.36 
 
 
416 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3875  AAA family ATPase  40.34 
 
 
416 aa  298  1e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.937317 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10609  hypothetical protein  42.13 
 
 
411 aa  297  2e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.618194 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6254  hypothetical protein  42.58 
 
 
430 aa  293  4e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13201  hypothetical protein  38.01 
 
 
454 aa  272  7e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.407807 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0703  hypothetical protein  37.98 
 
 
436 aa  249  6e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232427  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3175  AAA family ATPase  37.44 
 
 
415 aa  243  6e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1910  hypothetical protein  34.77 
 
 
426 aa  235  9e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0676  ATPase, AAA+ superfamily protein  33.88 
 
 
425 aa  222  9e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0218  hypothetical protein  32.5 
 
 
406 aa  208  1e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3137  putative GTP-binding protein  31.77 
 
 
418 aa  207  4e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1538  AAA family ATPase  33.59 
 
 
388 aa  203  5e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129495  hitchhiker  0.000845255 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0220  hypothetical protein  34.1 
 
 
474 aa  199  6e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2346  AAA family ATPase  35.04 
 
 
385 aa  192  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0737  hypothetical protein  33.17 
 
 
409 aa  189  5.999999999999999e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.608539  normal  0.643464 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0818  hypothetical ATPase  29.81 
 
 
421 aa  189  5.999999999999999e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0064  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  33.43 
 
 
391 aa  189  7e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1495  AAA family ATPase  33.62 
 
 
392 aa  187  3e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000702587  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4315  AAA family ATPase  33.66 
 
 
407 aa  186  7e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.993823 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3330  AAA+ superfamily protein  31.33 
 
 
386 aa  184  3e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0799  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  33.15 
 
 
394 aa  184  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  31.12 
 
 
380 aa  181  2e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0779  AAA family ATPase  33.24 
 
 
402 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4738  putative GTP-binding protein  30.6 
 
 
409 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1921  AAA family ATPase  31.55 
 
 
389 aa  179  7e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0414  AAA family ATPase  29.87 
 
 
392 aa  177  3e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.117991  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0124  putative GTP-binding protein  29.44 
 
 
408 aa  177  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1764  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  31.64 
 
 
386 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  28.09 
 
 
408 aa  170  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  31.22 
 
 
388 aa  168  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3726  AAA family ATPase  28.02 
 
 
385 aa  167  4e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0829  ATPase protein  28.5 
 
 
412 aa  164  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1879  hypothetical protein  29.71 
 
 
339 aa  160  5e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2189  ATPase  31.19 
 
 
413 aa  159  7e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1959  hypothetical protein  27.88 
 
 
388 aa  157  4e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13323  hypothetical protein  37.18 
 
 
269 aa  155  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0740  hypothetical protein  31.11 
 
 
384 aa  154  4e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  28.23 
 
 
426 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0599  AAA family ATPase  31.4 
 
 
380 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1072  AAA ATPase  27.95 
 
 
390 aa  150  6e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.352616 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1352  AAA ATPase  29.3 
 
 
394 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.054577 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  27.67 
 
 
392 aa  147  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0407  hypothetical protein  32.2 
 
 
389 aa  147  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11265  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12040  hypothetical protein  29.72 
 
 
441 aa  145  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0644  hypothetical protein  30.61 
 
 
388 aa  143  6e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5475  AAA ATPase  30.05 
 
 
391 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.945567  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2398  hypothetical protein  29.14 
 
 
390 aa  138  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.90734  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  27.04 
 
 
390 aa  138  1e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3833  hypothetical protein  29.14 
 
 
390 aa  138  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.682095 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3104  AAA ATPase  31.44 
 
 
389 aa  136  8e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.459276  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3747  hypothetical protein  27.6 
 
 
387 aa  135  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0011  ATPase  30.23 
 
 
392 aa  134  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0181  AAA family ATPase  28.42 
 
 
383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0254129 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1336  hypothetical protein  29.33 
 
 
394 aa  127  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0386172 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0926  hypothetical protein  31.08 
 
 
402 aa  125  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2079  hypothetical protein  28.17 
 
 
427 aa  122  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0738237  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0107  hypothetical ATPase  28.17 
 
 
427 aa  122  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2916  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  30.82 
 
 
425 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2477  AAA family ATPase  27.38 
 
 
383 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  28.53 
 
 
378 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1590  putative AAA+ superfamily ATPase  29.02 
 
 
402 aa  117  5e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  26.16 
 
 
376 aa  117  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4042  hypothetical protein  27.35 
 
 
376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163305 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2379  hypothetical protein  28.33 
 
 
408 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1709  hypothetical protein  28.74 
 
 
424 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1984  hypothetical protein  28.22 
 
 
377 aa  113  6e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0133  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  34.17 
 
 
259 aa  113  7.000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2465  hypothetical protein  27.07 
 
 
379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628763  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2604  AAA family ATPase  29.53 
 
 
426 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.95878  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5624  AAA ATPase  24.73 
 
 
378 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1211  hypothetical protein  23.83 
 
 
402 aa  103  5e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000035841 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  26.7 
 
 
393 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1885  hypothetical protein  26.24 
 
 
398 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0306  hypothetical ATPase  26.24 
 
 
419 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3053  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  29.68 
 
 
423 aa  100  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0030  hypothetical ATPase  24.47 
 
 
416 aa  100  5e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1630  hypothetical protein  25.77 
 
 
382 aa  99  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.12881  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0497  hypothetical ATPase  25.77 
 
 
386 aa  98.6  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6614  hypothetical protein  26.35 
 
 
424 aa  96.7  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1351  putative AAA+ superfamily ATPase  29.48 
 
 
229 aa  95.9  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1026  hypothetical ATPase  24.67 
 
 
380 aa  95.1  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1156  hypothetical protein  26.7 
 
 
423 aa  92.4  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313179  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2000  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  28.75 
 
 
476 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670199  normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0096  hypothetical protein  25.07 
 
 
423 aa  89  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1860  hypothetical protein  25.91 
 
 
394 aa  88.6  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1812  hypothetical protein  25.37 
 
 
395 aa  88.6  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000822502  normal  0.708548 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1926  hypothetical protein  29.1 
 
 
350 aa  88.2  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0509  hypothetical protein  24.62 
 
 
396 aa  88.2  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1973  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  26.91 
 
 
486 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>