224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0950 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0950  protein of unknown function DUF336  100 
 
 
132 aa  261  2e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  64.89 
 
 
137 aa  176  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  67.23 
 
 
133 aa  173  6e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3026  hypothetical protein  72.95 
 
 
132 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19040  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  69.31 
 
 
140 aa  148  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.631262  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  51.91 
 
 
139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  43.75 
 
 
147 aa  121  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  47.29 
 
 
167 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  46.62 
 
 
134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0282  protein of unknown function DUF336  52.03 
 
 
135 aa  111  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  47.37 
 
 
144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7748  protein of unknown function DUF336  48.76 
 
 
133 aa  106  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  46.62 
 
 
144 aa  104  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  46.62 
 
 
144 aa  104  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  46.62 
 
 
144 aa  104  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  46.46 
 
 
133 aa  103  9e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1722  hypothetical protein  51.4 
 
 
181 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  45.74 
 
 
144 aa  100  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1471  hypothetical protein  46.15 
 
 
133 aa  100  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.737997 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4253  hypothetical protein  49.59 
 
 
141 aa  99.8  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.874901  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  42.86 
 
 
137 aa  97.4  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1777  protein of unknown function DUF336  54.29 
 
 
144 aa  97.8  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  43.75 
 
 
143 aa  97.1  8e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4277  hypothetical protein  44.36 
 
 
150 aa  96.7  8e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0913  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  50 
 
 
173 aa  95.5  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4389  hypothetical protein  46.62 
 
 
144 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00597448  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1943  ATP--cobalamin adenosyltransferase  46.22 
 
 
333 aa  94.7  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  50 
 
 
144 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2812  hypothetical protein  38.76 
 
 
144 aa  87.8  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47070  hypothetical protein  42.52 
 
 
143 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3305  hypothetical protein  46.09 
 
 
140 aa  85.9  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3443  hypothetical protein  39.46 
 
 
156 aa  83.6  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  40.16 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  39.53 
 
 
170 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1736  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  34.68 
 
 
157 aa  80.1  0.000000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  40.62 
 
 
139 aa  80.1  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6184  protein of unknown function DUF336  46.46 
 
 
133 aa  76.6  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285192  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  40.34 
 
 
147 aa  76.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1179  hypothetical protein  43.52 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.459415  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1010  hypothetical protein  43.52 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000124371  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2388  hypothetical protein  53.47 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214166  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  42.34 
 
 
142 aa  75.1  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3107  protein of unknown function DUF336  41.82 
 
 
145 aa  74.7  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000176566  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  42.52 
 
 
134 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44990  hypothetical protein  41.79 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  42.52 
 
 
134 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3828  hypothetical protein  41.79 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6724  hypothetical protein  39.06 
 
 
132 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  40.91 
 
 
165 aa  73.6  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2291  propanediol utilization protein, PduO  37.12 
 
 
335 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1149  hypothetical protein  50 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.764239  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2125  PduO protein  50 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.288342  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2356  protein of unknown function DUF336  38.1 
 
 
132 aa  72.4  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1589  hypothetical protein  50 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0249  hypothetical protein  50 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.258632  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1963  hypothetical protein  50 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.621473  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1982  hypothetical protein  50 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0687578  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0911  hypothetical protein  50 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.439103  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1348  hypothetical protein  45.83 
 
 
145 aa  72  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.334231 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4361  protein of unknown function DUF336  40.62 
 
 
130 aa  71.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0204741 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1323  hypothetical protein  35.66 
 
 
143 aa  70.5  0.000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.414702  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4099  protein of unknown function DUF336  38.89 
 
 
170 aa  70.1  0.000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  32.59 
 
 
174 aa  70.1  0.000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3764  hypothetical protein  41.35 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3867  hypothetical protein  49 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0962828  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4502  hypothetical protein  49 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5801  hypothetical protein  49 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3414  hypothetical protein  36.84 
 
 
142 aa  69.3  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00846619  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3631  hypothetical protein  40.16 
 
 
159 aa  68.6  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0551  hypothetical protein  37.27 
 
 
144 aa  68.9  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4352  hypothetical protein  40.8 
 
 
159 aa  68.6  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3355  hypothetical protein  38.84 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1276  hypothetical protein  38.28 
 
 
135 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.764768  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6971  hypothetical protein  37.5 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  29.92 
 
 
159 aa  68.6  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4061  hypothetical protein  46.94 
 
 
141 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1583  hypothetical protein  39.84 
 
 
132 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6248  hypothetical protein  39.84 
 
 
132 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.6551 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4093  hypothetical protein  40.74 
 
 
183 aa  67  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305662  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6208  protein of unknown function DUF336  40.74 
 
 
181 aa  67  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.84662  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4308  hypothetical protein  34.35 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08750  hypothetical protein  40.68 
 
 
149 aa  65.5  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  34.38 
 
 
163 aa  65.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3070  hypothetical protein  38.46 
 
 
164 aa  65.1  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4623  protein of unknown function DUF336  45.79 
 
 
150 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3547  protein of unknown function DUF336  45.79 
 
 
150 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.220532  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2276  hypothetical protein  40.74 
 
 
164 aa  64.3  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1678  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  36.36 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3748  hypothetical protein  41.07 
 
 
132 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  37.7 
 
 
135 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1827  hypothetical protein  37.88 
 
 
159 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.200142 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30820  hypothetical protein  37.7 
 
 
133 aa  63.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1129  hypothetical protein  35.88 
 
 
143 aa  62.4  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4567  hypothetical protein  40.94 
 
 
134 aa  62  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0335545 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5688  hypothetical protein  46.67 
 
 
149 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0513  hypothetical protein  34.13 
 
 
154 aa  62.4  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.507115 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1324  hypothetical protein  39.85 
 
 
150 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2015  hypothetical protein  40.18 
 
 
132 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0396  protein of unknown function DUF336  42.55 
 
 
141 aa  61.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296398  normal  0.0672485 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1599  hypothetical protein  37.59 
 
 
146 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0102012  normal  0.595328 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>